RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000457718.5

TNS3-208, Transcript of tensin 3, human

TSL 5

Gene TNS3, Length 3,836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TNS3-208	ENST00000457718	POLL	Q9UGP5	575 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	TCP11X1	B4DZS4	312 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	PPIP5K2	O43314	1243 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	NDUFB10	O96000	172 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	PRLR	P16471	622 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	GAP43	P17677	238 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	ATP5D	P30049	168 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	CDK17	Q00537	523 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	RNF25	Q96BH1	459 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	NT5C1B	Q96P26	610 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	LXN	Q9BS40	222 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	NUP85	Q9BW27	656 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	RASSF10	A6NK89	507 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	PDXK	O00764	312 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	SPAG7	O75391	227 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	GCK	P35557	465 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	NSF	P46459	744 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	PADI6	Q6TGC4	694 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	SLC20A1	Q8WUM9	679 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	BRAF	P15056	766 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	ALDH3A1	P30838	453 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	TRAF1	Q13077	416 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	GIT2	Q14161	759 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	ZNF564	Q8TBZ8	553 aa	Predicted RBP	11.72	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	HAS1	Q92839	578 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	MRC1	P22897	1456 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	HIP1R	O75146	1068 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	COMT	P21964	271 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	GPC5	P78333	572 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	ZNF844	Q08AG5	666 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	TISP43	B9A030	160 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	CD58	P19256	250 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	CAVIN3	Q969G5	261 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	MTMR9	Q96QG7	549 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	TMBIM4	Q9HC24	238 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	ABCC6	O95255	1503 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	KRT19	P08727	400 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	RWDD2B	P57060	319 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	PPP4C	P60510	307 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	DLGAP5	Q15398	846 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	PPP2R5E	Q16537	467 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	KYNU	Q16719	465 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	C6orf118	Q5T5N4	469 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	LIN9	Q5TKA1	542 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	C11orf70	Q9BRQ4	267 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	ERP44	Q9BS26	406 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	INTU	Q9ULD6	942 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	11.71	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	CALCA	P01258	141 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	VAMP7	P51809	220 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	MFAP3	P55082	362 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	KAT2B	Q92831	832 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	AGPAT1	Q99943	283 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	TAS2R14	Q9NYV8	317 aa		11.71	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.53
TNS3-208	ENST00000457718	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		11.71	□□□□□ -0.54
TNS3-208	ENST00000457718	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.54
TNS3-208	ENST00000457718	MSH4	O15457	936 aa		11.71	□□□□□ -0.54
TNS3-208	ENST00000457718	SLC8A1	P32418	973 aa		11.71	□□□□□ -0.54
TNS3-208	ENST00000457718	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	11.71	□□□□□ -0.54

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