RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442447.5

RBM39-215, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 644 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-215ENST00000442447 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
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RBM39-215ENST00000442447 TJAP1Q5JTD0 557 aa18.05■□□□□ 0.48
RBM39-215ENST00000442447 FERMT3Q86UX7 667 aa18.05■□□□□ 0.48
RBM39-215ENST00000442447 CATSPER3Q86XQ3 398 aa18.05■□□□□ 0.48
RBM39-215ENST00000442447 ECHDC2Q86YB7 292 aa18.05■□□□□ 0.48
RBM39-215ENST00000442447 C4orf32Q8N8J7 132 aa18.05■□□□□ 0.48
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RBM39-215ENST00000442447 ASB2Q96Q27 587 aa18.05■□□□□ 0.48
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RBM39-215ENST00000442447 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa18.05■□□□□ 0.48
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RBM39-215ENST00000442447 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
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RBM39-215ENST00000442447 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
RBM39-215ENST00000442447 TMEM117Q9H0C3 514 aa18.03■□□□□ 0.48
RBM39-215ENST00000442447 MINDY3Q9H8M7 445 aa18.03■□□□□ 0.48
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RBM39-215ENST00000442447 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP18.02■□□□□ 0.48
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RBM39-215ENST00000442447 RPA1P27694 616 aa18.02■□□□□ 0.48
RBM39-215ENST00000442447 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP18.02■□□□□ 0.487e-33■■□□□ 11.8
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RBM39-215ENST00000442447 HELQQ8TDG4 1101 aa18■□□□□ 0.47
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RBM39-215ENST00000442447 TRAIPQ9BWF2 469 aa18■□□□□ 0.47
RBM39-215ENST00000442447 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
RBM39-215ENST00000442447 CWH43Q9H720 699 aa18■□□□□ 0.47
RBM39-215ENST00000442447 GPRC5CQ9NQ84 441 aa18■□□□□ 0.47
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RBM39-215ENST00000442447 FAM105AQ9NUU6 356 aa18■□□□□ 0.47
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