RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431413.5

HERC3-206, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 761 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-206ENST00000431413 ZP2Q05996 745 aa16.98■□□□□ 0.31
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HERC3-206ENST00000431413 DRP2Q13474 957 aa16.98■□□□□ 0.31
HERC3-206ENST00000431413 TRIM29Q14134 588 aa16.98■□□□□ 0.31
HERC3-206ENST00000431413 EPHA7Q15375 998 aa16.98■□□□□ 0.31
HERC3-206ENST00000431413 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa16.98■□□□□ 0.31
HERC3-206ENST00000431413 OXER1Q8TDS5 423 aa16.98■□□□□ 0.31
HERC3-206ENST00000431413 GTF3C6Q969F1 213 aa16.98■□□□□ 0.31
HERC3-206ENST00000431413 CEP170P1Q96L14 293 aa16.98■□□□□ 0.31
HERC3-206ENST00000431413 ZNF558Q96NG5 402 aa16.98■□□□□ 0.31
HERC3-206ENST00000431413 CEP89Q96ST8 783 aa16.98■□□□□ 0.31
HERC3-206ENST00000431413 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
HERC3-206ENST00000431413 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
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HERC3-206ENST00000431413 CWH43Q9H720 699 aa16.98■□□□□ 0.31
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HERC3-206ENST00000431413 LINC01565O15544 149 aa16.97■□□□□ 0.31
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HERC3-206ENST00000431413 PLA2G4FQ68DD2 849 aa16.97■□□□□ 0.31
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HERC3-206ENST00000431413 C4orf19Q8IY42 314 aa16.97■□□□□ 0.31
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HERC3-206ENST00000431413 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
HERC3-206ENST00000431413 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP16.97■□□□□ 0.318e-11■■■■■ 33.2
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HERC3-206ENST00000431413 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
HERC3-206ENST00000431413 NCAPH2Q6IBW4 605 aa16.96■□□□□ 0.31
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HERC3-206ENST00000431413 HELQQ8TDG4 1101 aa16.96■□□□□ 0.31
HERC3-206ENST00000431413 HAS1Q92839 578 aa16.96■□□□□ 0.31
HERC3-206ENST00000431413 LXNQ9BS40 222 aa16.96■□□□□ 0.31
HERC3-206ENST00000431413 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa16.96■□□□□ 0.31
HERC3-206ENST00000431413 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa16.96■□□□□ 0.31
HERC3-206ENST00000431413 SPG21Q9NZD8 308 aa16.96■□□□□ 0.31
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HERC3-206ENST00000431413 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
HERC3-206ENST00000431413 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa16.96■□□□□ 0.31
HERC3-206ENST00000431413 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa16.96■□□□□ 0.31
HERC3-206ENST00000431413 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
HERC3-206ENST00000431413 C19orf67A6NJJ6 358 aa16.95■□□□□ 0.3
HERC3-206ENST00000431413 DCXO43602 365 aa16.95■□□□□ 0.3
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HERC3-206ENST00000431413 NR5A1Q13285 461 aa16.95■□□□□ 0.3
HERC3-206ENST00000431413 CLLU1OSQ5K130 101 aa16.95■□□□□ 0.3
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HERC3-206ENST00000431413 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
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HERC3-206ENST00000431413 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
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HERC3-206ENST00000431413 TCF25Q9BQ70 676 aa16.95■□□□□ 0.3
HERC3-206ENST00000431413 RNF19AQ9NV58 838 aa16.95■□□□□ 0.3
HERC3-206ENST00000431413 PCDHA12Q9UN75 941 aa16.95■□□□□ 0.3
HERC3-206ENST00000431413 WDR81Q562E7 1941 aa16.95■□□□□ 0.3
HERC3-206ENST00000431413 KIAA1671Q9BY89 1806 aa16.94■□□□□ 0.3
HERC3-206ENST00000431413 FSCN2O14926 492 aa16.94■□□□□ 0.3
HERC3-206ENST00000431413 PER2O15055 1255 aa16.94■□□□□ 0.3
HERC3-206ENST00000431413 ASAP2O43150 1006 aa16.94■□□□□ 0.3
HERC3-206ENST00000431413 CALCRLQ16602 461 aa16.94■□□□□ 0.3
HERC3-206ENST00000431413 DUSP6Q16828 381 aa16.94■□□□□ 0.3
HERC3-206ENST00000431413 XKR9Q5GH70 373 aa16.94■□□□□ 0.3
HERC3-206ENST00000431413 GLB1LQ6UWU2 654 aa16.94■□□□□ 0.3
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HERC3-206ENST00000431413 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa16.94■□□□□ 0.3
HERC3-206ENST00000431413 SMRP1Q8NCR6 262 aa16.94■□□□□ 0.3
HERC3-206ENST00000431413 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
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HERC3-206ENST00000431413 PGBD4Q96DM1 585 aa16.94■□□□□ 0.3
HERC3-206ENST00000431413 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
HERC3-206ENST00000431413 CLEC1BQ9P126 229 aa16.94■□□□□ 0.3
HERC3-206ENST00000431413 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa16.94■□□□□ 0.3
HERC3-206ENST00000431413 PRR33A8MZF0 331 aa16.93■□□□□ 0.3
HERC3-206ENST00000431413 DTNBO60941 627 aa16.93■□□□□ 0.3
HERC3-206ENST00000431413 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP16.93■□□□□ 0.3
HERC3-206ENST00000431413 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
HERC3-206ENST00000431413 PLPP4Q5VZY2 271 aa16.93■□□□□ 0.3
HERC3-206ENST00000431413 KSR1Q8IVT5 923 aa16.93■□□□□ 0.3
HERC3-206ENST00000431413 TPH2Q8IWU9 490 aa16.93■□□□□ 0.3
HERC3-206ENST00000431413 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
HERC3-206ENST00000431413 TNFRSF25Q93038 417 aa16.93■□□□□ 0.3
HERC3-206ENST00000431413 DYDC2Q96IM9 177 aa16.93■□□□□ 0.3
HERC3-206ENST00000431413 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
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