RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419593.5

SYS1-DBNDD2-201, Transcript of SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2

Gene SYS1-DBNDD2, Length 1,313 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 RIPOR3Q96MK2 946 aa18.54■□□□□ 0.56
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 FAM86C1Q9NVL1 165 aa18.54■□□□□ 0.56
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa18.54■□□□□ 0.56
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 MYO10Q9HD67 2058 aa18.54■□□□□ 0.56
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 CACNA1HO95180 2353 aa18.54■□□□□ 0.56
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 C2orf71A6NGG8 1288 aa18.53■□□□□ 0.56
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 WDR64B1ANS9 1081 aa18.53■□□□□ 0.56
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 EOMESO95936 686 aa18.53■□□□□ 0.56
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 OATP04181 439 aa18.53■□□□□ 0.56
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 DARSP14868 501 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 FGFR4P22455 802 aa18.53■□□□□ 0.56
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 GNA11P29992 359 aa18.53■□□□□ 0.56
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 GPC3P51654 580 aa18.53■□□□□ 0.56
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 ANKRD1Q15327 319 aa18.53■□□□□ 0.56
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 CES5AQ6NT32 575 aa18.53■□□□□ 0.56
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 KREMEN2Q8NCW0 462 aa18.53■□□□□ 0.56
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 LENG9Q96B70 501 aa18.53■□□□□ 0.56
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 ADAM7Q9H2U9 754 aa18.53■□□□□ 0.56
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 POMKQ9H5K3 350 aa18.53■□□□□ 0.56
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 DISC1Q9NRI5 854 aa18.53■□□□□ 0.56
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 LARGE1O95461 756 aa18.52■□□□□ 0.56
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 FGD1P98174 961 aa18.52■□□□□ 0.56
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 ITIH3Q06033 890 aa18.52■□□□□ 0.56
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 HELQQ8TDG4 1101 aa18.52■□□□□ 0.56
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 SCLT1Q96NL6 688 aa18.52■□□□□ 0.56
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa18.52■□□□□ 0.56
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 WDR81Q562E7 1941 aa18.52■□□□□ 0.56
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 C2CD4DB7Z1M9 353 aa18.51■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa18.51■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 EDIL3O43854 480 aa18.51■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 CXCL14O95715 111 aa18.51■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 BCAR1P56945 870 aa18.51■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 PRKCEQ02156 737 aa18.51■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 NBR1Q14596 966 aa18.51■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 UGCGQ16739 394 aa18.51■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 NLRP7Q8WX94 980 aa18.51■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 NECTIN4Q96NY8 510 aa18.51■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 DACT1Q9NYF0 836 aa18.51■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 H0Y858 1186 aa18.5■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 MSH4O15457 936 aa18.5■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 GFRA3O60609 400 aa18.5■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 CA8P35219 290 aa18.5■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa18.5■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 MTMR3Q13615 1198 aa18.5■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 UBALD2Q8IYN6 164 aa18.5■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 BICD2Q8TD16 824 aa18.5■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 PHKBQ93100 1093 aa18.5■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 TPCN1Q9ULQ1 816 aa18.5■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 SORCS3Q9UPU3 1222 aa18.5■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 CHMP2AO43633 222 aa18.49■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 BRD1O95696 1058 aa18.49■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 WEE2P0C1S8 567 aa18.49■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 NUBP1P53384 320 aa18.49■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 NUCB2P80303 420 aa18.49■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 ST3GAL1Q11201 340 aa18.49■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 DRP2Q13474 957 aa18.49■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 Q6ZUG5 572 aa18.49■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 VPS52Q8N1B4 723 aa18.49■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 BRF1Q92994 677 aa18.49■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 TMEM169Q96HH4 297 aa18.49■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 RIT2Q99578 217 aa18.49■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 CHST12Q9NRB3 414 aa18.49■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 GAS7O60861 476 aa18.49■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 SFNP31947 248 aa18.49■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 MTHFRP42898 656 aa18.49■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 USP11P51784 963 aa18.49■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 JAK3P52333 1124 aa18.49■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 SLC5A5Q92911 643 aa18.49■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 GJA10Q969M2 543 aa18.49■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 AGXT2Q9BYV1 514 aa18.49■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 UNC45AQ9H3U1 944 aa18.49■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 PHKA2P46019 1235 aa18.48■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 CDC42EP1Q00587 391 aa18.48■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 NTRK3Q16288 839 aa18.48■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 ME3Q16798 604 aa18.48■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 LRCH2Q5VUJ6 765 aa18.48■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 KANK3Q6NY19 840 aa18.48■□□□□ 0.55
SYS1-DBNDD2-201ENST00000419593 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms