RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 GPC3P51654 580 aa21.67■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 CEP55Q53EZ4 464 aa21.67■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 SLC8A2Q9UPR5 921 aa21.67■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 KIF28PB7ZC32 967 aa21.66■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa21.66■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 STAG2Q8N3U4 1231 aa21.66■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 SPDL1Q96EA4 605 aa21.66■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 SDC4P31431 198 aa21.66■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 SPARCL1Q14515 664 aa21.66■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 PASD1Q8IV76 773 aa21.66■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 NRKQ7Z2Y5 1582 aa21.66■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa21.66■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 NR1H3Q13133 447 aa21.66■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 NFKBIAP25963 317 aa21.65■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa21.65■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa21.65■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa21.65■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa21.65■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 TSPOAP1O95153 1857 aa21.65■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 MYL3P08590 195 aa21.65■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 MORC4Q8TE76 937 aa21.65■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 GLI2P10070 1586 aa21.65■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 EYA4O95677 639 aa21.65■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC144BQ3MJ40 725 aa21.65■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 TTC25Q96NG3 672 aa21.65■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 STAP1Q9ULZ2 295 aa21.65■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 SPDYE2BA6NHP3 402 aa21.65■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 CHEK2O96017 543 aa21.65■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 FTLP02792 175 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 SPDYE6P0CI01 402 aa21.65■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 TRIM72Q6ZMU5 477 aa21.65■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 LDHDQ86WU2 507 aa21.65■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 OSBPL9Q96SU4 736 aa21.65■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 CLTCL1P53675 1640 aa21.65■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 KRT7P08729 469 aa21.64■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 COPB2P35606 906 aa21.64■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 HAUS6Q7Z4H7 955 aa21.64■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 PFASO15067 1338 aa21.64■■□□□ 1.06
CCSAP-203ENST00000366687 MAPK13O15264 365 aa21.64■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 CHMP6Q96FZ7 201 aa21.64■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 PDLIM2Q96JY6 352 aa21.64■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 PITPNM3Q9BZ71 974 aa21.64■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 FIS1Q9Y3D6 152 aa21.64■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 COPEO14579 308 aa21.64■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 PAMP19021 973 aa21.64■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 GCKP35557 465 aa21.64■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 SBK1Q52WX2 424 aa21.64■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 PARD3BQ8TEW8 1205 aa21.64■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 GCNAQ96QF7 691 aa21.64■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 TRIM9Q9C026 710 aa21.64■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 CYP26B1Q9NR63 512 aa21.64■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 FRMD5Q7Z6J6 570 aa21.64■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 RHPN2Q8IUC4 686 aa21.64■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa21.63■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 PDXKO00764 312 aa21.63■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 ART3Q13508 389 aa21.63■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 NUP85Q9BW27 656 aa21.63■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 MTMR4Q9NYA4 1195 aa21.63■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 CHRNA3P32297 505 aa21.63■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 GUCY1A2P33402 732 aa21.63■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 CRLF3Q8IUI8 442 aa21.63■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 FBXL13Q8NEE6 735 aa21.63■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 HEY1Q9Y5J3 304 aa21.63■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 LAMC1P11047 1609 aa21.63■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 GNGT2O14610 69 aa21.63■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 GNA15P30679 374 aa21.63■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 SLC12A1Q13621 1099 aa21.63■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 FBXO41Q8TF61 875 aa21.63■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 LRRC7Q96NW7 1537 aa21.63■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 GRID2IPA4D2P6 1211 aa21.63■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 FOXN1O15353 648 aa21.63■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 AP3M2P53677 418 aa21.63■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 TRIM67Q6ZTA4 783 aa21.63■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 NDUFAF2Q8N183 169 aa21.63■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 CRAMP1Q96RY5 1269 aa21.63■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 CLGNO14967 610 aa21.62■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 SOX5P35711 763 aa21.62■■□□□ 1.05
CCSAP-203ENST00000366687 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms