RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356331.9

SH3BP2-201, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-201ENST00000356331 L2HGDHQ9H9P8 463 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 USH1GQ495M9 461 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM161BQ96MY7 647 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 KIAA1586Q9HCI6 787 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 PHF8Q9UPP1 1060 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 ACEP12821 1306 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 PALMO75781 387 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 ADAM9Q13443 819 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 ADCK1Q86TW2 530 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 LPIN2Q92539 896 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 BTBD6Q96KE9 485 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 GCNT4Q9P109 453 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 DDIT3P35638 169 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 PMS2P54278 862 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 TPH2Q8IWU9 490 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 CHURC1Q8WUH1 139 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 PHF21AQ96BD5 680 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 WNT8AQ9H1J5 351 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 LZTS1Q9Y250 596 aa11.3□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 CHL1O00533 1208 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 CYP27A1Q02318 531 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 DSG1Q02413 1049 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 TRAF7Q6Q0C0 670 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 ARMCX6Q7L4S7 300 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 P2RX5Q93086 422 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 KRT14P02533 472 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 FGGP02679 453 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 ITIH4Q14624 930 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 SCYL2Q6P3W7 929 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 H7C0C1 242 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 CFLARO15519 480 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 CAND2O75155 1236 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 KRT7P08729 469 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 ATP5OP48047 213 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 DAB2P98082 770 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 SPATA21Q7Z572 469 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 DEPTORQ8TB45 409 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM245Q9H330 911 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 CEP72Q9P209 647 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 XAGE2Q96GT9 111 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 FUT8Q9BYC5 575 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 FCGR1AP12314 374 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 LIG4P49917 911 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 TMPRSS15P98073 1019 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 ASPRV1Q53RT3 343 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 HIPK4Q8NE63 616 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 RFWD2Q8NHY2 731 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 SNF8Q96H20 258 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 UBN1Q9NPG3 1134 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 EPS8Q12929 822 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 TNFAIP1Q13829 316 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM26FQ5R3K3 315 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 PCDHA12Q9UN75 941 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 FIS1Q9Y3D6 152 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 ADAMTS2O95450 1211 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 RXRGP48443 463 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 TAB1Q15750 504 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 KCTD17Q8N5Z5 321 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 SPATA4Q8NEY3 305 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 MYH1P12882 1939 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 MYH2Q9UKX2 1941 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 MYH4Q9Y623 1939 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 SH3TC1Q8TE82 1336 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM25AB3EWG3 89 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM25CB3EWG5 89 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM25GB3EWG6 89 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 NFRKBQ6P4R8 1299 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 MIEF2Q96C03 454 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 CARD9Q9H257 536 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC39A2Q9NP94 309 aa11.29□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 K7ENM7 598 aa11.28□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 VHLP40337 213 aa11.28□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM160B1Q5W0V3 765 aa11.28□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 RFX6Q8HWS3 928 aa11.28□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 DBNDD2Q9BQY9 259 aa11.28□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP11.28□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 ABCA9Q8IUA7 1624 aa11.28□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 ATP7BP35670 1465 aa11.28□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 MAGEA13PA6NCF6 341 aa11.28□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 SCTRP47872 440 aa11.28□□□□□ -0.6
SH3BP2-201ENST00000356331 ITKQ08881 620 aa11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms