RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 COX16Q9P0S2 106 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 MYH7P12883 1935 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 CHD4Q14839 1912 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 MYH2Q9UKX2 1941 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 GOLGA8IPA6NC78 632 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 GOLGA8JA6NMD2 632 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 CETN3O15182 167 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 DGAT1O75907 488 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 CDC27P30260 824 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 AMPD2Q01433 879 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 LRRC26Q2I0M4 334 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 SDE2Q6IQ49 451 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 MFSD5Q6N075 450 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 TMC5Q6UXY8 1006 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 MTA3Q9BTC8 594 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 LMCD1Q9NZU5 365 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 THEGQ9P2T0 379 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 RWDD3Q9Y3V2 267 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 QSER1Q2KHR3 1735 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 CASTOR2A6NHX0 329 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 STXBP3O00186 592 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 CKMP06732 381 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 MMP3P08254 477 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 SPATA31D3P0C874 917 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 EPB41P11171 864 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 CAPN2P17655 700 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 CYP27A1Q02318 531 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 LRMPQ12912 555 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC149Q6ZUS6 474 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 GPIHBP1Q8IV16 184 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 MSANTD4Q8NCY6 345 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 RNF139Q8WU17 664 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 RIPOR3Q96MK2 946 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 RAD9AQ99638 391 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 AGXT2Q9BYV1 514 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 GJB4Q9NTQ9 266 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 CASZ1Q86V15 1759 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 PER2O15055 1255 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 F13A1P00488 732 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 ADH1AP07327 375 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 PFKMP08237 780 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 UBXN2BQ14CS0 331 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 EMC2Q15006 297 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 TIGD5Q53EQ6 642 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 SAMD3Q8N6K7 520 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 HELQQ8TDG4 1101 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 RABGGTAQ92696 567 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 SLC9A7Q96T83 725 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 LRRC4Q9HBW1 653 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 RMND1Q9NWS8 449 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 RFXAPO00287 272 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 NCAM2O15394 837 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 TIMP1P01033 207 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 EFNA5P52803 228 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 JAG1P78504 1218 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 GABPAQ06546 454 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 GOLGA8FQ08AF8 430 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 NR1H3Q13133 447 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 SEC23AQ15436 765 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF618Q5T7W0 954 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 APPL2Q8NEU8 664 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 HLA-CQ95604 372 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 GAD1Q99259 594 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 RSAD1Q9HA92 442 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 RNF19AQ9NV58 838 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 PADI3Q9ULW8 664 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 SLC8A2Q9UPR5 921 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 SPTA1P02549 2419 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 THP07101 528 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 FGRP09769 529 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 LAG3P18627 525 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 WEE1P30291 646 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 KRT9P35527 623 aa4.84□□□□□ -1.63
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