RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 ADH1AP07327 375 aa8.93□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 PBX3P40426 434 aa8.93□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 RAB27AP51159 221 aa8.93□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 DSC3Q14574 896 aa8.93□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 PPP2R5DQ14738 602 aa8.93□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 C20orf194Q5TEA3 1177 aa8.93□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa8.93□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 CASC1Q6TDU7 716 aa8.93□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 LRRC55Q6ZSA7 311 aa8.93□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
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PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM40Q8WWA1 233 aa8.93□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 PHKBQ93100 1093 aa8.93□□□□□ -0.98
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PGGT1B-201ENST00000296642 ZBTB10Q96DT7 871 aa8.93□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 PCYT2Q99447 389 aa8.93□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
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PGGT1B-201ENST00000296642 HCSTQ9UBK5 93 aa8.93□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 CDH22Q9UJ99 828 aa8.93□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 TELO2Q9Y4R8 837 aa8.93□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 MYO15AQ9UKN7 3530 aa8.93□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC69A6NI79 296 aa8.92□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa8.92□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa8.92□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 TBC1D4O60343 1298 aa8.92□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 NR1I2O75469 434 aa8.92□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 ATG7O95352 703 aa8.92□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 URODP06132 367 aa8.92□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 DCNP07585 359 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 PFKPQ01813 784 aa8.92□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 CEP55Q53EZ4 464 aa8.92□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 NFXL1Q6ZNB6 911 aa8.92□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 HELQQ8TDG4 1101 aa8.92□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC22A17Q8WUG5 538 aa8.92□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 RUFY2Q8WXA3 655 aa8.92□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 IGSF21Q96ID5 467 aa8.92□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 MTA3Q9BTC8 594 aa8.92□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 NRBP2Q9NSY0 501 aa8.92□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 TBC1D22BQ9NU19 505 aa8.92□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 KANSL3Q9P2N6 904 aa8.92□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 EPS15L1Q9UBC2 864 aa8.92□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 USP18Q9UMW8 372 aa8.92□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 CLUHO75153 1309 aa8.91□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa8.91□□□□□ -0.98
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PGGT1B-201ENST00000296642 GPR32O75388 356 aa8.91□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 C22orf31O95567 290 aa8.91□□□□□ -0.98
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PGGT1B-201ENST00000296642 VTNP04004 478 aa8.91□□□□□ -0.98
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PGGT1B-201ENST00000296642 PSAPP07602 524 aa8.91□□□□□ -0.98
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PGGT1B-201ENST00000296642 DNM2P50570 870 aa8.91□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 CLCN4P51793 760 aa8.91□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 NRLP54845 237 aa8.91□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 PRKCQQ04759 706 aa8.91□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 SWSAP1Q6NVH7 229 aa8.91□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 EFCAB12Q6NXP0 572 aa8.91□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa8.91□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 CYB5R4Q7L1T6 521 aa8.91□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 NIPA1Q7RTP0 329 aa8.91□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC44A3Q8N4M1 653 aa8.91□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 DCLK2Q8N568 766 aa8.91□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 SUMF1Q8NBK3 374 aa8.91□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 PJA1Q8NG27 643 aa8.91□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 GPR152Q8TDT2 470 aa8.91□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 HDAC7Q8WUI4 952 aa8.91□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 NLRP7Q8WX94 980 aa8.91□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 KLHL5Q96PQ7 755 aa8.91□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 PPP1R16BQ96T49 567 aa8.91□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 NELL2Q99435 816 aa8.91□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 OSBPL6Q9BZF3 934 aa8.91□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa8.91□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 CDHR5Q9HBB8 845 aa8.91□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa8.91□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa8.91□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa8.9□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 KANSL1LA0AUZ9 987 aa8.9□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 hCG_1984214I3L0E3 225 aa8.9□□□□□ -0.98
PGGT1B-201ENST00000296642 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
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