RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 GSG1L2A8MUP6 293 aa9.65□□□□□ -0.86
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PTPRB-201ENST00000261266 CCT5P48643 541 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRB-201ENST00000261266 NOP14P78316 857 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
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PTPRB-201ENST00000261266 FAM83BQ5T0W9 1011 aa9.64□□□□□ -0.87
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PTPRB-201ENST00000261266 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-201ENST00000261266 FAF2Q96CS3 445 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-201ENST00000261266 RIT2Q99578 217 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-201ENST00000261266 TTLL3Q9Y4R7 772 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRB-201ENST00000261266 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-201ENST00000261266 TXNDC9O14530 226 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-201ENST00000261266 ELF1P32519 619 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-201ENST00000261266 GPSM2P81274 684 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRB-201ENST00000261266 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
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