RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259365.8

TMOD1-201, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,343 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-201ENST00000259365 CYP26A1O43174 497 aa14.49□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 TGFB1I1O43294 461 aa14.49□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 EDRF1Q3B7T1 1238 aa14.49□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 BARGINQ6ZT62 677 aa14.49□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 ALG3Q92685 438 aa14.49□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 COA1Q9GZY4 146 aa14.49□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 SOX10P56693 466 aa14.49□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 FAM182AQ5T1J6 154 aa14.49□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 CCDC13Q8IYE1 715 aa14.49□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 KCNMB3Q9NPA1 279 aa14.49□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa14.48□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 OPLAHO14841 1288 aa14.48□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 MMEP08473 750 aa14.48□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 HARSP12081 509 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 NF2P35240 595 aa14.48□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 CUL1Q13616 776 aa14.48□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 TNIP1Q15025 636 aa14.48□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 SPRED3Q2MJR0 410 aa14.48□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 SEPT14Q6ZU15 432 aa14.48□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 SEC16BQ96JE7 1060 aa14.48□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 PWWP2AQ96N64 755 aa14.48□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 CBWD1Q9BRT8 395 aa14.48□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 PRR12Q9ULL5 1215 aa14.48□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 STK38LQ9Y2H1 464 aa14.48□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 BCORQ6W2J9 1755 aa14.48□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 A0A1W2PRG0 241 aa14.48□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 SLC16A4O15374 487 aa14.48□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 RAD17O75943 681 aa14.48□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 CHN1P15882 459 aa14.48□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 PDE6BP35913 854 aa14.48□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 ITIH3Q06033 890 aa14.48□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 MCTP2Q6DN12 878 aa14.48□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 PSMD1Q99460 953 aa14.48□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 F8VZ95 297 aa14.48□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 HIP1RO75146 1068 aa14.48□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 SLITRK3O94933 977 aa14.48□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 FAM107AO95990 144 aa14.48□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 SMARCA1P28370 1054 aa14.48□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 CLK2P49760 499 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 PEX3P56589 373 aa14.48□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 SLC20A2Q08357 652 aa14.48□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 CETN1Q12798 172 aa14.48□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 SEMA3FQ13275 785 aa14.48□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 AOC3Q16853 763 aa14.48□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 LONRF1Q17RB8 773 aa14.48□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 FAM102BQ5T8I3 360 aa14.48□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa14.48□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 LLGL2Q6P1M3 1020 aa14.48□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 GIMAP7Q8NHV1 300 aa14.48□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 ATG4AQ8WYN0 398 aa14.48□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 LXNQ9BS40 222 aa14.48□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 PI4K2AQ9BTU6 479 aa14.48□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 ROBO3Q96MS0 1386 aa14.48□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 DOT1LQ8TEK3 1739 aa14.47□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa14.47□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 ETNPPLQ8TBG4 499 aa14.47□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 SHANK3Q9BYB0 1731 aa14.47□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 SGPL1O95470 568 aa14.47□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 LMNB1P20700 586 aa14.47□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 CHRNA5P30532 468 aa14.47□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 PMS2P54278 862 aa14.47□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 SKOR1P84550 965 aa14.47□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 DGKZQ13574 1117 aa14.47□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 SEL1L2Q5TEA6 688 aa14.47□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 KCNV1Q6PIU1 500 aa14.47□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa14.47□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 TMC3Q7Z5M5 1100 aa14.47□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 PRUNE1Q86TP1 453 aa14.47□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 LRRC57Q8N9N7 239 aa14.47□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 SCFD2Q8WU76 684 aa14.47□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 CCDC17Q96LX7 622 aa14.47□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 COG5Q9UP83 839 aa14.47□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 EYA4O95677 639 aa14.46□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 MMP10P09238 476 aa14.46□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 POLR2MP0CAP2 368 aa14.46□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 SNHG28P0DPA3 235 aa14.46□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 ALAS1P13196 640 aa14.46□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 COMTP21964 271 aa14.46□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 MIER3Q7Z3K6 550 aa14.46□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 JAMLQ86YT9 394 aa14.46□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 ARHGEF19Q8IW93 802 aa14.46□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 SEPT12Q8IYM1 358 aa14.46□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 RFFLQ8WZ73 363 aa14.46□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 BICD1Q96G01 975 aa14.46□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 WDR18Q9BV38 432 aa14.46□□□□□ -0.09
TMOD1-201ENST00000259365 RAB17Q9H0T7 212 aa14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms