RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021380.9

Trappc6b-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trappc6b, Length 1,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Smarca1Q6PGB8 1046 aa25.16■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Znf689Q8BKK5 500 aa25.16■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Unc93b1Q8VCW4 598 aa25.16■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Adam33Q923W9 797 aa25.16■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ccer1Q9CQL2 403 aa25.16■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ralgapa2A3KGS3 1872 aa25.15■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fam209A2APA5 170 aa25.15■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ccdc152E9PX14 254 aa25.15■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dcpp3L7N259 170 aa25.15■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Krt18P05784 423 aa25.15■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zbtb8osQ505B7 168 aa25.15■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Vps72Q62481 368 aa25.15■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Git1Q68FF6 770 aa25.15■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 IgflQ6B9Z0 140 aa25.15■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tdrd7Q8K1H1 1086 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tnpo2Q99LG2 887 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Yeats4Q9CR11 227 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Hcn4O70507 1186 aa25.14■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Smpd2O70572 419 aa25.14■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sptlc2P97363 560 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sppl2bQ3TD49 578 aa25.14■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tmem220Q8BP07 167 aa25.14■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 DpydQ8CHR6 1025 aa25.14■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 B3galt6Q91Z92 325 aa25.14■■□□□ 1.62
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tpd52l1O54818 204 aa25.13■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cd68P31996 326 aa25.13■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ift122Q6NWV3 1182 aa25.13■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mbtd1Q6P5G3 631 aa25.13■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cyth4Q80YW0 393 aa25.13■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Capns2Q9D7J7 247 aa25.13■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Krt85Q9Z2T6 507 aa25.13■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Catsper2A2ARP9 588 aa25.12■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zfp882E9Q4R4 555 aa25.12■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cyp17a1P27786 507 aa25.12■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 DsppP97399 934 aa25.12■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 DeptorQ570Y9 409 aa25.12■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Klra7Q60654 280 aa25.12■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ehd2Q8BH64 543 aa25.12■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Olfr390Q8VEZ7 311 aa25.12■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Atg13Q91YI1 516 aa25.12■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Slc12a9Q99MR3 914 aa25.12■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Oaz3Q9R109 243 aa25.12■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Myo5aQ99104 1853 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Myh11O08638 1972 aa25.11■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Vmn2r17E9PYF5 849 aa25.11■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm6583E9Q8Z1 469 aa25.11■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Anp32aO35381 247 aa25.11■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 CcnoP0C242 352 aa25.11■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kiaa1468Q148V7 1216 aa25.11■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 IqcgQ80W32 419 aa25.11■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Haus7Q8BKT8 364 aa25.11■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tceal5Q8CCT4 200 aa25.11■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pramel1Q99MW3 458 aa25.11■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Micu3Q9CTY5 523 aa25.11■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Smyd3Q9CWR2 428 aa25.11■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 B4galt4Q9JJ04 344 aa25.11■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Acot9Q9R0X4 439 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kng1O08677 661 aa25.1■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pgk1P09411 417 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 ChgaP26339 463 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rplp2P99027 115 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tgfbrap1Q3UR70 860 aa25.1■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cacna2d4Q5RJF7 1116 aa25.1■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Usp49Q6P9L4 685 aa25.1■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Map3k11Q80XI6 850 aa25.1■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pan2Q8BGF7 1200 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 TriobpQ99KW3 2014 aa25.1■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1700018F24RikB2RW27 314 aa25.09■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Vmn2r78K7N6U5 853 aa25.09■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Efna5O08543 228 aa25.09■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Rasa2P58069 847 aa25.09■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Enpp3Q6DYE8 874 aa25.09■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fhod1Q6P9Q4 1197 aa25.09■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 HomezQ80W88 542 aa25.09■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zdhhc14Q8BQQ1 489 aa25.09■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Abi1Q8CBW3 481 aa25.09■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kiaa0391Q8JZY4 584 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mtmr3Q8K296 1196 aa25.09■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Kri1Q8VDQ9 704 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fbxo17Q9QZM8 286 aa25.09■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Malrd1A2AJX4 2123 aa25.08■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Vmn2r71L7N2D8 855 aa25.08■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cxcl12P40224 93 aa25.08■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zdhhc9P59268 364 aa25.08■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nat8lQ3UGX3 299 aa25.08■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cd180Q62192 661 aa25.08■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 PtprcapQ64697 197 aa25.08■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 RragbQ6NTA4 374 aa25.08■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Nap1l3Q794H2 544 aa25.08■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tor4aQ8BH02 426 aa25.08■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tmem117Q8BH18 514 aa25.08■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fbxl5Q8C2S5 690 aa25.08■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 KyQ8C8H8 661 aa25.08■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 TraipQ8VIG6 470 aa25.08■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 TheglQ9DA15 459 aa25.08■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 CtsfQ9R013 462 aa25.08■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Taf1Q80UV9 1891 aa25.08■■□□□ 1.61
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Baz2aQ91YE5 1889 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pramel3A2AHA7 463 aa25.07■■□□□ 1.6
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm7903A2AWL1 463 aa25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 20 ms