Protein–RNA interactions for Protein: A3KGS3

Ralgapa2, Ral GTPase-activating protein subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ralgapa2A3KGS3 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC41.7■■■■■ 4.27
Ralgapa2A3KGS3 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Ralgapa2A3KGS3 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Ralgapa2A3KGS3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
Ralgapa2A3KGS3 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Ralgapa2A3KGS3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36.26■■■■□ 3.39
Ralgapa2A3KGS3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36.07■■■■□ 3.37
Ralgapa2A3KGS3 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Ralgapa2A3KGS3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Ralgapa2A3KGS3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Ralgapa2A3KGS3 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Ralgapa2A3KGS3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Ralgapa2A3KGS3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
Ralgapa2A3KGS3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Ralgapa2A3KGS3 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Ralgapa2A3KGS3 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
Ralgapa2A3KGS3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Ralgapa2A3KGS3 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Ralgapa2A3KGS3 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ralgapa2A3KGS3 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ralgapa2A3KGS3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
Ralgapa2A3KGS3 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Ralgapa2A3KGS3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Ralgapa2A3KGS3 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Ralgapa2A3KGS3 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Ralgapa2A3KGS3 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
Ralgapa2A3KGS3 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ralgapa2A3KGS3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ralgapa2A3KGS3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ralgapa2A3KGS3 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Ralgapa2A3KGS3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ralgapa2A3KGS3 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Ralgapa2A3KGS3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Ralgapa2A3KGS3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ralgapa2A3KGS3 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Ralgapa2A3KGS3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
Ralgapa2A3KGS3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Ralgapa2A3KGS3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ralgapa2A3KGS3 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Ralgapa2A3KGS3 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Ralgapa2A3KGS3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Ralgapa2A3KGS3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Ralgapa2A3KGS3 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Ralgapa2A3KGS3 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Ralgapa2A3KGS3 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ralgapa2A3KGS3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ralgapa2A3KGS3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Ralgapa2A3KGS3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Ralgapa2A3KGS3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Ralgapa2A3KGS3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Ralgapa2A3KGS3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Ralgapa2A3KGS3 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Ralgapa2A3KGS3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Ralgapa2A3KGS3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Ralgapa2A3KGS3 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Ralgapa2A3KGS3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Ralgapa2A3KGS3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Ralgapa2A3KGS3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ralgapa2A3KGS3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Ralgapa2A3KGS3 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ralgapa2A3KGS3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ralgapa2A3KGS3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ralgapa2A3KGS3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Ralgapa2A3KGS3 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ralgapa2A3KGS3 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ralgapa2A3KGS3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
Ralgapa2A3KGS3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ralgapa2A3KGS3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ralgapa2A3KGS3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ralgapa2A3KGS3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
Ralgapa2A3KGS3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
Ralgapa2A3KGS3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ralgapa2A3KGS3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ralgapa2A3KGS3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ralgapa2A3KGS3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ralgapa2A3KGS3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Ralgapa2A3KGS3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ralgapa2A3KGS3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ralgapa2A3KGS3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Ralgapa2A3KGS3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Ralgapa2A3KGS3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ralgapa2A3KGS3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
Ralgapa2A3KGS3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Ralgapa2A3KGS3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30.89■■■□□ 2.53
Ralgapa2A3KGS3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ralgapa2A3KGS3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
Ralgapa2A3KGS3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ralgapa2A3KGS3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ralgapa2A3KGS3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.53
Ralgapa2A3KGS3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ralgapa2A3KGS3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ralgapa2A3KGS3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Ralgapa2A3KGS3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ralgapa2A3KGS3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ralgapa2A3KGS3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Ralgapa2A3KGS3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Ralgapa2A3KGS3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Ralgapa2A3KGS3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Ralgapa2A3KGS3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ralgapa2A3KGS3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms