RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000008088.8

Ttc9b-201, Transcript of Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ttc9b, Length 2,052 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Oog4Q4G0C7 502 aa21.49■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cyp3a11Q64459 504 aa21.49■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Styk1Q6J9G1 429 aa21.49■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Senp5Q6NXL6 749 aa21.49■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Iws1Q8C1D8 766 aa21.49■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fam187aQ9D3R5 417 aa21.49■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ngly1Q9JI78 651 aa21.49■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 EmcnQ9R0H2 261 aa21.49■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Eif2ak3Q9Z2B5 1114 aa21.49■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 RptorQ8K4Q0 1335 aa21.49■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Abcb11Q9QY30 1321 aa21.49■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Arhgef10lA2AWP8 1280 aa21.49■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Polr2fP61219 127 aa21.49■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ddx49Q4FZF3 480 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 ItgaeQ60677 1167 aa21.49■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ireb2Q811J3 963 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Igf2bp3Q9CPN8 579 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ergic2Q9CR89 377 aa21.49■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 IydQ9DCX8 285 aa21.49■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tcp10bE9PYJ0 438 aa21.48■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Serpinb6bO08804 377 aa21.48■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Trim43aQ3TL54 445 aa21.48■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tmem63bQ3TWI9 832 aa21.48■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Adgre1Q61549 931 aa21.48■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ncapg2Q6DFV1 1138 aa21.48■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Sgip1Q8VD37 806 aa21.48■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Polr3fQ921X6 316 aa21.48■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mov10l1Q99MV5 1187 aa21.48■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pcdh15Q99PJ1 1943 aa21.48■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm28919A0A087WP35 240 aa21.48■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Slc3a2P10852 526 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tcp1P11983 556 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gjc1P28229 396 aa21.48■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Capn13Q3UW68 665 aa21.48■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 BC051142Q3V0M8 400 aa21.48■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rassf4Q8CB96 322 aa21.48■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rpap3Q9D706 660 aa21.48■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 1700017N19RikA0A087WPJ1 469 aa21.47■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Calcoco2A2A6M5 331 aa21.47■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Dhtkd1A2ATU0 921 aa21.47■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Foxn2E9Q7L6 429 aa21.47■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Xirp1O70373 1129 aa21.47■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Wnt7bP28047 349 aa21.47■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Q3TTJ4 293 aa21.47■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 ItgadQ3V0T4 1168 aa21.47■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ces1eQ64176 562 aa21.47■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tmem130Q6NXM3 419 aa21.47■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Q6PD19 689 aa21.47■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Slc9a9Q8BZ00 644 aa21.47■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Nrbp2Q91V36 499 aa21.47■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ubxn2aQ99KJ0 258 aa21.47■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Golph3Q9CRA5 298 aa21.47■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Znf354bQ9QXT9 601 aa21.47■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Lamb2Q61292 1799 aa21.47■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 UtrnE9Q6R7 3430 aa21.46■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Sbno2Q7TNB8 1349 aa21.46■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Vmn2r63E9Q0K5 859 aa21.46■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm9268E9Q0M3 861 aa21.46■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Vmn2r62K7N712 859 aa21.46■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 SnrpfP62307 86 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Slc10a4Q3UEZ8 437 aa21.46■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Krt35Q497I4 455 aa21.46■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Sema5bQ60519 1093 aa21.46■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tmem117Q8BH18 514 aa21.46■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Psmd5Q8BJY1 504 aa21.46■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Leng8Q8CBY3 785 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fzd9Q9R216 592 aa21.46■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Lmod3E9QA62 571 aa21.46■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cbx2P30658 519 aa21.46■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 rp9P97762 213 aa21.46■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ly9Q01965 654 aa21.46■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Kmt5aQ2YDW7 349 aa21.46■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Srd5a1Q68FF9 255 aa21.46■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tas2r134Q7TQB0 298 aa21.46■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Snip1Q8BIZ6 383 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Bpifb6Q8BU51 449 aa21.46■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Vmn1r218Q8R261 298 aa21.46■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 RnpepQ8VCT3 650 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ubxn1Q922Y1 297 aa21.46■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Serpina9Q9D7D2 418 aa21.46■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Nudt5Q9JKX6 218 aa21.46■■□□□ 1.03
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 4930544D05RikJ3QK56 214 aa21.45■■□□□ 1.02
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pja1O55176 578 aa21.45■■□□□ 1.02
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Sin3bQ62141 1098 aa21.45■■□□□ 1.02
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Serpinb3dQ6UKZ0 387 aa21.45■■□□□ 1.02
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ano5Q75UR0 904 aa21.45■■□□□ 1.02
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Kat5Q8CHK4 513 aa21.45■■□□□ 1.02
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pop1Q8K205 1045 aa21.45■■□□□ 1.02
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ero1bQ8R2E9 467 aa21.45■■□□□ 1.02
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Emc2Q9CRD2 297 aa21.45■■□□□ 1.02
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Hsd3b7Q9EQC1 369 aa21.45■■□□□ 1.02
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mettl1Q9Z120 268 aa21.45■■□□□ 1.02
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rgs22G3UYX5 1258 aa21.44■■□□□ 1.02
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Apba3O88888 571 aa21.44■■□□□ 1.02
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 XlrP05531 208 aa21.44■■□□□ 1.02
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ccnd3P30282 292 aa21.44■■□□□ 1.02
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Map2k1P31938 393 aa21.44■■□□□ 1.02
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Abhd15Q5F2F2 459 aa21.44■■□□□ 1.02
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mcph1Q7TT79 822 aa21.44■■□□□ 1.02
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 AsphQ8BSY0 741 aa21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 26.1 ms