RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001520.12

Afg3l1-201, Transcript of AFG3-like protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Afg3l1, Length 4,227 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Lrrc55Q3UY51 311 aa12.98□□□□□ -0.33
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ice2Q3UZ18 988 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Q6PD19 689 aa12.98□□□□□ -0.33
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Fnbp1Q80TY0 616 aa12.98□□□□□ -0.33
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Calhm6Q8C9E8 313 aa12.98□□□□□ -0.33
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 ArpinQ9D0A3 226 aa12.98□□□□□ -0.33
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Spata17Q9D552 379 aa12.98□□□□□ -0.33
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ddx24Q9ESV0 857 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Als2Q920R0 1651 aa12.98□□□□□ -0.33
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Mocs3A2BDX3 460 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Meis2P97367 477 aa12.97□□□□□ -0.33
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Fgfr4Q03142 799 aa12.97□□□□□ -0.33
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gm10488Q4KL05 212 aa12.97□□□□□ -0.33
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 SugctQ7TNE1 436 aa12.97□□□□□ -0.33
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Rab44Q8CB87 725 aa12.97□□□□□ -0.33
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Usp27Q8CEG8 438 aa12.97□□□□□ -0.33
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Lgi2Q8K4Z0 550 aa12.97□□□□□ -0.33
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Dnajc19Q9CQV7 116 aa12.97□□□□□ -0.33
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Arl2bpQ9D385 163 aa12.97□□□□□ -0.33
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Klra9Q2TJJ8 266 aa12.97□□□□□ -0.33
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Tmem35bQ3U0Y2 150 aa12.97□□□□□ -0.33
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ildr1Q8CBR1 537 aa12.97□□□□□ -0.33
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Plagl2Q925T4 496 aa12.97□□□□□ -0.33
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Kcnq4Q9JK97 696 aa12.97□□□□□ -0.33
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Kat6bQ8BRB7 1872 aa12.97□□□□□ -0.33
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Zfp597E9Q6S0 419 aa12.97□□□□□ -0.33
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Nfatc2ipO09130 412 aa12.97□□□□□ -0.33
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Mucl2P02815 138 aa12.97□□□□□ -0.33
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 PrkceP16054 737 aa12.97□□□□□ -0.33
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Tmod1P49813 359 aa12.97□□□□□ -0.33
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ddx49Q4FZF3 480 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Usp29Q9ES63 869 aa12.97□□□□□ -0.33
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Sgk1Q9WVC6 431 aa12.97□□□□□ -0.33
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 1700017N19RikA0A087WPJ1 469 aa12.96□□□□□ -0.33
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 IkbkbO88351 757 aa12.96□□□□□ -0.33
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 AgtP11859 477 aa12.96□□□□□ -0.33
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ercc5P35689 1170 aa12.96□□□□□ -0.33
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 SbdsP70122 250 aa12.96□□□□□ -0.33
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gtpbp6Q3U6U5 514 aa12.96□□□□□ -0.33
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gm11437Q5QR91 290 aa12.96□□□□□ -0.33
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Klra7Q60654 280 aa12.96□□□□□ -0.33
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Mcph1Q7TT79 822 aa12.96□□□□□ -0.33
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Micall1Q8BGT6 870 aa12.96□□□□□ -0.33
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gtf3c5Q8R2T8 520 aa12.96□□□□□ -0.33
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Tube1Q9D6T1 475 aa12.96□□□□□ -0.33
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Cntnap1O54991 1385 aa12.96□□□□□ -0.33
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Lrrc38A2VDH3 298 aa12.96□□□□□ -0.33
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 DgkhD3YXJ0 1156 aa12.96□□□□□ -0.33
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Nptx2O70340 429 aa12.96□□□□□ -0.33
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 FaxcQ3UMF9 409 aa12.96□□□□□ -0.33
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Adam6bQ6IMH7 756 aa12.96□□□□□ -0.33
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Acot5Q6Q2Z6 421 aa12.96□□□□□ -0.33
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Serpinb3dQ6UKZ0 387 aa12.96□□□□□ -0.33
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 VillQ91YD6 859 aa12.96□□□□□ -0.33
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Fam133bQ9CVI2 245 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Elp3Q9CZX0 547 aa12.96□□□□□ -0.33
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ppp2r3dQ9Z176 491 aa12.96□□□□□ -0.33
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Rasgrp1Q9Z1S3 795 aa12.96□□□□□ -0.33
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Trpm3Q5F4S9 1721 aa12.96□□□□□ -0.33
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ttll10A4Q9F3 704 aa12.96□□□□□ -0.34
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Usp17ldG5E8G2 545 aa12.96□□□□□ -0.34
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Usp17lcG5E8I7 545 aa12.96□□□□□ -0.34
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 SfnO70456 248 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.34
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Gm5168Q4KL04 211 aa12.96□□□□□ -0.34
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Skiv2lQ6NZR5 1244 aa12.96□□□□□ -0.34
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Pip5kl1Q6U7H8 395 aa12.96□□□□□ -0.34
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Fmnl3Q6ZPF4 1028 aa12.96□□□□□ -0.34
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Parp10Q8CIE4 960 aa12.96□□□□□ -0.34
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ago2Q8CJG0 860 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.34
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Slc35f6Q8VE96 372 aa12.96□□□□□ -0.34
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Trappc11B2RXC1 1133 aa12.96□□□□□ -0.34
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Tdpoz4Q6YCH2 370 aa12.96□□□□□ -0.34
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Cwf19l2Q8BG79 887 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.34
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Rassf4Q8CB96 322 aa12.96□□□□□ -0.34
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ttc33Q9D6K7 262 aa12.96□□□□□ -0.34
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Tacc3Q9JJ11 631 aa12.96□□□□□ -0.34
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Arap3Q8R5G7 1538 aa12.95□□□□□ -0.34
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Arhgap4B1AUY3 965 aa12.95□□□□□ -0.34
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 GclmO09172 274 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Il13ra2O88786 383 aa12.95□□□□□ -0.34
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Myl1P05977 188 aa12.95□□□□□ -0.34
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Akr1b8P45377 316 aa12.95□□□□□ -0.34
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Agbl1Q09M05 972 aa12.95□□□□□ -0.34
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ppp2r5cQ60996 524 aa12.95□□□□□ -0.34
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ipo5Q8BKC5 1097 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Tph2Q8CGV2 488 aa12.95□□□□□ -0.34
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Zcchc8Q9CYA6 709 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 MefvQ9JJ26 767 aa12.95□□□□□ -0.34
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ddx20Q9JJY4 825 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Uchl3Q9JKB1 230 aa12.95□□□□□ -0.34
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Aldh18a1Q9Z110 795 aa12.95□□□□□ -0.34
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Klrc1Q9Z202 244 aa12.95□□□□□ -0.34
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Aknad1E9Q8N6 675 aa12.95□□□□□ -0.34
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Stk10O55098 966 aa12.95□□□□□ -0.34
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4930502E18RikQ14BQ3 236 aa12.95□□□□□ -0.34
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Ece1Q4PZA2 769 aa12.95□□□□□ -0.34
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Dph1Q5NCQ5 438 aa12.95□□□□□ -0.34
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Mybpc2Q5XKE0 1136 aa12.95□□□□□ -0.34
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Dsg1aQ61495 1057 aa12.95□□□□□ -0.34
Afg3l1-201ENSMUST00000001520 Kcnj11Q61743 390 aa12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 65 ms