RNA–Protein interactions for RNA: YML034W

SRC1, Transcript of Inner nuclear membrane protein, yeast

Gene SRC1, Length 2,505 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SRC1	YML034W	FIG4	P42837	879 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SRC1	YML034W	ENO2	P00925	437 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SRC1	YML034W	VAC17	P25591	423 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SRC1	YML034W	RTG2	P32608	588 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SRC1	YML034W	RAS1	P01119	309 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SRC1	YML034W	TEC1	P18412	486 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SRC1	YML034W	PUS5	Q06244	254 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SRC1	YML034W	YPR084W	Q06821	456 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRC1	YML034W	MCM16	Q12262	181 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SRC1	YML034W	RIM21	P48565	533 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRC1	YML034W	DPS1	P04802	557 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SRC1	YML034W	GUT2	P32191	649 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRC1	YML034W	ISF1	P32488	338 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRC1	YML034W	YPP1	P46951	817 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRC1	YML034W	FRA1	Q07825	749 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRC1	YML034W	YPR204W	Q08995	1032 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SRC1	YML034W	KIP2	P28743	706 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRC1	YML034W	EMP47	P43555	445 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRC1	YML034W	SYH1	Q02875	849 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SRC1	YML034W	STE20	Q03497	939 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SRC1	YML034W	IXR1	P33417	597 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRC1	YML034W	MRX10	Q05648	414 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SRC1	YML034W	ENO1	P00924	437 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SRC1	YML034W	ITT1	Q04638	464 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SRC1	YML034W	HED1	Q03937	162 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SRC1	YML034W	SPA2	P23201	1466 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SRC1	YML034W	CLA4	P48562	842 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SRC1	YML034W	MRX12	P47084	519 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SRC1	YML034W	RDS2	P19541	446 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SRC1	YML034W	TTI1	P36097	1038 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SRC1	YML034W	APL6	P46682	809 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SRC1	YML034W	AIR1	P40507	360 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SRC1	YML034W	EMW1	P42842	904 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SRC1	YML034W	APP1	P53933	587 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SRC1	YML034W	ENV9	Q08651	330 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SRC1	YML034W	CPS1	P27614	576 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SRC1	YML034W	MRT4	P33201	236 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SRC1	YML034W	PEP12	P32854	288 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SRC1	YML034W	SIS2	P36024	562 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SRC1	YML034W	MET32	Q12041	191 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SRC1	YML034W	ATG3	P40344	310 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SRC1	YML034W	CDC4	P07834	779 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SRC1	YML034W	UTP13	Q05946	817 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SRC1	YML034W	SSA4	P22202	642 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SRC1	YML034W	SOH1	P38633	127 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SRC1	YML034W	ATG20	Q07528	640 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SRC1	YML034W	ISR1	Q06098	443 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SRC1	YML034W	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SRC1	YML034W	YBL086C	P38177	466 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SRC1	YML034W	TGL4	P36165	910 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SRC1	YML034W	HAL5	P38970	855 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SRC1	YML034W	MKS1	P34072	584 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SRC1	YML034W	ASH1	P34233	588 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SRC1	YML034W	KTR7	P40504	517 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SRC1	YML034W	FBP26	P32604	452 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SRC1	YML034W	AFT1	P22149	690 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SRC1	YML034W	PUP1	P25043	261 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SRC1	YML034W	ISU1	Q03020	165 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SRC1	YML034W	SRC1	Q03707	834 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SRC1	YML034W	HST3	P53687	447 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SRC1	YML034W	TRK1	P12685	1235 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SRC1	YML034W	NOB1	Q08444	459 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SRC1	YML034W	CBC2	Q08920	208 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.74	□□□□□ -1.65	RIP-Chip
SRC1	YML034W	UGA3	P26370	528 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SRC1	YML034W	RTT106	P40161	455 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SRC1	YML034W	DFG5	Q05031	458 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SRC1	YML034W	HDA3	Q06623	655 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SRC1	YML034W	STE6	P12866	1290 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SRC1	YML034W	MSB3	P48566	633 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SRC1	YML034W	GAL2	P13181	574 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SRC1	YML034W	MIP1	P15801	1254 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SRC1	YML034W	ECM23	Q02710	187 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SRC1	YML034W	YML083C	Q04526	418 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SRC1	YML034W	BDS1	Q08347	646 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SRC1	YML034W	TSC13	Q99190	310 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SRC1	YML034W	SPT2	P06843	333 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SRC1	YML034W	PHO87	P25360	923 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SRC1	YML034W	SSA1	P10591	642 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SRC1	YML034W	PDI1	P17967	522 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SRC1	YML034W	UTR2	P32623	467 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SRC1	YML034W	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SRC1	YML034W	ACS2	P52910	683 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SRC1	YML034W	THO2	P53552	1597 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SRC1	YML034W	HAP4	P14064	554 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SRC1	YML034W	YFL034W	P43564	1073 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SRC1	YML034W	YJR115W	P47152	169 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SRC1	YML034W	SPT6	P23615	1451 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SRC1	YML034W	DAT1	P13483	248 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SRC1	YML034W	HSL1	P34244	1518 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SRC1	YML034W	RPP2B	P02400	110 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SRC1	YML034W	UBX7	P38349	436 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SRC1	YML034W	SLX8	P40072	274 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SRC1	YML034W	WTM2	Q12206	467 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SRC1	YML034W	PTK2	P47116	818 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
SRC1	YML034W	ARG82	P07250	355 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SRC1	YML034W	NTH2	P35172	780 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SRC1	YML034W	TBS1	P38114	1094 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SRC1	YML034W	AAD14	P42884	376 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SRC1	YML034W	ROM1	P53046	1155 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SRC1	YML034W	GAS4	Q08271	471 aa		4.67	□□□□□ -1.66

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