RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594202.5

FCHO1-206, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene FCHO1, Length 3,214 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-206ENST00000594202 FAM135AQ9P2D6 1515 aa20.7■□□□□ 0.9
FCHO1-206ENST00000594202 BCORL1Q5H9F3 1711 aa20.69■□□□□ 0.9
FCHO1-206ENST00000594202 SHROOM2Q13796 1616 aa20.68■□□□□ 0.9
FCHO1-206ENST00000594202 RSPH4AQ5TD94 716 aa20.67■□□□□ 0.9
FCHO1-206ENST00000594202 ABCC2Q92887 1545 aa20.67■□□□□ 0.9
FCHO1-206ENST00000594202 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa20.66■□□□□ 0.9
FCHO1-206ENST00000594202 SHANK2Q9UPX8 1470 aa20.66■□□□□ 0.9
FCHO1-206ENST00000594202 PREX2Q70Z35 1606 aa20.64■□□□□ 0.89
FCHO1-206ENST00000594202 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
FCHO1-206ENST00000594202 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.61■□□□□ 0.89
FCHO1-206ENST00000594202 PLA2R1Q13018 1463 aa20.61■□□□□ 0.89
FCHO1-206ENST00000594202 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
FCHO1-206ENST00000594202 SCAPERQ9BY12 1400 aa20.6■□□□□ 0.89
FCHO1-206ENST00000594202 GGT6Q6P531 493 aa20.59■□□□□ 0.89
FCHO1-206ENST00000594202 PLCH2O75038 1416 aa20.58■□□□□ 0.89
FCHO1-206ENST00000594202 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP20.57■□□□□ 0.88
FCHO1-206ENST00000594202 ARHGEF5Q12774 1597 aa20.57■□□□□ 0.88
FCHO1-206ENST00000594202 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
FCHO1-206ENST00000594202 PANK3Q9H999 370 aa20.57■□□□□ 0.88
FCHO1-206ENST00000594202 RALGAPBQ86X10 1494 aa20.56■□□□□ 0.88
FCHO1-206ENST00000594202 KDM5CP41229 1560 aa20.55■□□□□ 0.88
FCHO1-206ENST00000594202 DISP3Q9P2K9 1392 aa20.55■□□□□ 0.88
FCHO1-206ENST00000594202 A2MP01023 1474 aa20.54■□□□□ 0.88
FCHO1-206ENST00000594202 MYO5CQ9NQX4 1742 aa20.54■□□□□ 0.88
FCHO1-206ENST00000594202 ZBED9Q6R2W3 1325 aa20.54■□□□□ 0.88
FCHO1-206ENST00000594202 PRAG1Q86YV5 1406 aa20.53■□□□□ 0.88
FCHO1-206ENST00000594202 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
FCHO1-206ENST00000594202 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa20.5■□□□□ 0.87
FCHO1-206ENST00000594202 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
FCHO1-206ENST00000594202 OSCARQ8IYS5 282 aa20.48■□□□□ 0.87
FCHO1-206ENST00000594202 FANCAO15360 1455 aa20.48■□□□□ 0.87
FCHO1-206ENST00000594202 RAPGEF3O95398 923 aa20.48■□□□□ 0.87
FCHO1-206ENST00000594202 CFAP70Q5T0N1 1121 aa20.48■□□□□ 0.87
FCHO1-206ENST00000594202 TESK2Q96S53 571 aa20.47■□□□□ 0.87
FCHO1-206ENST00000594202 KDM5DQ9BY66 1539 aa20.46■□□□□ 0.87
FCHO1-206ENST00000594202 TMF1P82094 1093 aa20.46■□□□□ 0.87
FCHO1-206ENST00000594202 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
FCHO1-206ENST00000594202 CDCA7LQ96GN5 454 aa20.44■□□□□ 0.86
FCHO1-206ENST00000594202 ASXL2Q76L83 1435 aa20.44■□□□□ 0.86
FCHO1-206ENST00000594202 DUOX2Q9NRD8 1548 aa20.43■□□□□ 0.86
FCHO1-206ENST00000594202 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
FCHO1-206ENST00000594202 ADGRL1O94910 1474 aa20.43■□□□□ 0.86
FCHO1-206ENST00000594202 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
FCHO1-206ENST00000594202 WDR7Q9Y4E6 1490 aa20.42■□□□□ 0.86
FCHO1-206ENST00000594202 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
FCHO1-206ENST00000594202 CYB5RLQ6IPT4 315 aa20.42■□□□□ 0.86
FCHO1-206ENST00000594202 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP20.41■□□□□ 0.86
FCHO1-206ENST00000594202 UGGT1Q9NYU2 1555 aa20.41■□□□□ 0.86
FCHO1-206ENST00000594202 ABCC1P33527 1531 aa20.41■□□□□ 0.86
FCHO1-206ENST00000594202 NUDCQ9Y266 331 aa20.4■□□□□ 0.86
FCHO1-206ENST00000594202 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa20.39■□□□□ 0.86
FCHO1-206ENST00000594202 TMEM132EQ6IEE7 984 aa20.39■□□□□ 0.85
FCHO1-206ENST00000594202 PPP4R2Q9NY27 417 aa20.39■□□□□ 0.85
FCHO1-206ENST00000594202 ERBINQ96RT1 1412 aa20.38■□□□□ 0.85
FCHO1-206ENST00000594202 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
FCHO1-206ENST00000594202 KANK1Q14678 1352 aa20.38■□□□□ 0.85
FCHO1-206ENST00000594202 RALBP1Q15311 655 aa20.38■□□□□ 0.85
FCHO1-206ENST00000594202 TRAK1Q9UPV9 953 aa20.38■□□□□ 0.85
FCHO1-206ENST00000594202 NLRP13Q86W25 1043 aa20.37■□□□□ 0.85
FCHO1-206ENST00000594202 KNSTRNQ9Y448 316 aa20.37■□□□□ 0.85
FCHO1-206ENST00000594202 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
FCHO1-206ENST00000594202 PLIN1O60240 522 aa20.36■□□□□ 0.85
FCHO1-206ENST00000594202 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa20.35■□□□□ 0.85
FCHO1-206ENST00000594202 CCDC136Q96JN2 1154 aa20.34■□□□□ 0.85
FCHO1-206ENST00000594202 CCDC146Q8IYE0 955 aa20.34■□□□□ 0.85
FCHO1-206ENST00000594202 UNC13BO14795 1591 aa20.34■□□□□ 0.85
FCHO1-206ENST00000594202 MAST1Q9Y2H9 1570 aa20.34■□□□□ 0.85
FCHO1-206ENST00000594202 ATP10AO60312 1499 aa20.32■□□□□ 0.84
FCHO1-206ENST00000594202 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa20.32■□□□□ 0.84
FCHO1-206ENST00000594202 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa20.31■□□□□ 0.84
FCHO1-206ENST00000594202 IQGAP3Q86VI3 1631 aa20.31■□□□□ 0.84
FCHO1-206ENST00000594202 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa20.3■□□□□ 0.84
FCHO1-206ENST00000594202 PLXNC1O60486 1568 aa20.3■□□□□ 0.84
FCHO1-206ENST00000594202 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
FCHO1-206ENST00000594202 ADAMTS8Q9UP79 889 aa20.29■□□□□ 0.84
FCHO1-206ENST00000594202 ATP7AQ04656 1500 aa20.29■□□□□ 0.84
FCHO1-206ENST00000594202 STK26Q9P289 416 aa20.28■□□□□ 0.84
FCHO1-206ENST00000594202 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
FCHO1-206ENST00000594202 CD109Q6YHK3 1445 aa20.27■□□□□ 0.84
FCHO1-206ENST00000594202 E9PCH4 1651 aa20.27■□□□□ 0.84
FCHO1-206ENST00000594202 MLECQ14165 292 aa20.27■□□□□ 0.83
FCHO1-206ENST00000594202 SKAP1Q86WV1 359 aa20.26■□□□□ 0.83
FCHO1-206ENST00000594202 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
FCHO1-206ENST00000594202 EXOC6Q8TAG9 804 aa20.25■□□□□ 0.83
FCHO1-206ENST00000594202 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP20.25■□□□□ 0.83
FCHO1-206ENST00000594202 GPRASP1Q5JY77 1395 aa20.24■□□□□ 0.83
FCHO1-206ENST00000594202 PARD3Q8TEW0 1356 aa20.24■□□□□ 0.83
FCHO1-206ENST00000594202 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
FCHO1-206ENST00000594202 NEUROD2Q15784 382 aa20.23■□□□□ 0.83
FCHO1-206ENST00000594202 RCAN3Q9UKA8 241 aa20.23■□□□□ 0.83
FCHO1-206ENST00000594202 PPP2R1AP30153 589 aa20.22■□□□□ 0.83
FCHO1-206ENST00000594202 CLTCL1P53675 1640 aa20.22■□□□□ 0.83
FCHO1-206ENST00000594202 MAGI2Q86UL8 1455 aa20.21■□□□□ 0.83
FCHO1-206ENST00000594202 PLPPR3Q6T4P5 718 aa20.2■□□□□ 0.82
FCHO1-206ENST00000594202 NOS1P29475 1434 aa20.19■□□□□ 0.82
FCHO1-206ENST00000594202 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa20.19■□□□□ 0.82
FCHO1-206ENST00000594202 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa20.19■□□□□ 0.82
FCHO1-206ENST00000594202 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
FCHO1-206ENST00000594202 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
FCHO1-206ENST00000594202 MSH5O43196 834 aa20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms