RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592582.5

SEH1L-210, Transcript of SEH1 like nucleoporin, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SEH1L, Length 4,072 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1L-210ENST00000592582 SIN3AQ96ST3 1273 aa8.12□□□□□ -1.11
SEH1L-210ENST00000592582 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
SEH1L-210ENST00000592582 ERCC6Q03468 1493 aa8.12□□□□□ -1.11
SEH1L-210ENST00000592582 MAGI2Q86UL8 1455 aa8.12□□□□□ -1.11
SEH1L-210ENST00000592582 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
SEH1L-210ENST00000592582 ABCC10Q5T3U5 1492 aa8.11□□□□□ -1.11
SEH1L-210ENST00000592582 TEX14Q8IWB6 1497 aa8.11□□□□□ -1.11
SEH1L-210ENST00000592582 DEPDC5O75140 1603 aa8.11□□□□□ -1.11
SEH1L-210ENST00000592582 GRIN2AQ12879 1464 aa8.11□□□□□ -1.11
SEH1L-210ENST00000592582 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa8.11□□□□□ -1.11
SEH1L-210ENST00000592582 MYO5CQ9NQX4 1742 aa8.1□□□□□ -1.11
SEH1L-210ENST00000592582 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
SEH1L-210ENST00000592582 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
SEH1L-210ENST00000592582 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa8.09□□□□□ -1.11
SEH1L-210ENST00000592582 CHD1O14646 1710 aa8.09□□□□□ -1.11
SEH1L-210ENST00000592582 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa8.08□□□□□ -1.12
SEH1L-210ENST00000592582 IFT172Q9UG01 1749 aa8.08□□□□□ -1.12
SEH1L-210ENST00000592582 CHIC2Q9UKJ5 165 aa8.08□□□□□ -1.12
SEH1L-210ENST00000592582 KDM5CP41229 1560 aa8.08□□□□□ -1.12
SEH1L-210ENST00000592582 PTPRGP23470 1445 aa8.08□□□□□ -1.12
SEH1L-210ENST00000592582 CLASP1Q7Z460 1538 aa8.07□□□□□ -1.12
SEH1L-210ENST00000592582 IQGAP3Q86VI3 1631 aa8.07□□□□□ -1.12
SEH1L-210ENST00000592582 CCER2I3L3R5 266 aa8.07□□□□□ -1.12
SEH1L-210ENST00000592582 STK25O00506 426 aa8.07□□□□□ -1.12
SEH1L-210ENST00000592582 DCAF8Q5TAQ9 597 aa8.07□□□□□ -1.12
SEH1L-210ENST00000592582 ARID3CA6NKF2 412 aa8.06□□□□□ -1.12
SEH1L-210ENST00000592582 SYNJ2O15056 1496 aa8.06□□□□□ -1.12
SEH1L-210ENST00000592582 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
SEH1L-210ENST00000592582 OSCARQ8IYS5 282 aa8.05□□□□□ -1.12
SEH1L-210ENST00000592582 PPP4R2Q9NY27 417 aa8.05□□□□□ -1.12
SEH1L-210ENST00000592582 ARAP3Q8WWN8 1544 aa8.05□□□□□ -1.12
SEH1L-210ENST00000592582 PLEKHD1A6NEE1 506 aa8.05□□□□□ -1.12
SEH1L-210ENST00000592582 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
SEH1L-210ENST00000592582 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa8.05□□□□□ -1.12
SEH1L-210ENST00000592582 CCDC136Q96JN2 1154 aa8.05□□□□□ -1.12
SEH1L-210ENST00000592582 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa8.05□□□□□ -1.12
SEH1L-210ENST00000592582 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa8.05□□□□□ -1.12
SEH1L-210ENST00000592582 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP8.04□□□□□ -1.12
SEH1L-210ENST00000592582 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa8.04□□□□□ -1.12
SEH1L-210ENST00000592582 PZPP20742 1482 aa8.04□□□□□ -1.12
SEH1L-210ENST00000592582 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
SEH1L-210ENST00000592582 MPHOSPH9Q99550 1183 aa8.03□□□□□ -1.12
SEH1L-210ENST00000592582 CEP152O94986 1710 aa8.02□□□□□ -1.12
SEH1L-210ENST00000592582 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa8.02□□□□□ -1.12
SEH1L-210ENST00000592582 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
SEH1L-210ENST00000592582 VWDEQ8N2E2 1590 aa8.02□□□□□ -1.13
SEH1L-210ENST00000592582 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
SEH1L-210ENST00000592582 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
SEH1L-210ENST00000592582 TSPY4P0CV99 314 aa8.01□□□□□ -1.13
SEH1L-210ENST00000592582 TSPY10P0CW01 314 aa8.01□□□□□ -1.13
SEH1L-210ENST00000592582 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa8.01□□□□□ -1.13
SEH1L-210ENST00000592582 IQGAP1P46940 1657 aa8.01□□□□□ -1.13
SEH1L-210ENST00000592582 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP8.01□□□□□ -1.13
SEH1L-210ENST00000592582 JPH4Q96JJ6 628 aa8.01□□□□□ -1.13
SEH1L-210ENST00000592582 DAPK1P53355 1430 aa8.01□□□□□ -1.13
SEH1L-210ENST00000592582 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
SEH1L-210ENST00000592582 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
SEH1L-210ENST00000592582 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa8□□□□□ -1.13
SEH1L-210ENST00000592582 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
SEH1L-210ENST00000592582 ABCA9Q8IUA7 1624 aa7.99□□□□□ -1.13
SEH1L-210ENST00000592582 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa7.99□□□□□ -1.13
SEH1L-210ENST00000592582 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa7.99□□□□□ -1.13
SEH1L-210ENST00000592582 USP35Q9P2H5 1018 aa7.99□□□□□ -1.13
SEH1L-210ENST00000592582 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
SEH1L-210ENST00000592582 ATP10AO60312 1499 aa7.99□□□□□ -1.13
SEH1L-210ENST00000592582 MYO3AQ8NEV4 1616 aa7.99□□□□□ -1.13
SEH1L-210ENST00000592582 PKNOX2Q96KN3 472 aa7.98□□□□□ -1.13
SEH1L-210ENST00000592582 ABCC5O15440 1437 aa7.98□□□□□ -1.13
SEH1L-210ENST00000592582 NEFMP07197 916 aa7.98□□□□□ -1.13
SEH1L-210ENST00000592582 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa7.98□□□□□ -1.13
SEH1L-210ENST00000592582 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa7.98□□□□□ -1.13
SEH1L-210ENST00000592582 RSPH6AQ9H0K4 717 aa7.98□□□□□ -1.13
SEH1L-210ENST00000592582 WDR70Q9NW82 654 aa7.98□□□□□ -1.13
SEH1L-210ENST00000592582 RSPH4AQ5TD94 716 aa7.97□□□□□ -1.13
SEH1L-210ENST00000592582 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
SEH1L-210ENST00000592582 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
SEH1L-210ENST00000592582 ARID3AQ99856 593 aa7.97□□□□□ -1.13
SEH1L-210ENST00000592582 CLEC11AQ9Y240 323 aa7.97□□□□□ -1.13
SEH1L-210ENST00000592582 STK24Q9Y6E0 443 aa7.97□□□□□ -1.13
SEH1L-210ENST00000592582 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
SEH1L-210ENST00000592582 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.13
SEH1L-210ENST00000592582 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
SEH1L-210ENST00000592582 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
SEH1L-210ENST00000592582 MYOM1P52179 1685 aa7.96□□□□□ -1.14
SEH1L-210ENST00000592582 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
SEH1L-210ENST00000592582 TTC37Q6PGP7 1564 aa7.95□□□□□ -1.14
SEH1L-210ENST00000592582 L3MBTL2Q969R5 705 aa7.95□□□□□ -1.14
SEH1L-210ENST00000592582 NCOA1Q15788 1441 aa7.94□□□□□ -1.14
SEH1L-210ENST00000592582 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
SEH1L-210ENST00000592582 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
SEH1L-210ENST00000592582 MROH1Q8NDA8 1641 aa7.94□□□□□ -1.14
SEH1L-210ENST00000592582 STAG3Q9UJ98 1225 aa7.94□□□□□ -1.14
SEH1L-210ENST00000592582 KCNH8Q96L42 1107 aa7.94□□□□□ -1.14
SEH1L-210ENST00000592582 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
SEH1L-210ENST00000592582 IL27Q8NEV9 243 aa7.93□□□□□ -1.14
SEH1L-210ENST00000592582 ARXQ96QS3 562 aa7.93□□□□□ -1.14
SEH1L-210ENST00000592582 WDR7Q9Y4E6 1490 aa7.93□□□□□ -1.14
SEH1L-210ENST00000592582 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa7.93□□□□□ -1.14
SEH1L-210ENST00000592582 NEUROD2Q15784 382 aa7.92□□□□□ -1.14
SEH1L-210ENST00000592582 RALGAPBQ86X10 1494 aa7.92□□□□□ -1.14
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