RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561408.1

TMOD3-210, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 493 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-210ENST00000561408 ERCC6L2Q5T890 1561 aa8.99□□□□□ -0.97
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TMOD3-210ENST00000561408 SPNS2Q8IVW8 549 aa8.98□□□□□ -0.97
TMOD3-210ENST00000561408 LHX6Q9UPM6 363 aa8.98□□□□□ -0.97
TMOD3-210ENST00000561408 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
TMOD3-210ENST00000561408 SYNJ1O43426 1573 aa8.96□□□□□ -0.97
TMOD3-210ENST00000561408 TBC1D12O60347 775 aa8.96□□□□□ -0.98
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TMOD3-210ENST00000561408 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
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TMOD3-210ENST00000561408 MAP3K9P80192 1104 aa8.84□□□□□ -0.99
TMOD3-210ENST00000561408 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa8.84□□□□□ -0.99
TMOD3-210ENST00000561408 DISP3Q9P2K9 1392 aa8.84□□□□□ -0.99
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TMOD3-210ENST00000561408 ABCC10Q5T3U5 1492 aa8.82□□□□□ -1
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TMOD3-210ENST00000561408 DIP2BQ9P265 1576 aa8.82□□□□□ -1
TMOD3-210ENST00000561408 SOGA1O94964 1423 aa8.8□□□□□ -1
TMOD3-210ENST00000561408 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
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TMOD3-210ENST00000561408 WDR70Q9NW82 654 aa8.73□□□□□ -1.01
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TMOD3-210ENST00000561408 FGD5Q6ZNL6 1462 aa8.72□□□□□ -1.01
TMOD3-210ENST00000561408 TK2O00142 265 aa8.72□□□□□ -1.01
TMOD3-210ENST00000561408 WDR97A6NE52 1622 aa8.72□□□□□ -1.01
TMOD3-210ENST00000561408 MAPKBP1O60336 1514 aa8.71□□□□□ -1.01
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TMOD3-210ENST00000561408 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
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TMOD3-210ENST00000561408 HRO43593 1189 aa8.68□□□□□ -1.02
TMOD3-210ENST00000561408 PHF14O94880 888 aa8.68□□□□□ -1.02
TMOD3-210ENST00000561408 TYW1BQ6NUM6 668 aa8.68□□□□□ -1.02
TMOD3-210ENST00000561408 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa8.68□□□□□ -1.02
TMOD3-210ENST00000561408 GRIN2AQ12879 1464 aa8.68□□□□□ -1.02
TMOD3-210ENST00000561408 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
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TMOD3-210ENST00000561408 ZBED2Q9BTP6 218 aa8.65□□□□□ -1.02
TMOD3-210ENST00000561408 NUP160Q12769 1436 aa8.64□□□□□ -1.03
TMOD3-210ENST00000561408 SLC4A5Q9BY07 1137 aa8.64□□□□□ -1.03
TMOD3-210ENST00000561408 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
TMOD3-210ENST00000561408 TOP2BQ02880 1626 aa8.62□□□□□ -1.03
TMOD3-210ENST00000561408 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa8.62□□□□□ -1.03
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