RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542100.5

E2F6-211, Transcript of E2F transcription factor 6, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene E2F6, Length 3,450 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6-211ENST00000542100 ARHGEF5Q12774 1597 aa20.65■□□□□ 0.9
E2F6-211ENST00000542100 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP20.64■□□□□ 0.98e-6■□□□□ 10.5
E2F6-211ENST00000542100 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.9
E2F6-211ENST00000542100 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
E2F6-211ENST00000542100 PLA2R1Q13018 1463 aa20.63■□□□□ 0.89
E2F6-211ENST00000542100 KDM5DQ9BY66 1539 aa20.63■□□□□ 0.89
E2F6-211ENST00000542100 PREX2Q70Z35 1606 aa20.62■□□□□ 0.89
E2F6-211ENST00000542100 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
E2F6-211ENST00000542100 PPP4R2Q9NY27 417 aa20.61■□□□□ 0.89
E2F6-211ENST00000542100 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa20.61■□□□□ 0.89
E2F6-211ENST00000542100 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
E2F6-211ENST00000542100 AFAP1Q8N556 730 aa20.59■□□□□ 0.89
E2F6-211ENST00000542100 PRAG1Q86YV5 1406 aa20.57■□□□□ 0.88
E2F6-211ENST00000542100 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa20.55■□□□□ 0.88
E2F6-211ENST00000542100 ANP32EQ9BTT0 268 aa20.55■□□□□ 0.88
E2F6-211ENST00000542100 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
E2F6-211ENST00000542100 ABCC2Q92887 1545 aa20.54■□□□□ 0.88
E2F6-211ENST00000542100 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa20.53■□□□□ 0.88
E2F6-211ENST00000542100 A2MP01023 1474 aa20.53■□□□□ 0.88
E2F6-211ENST00000542100 NUDCQ9Y266 331 aa20.53■□□□□ 0.88
E2F6-211ENST00000542100 MYT1LQ9UL68 1186 aa20.51■□□□□ 0.87
E2F6-211ENST00000542100 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
E2F6-211ENST00000542100 DISP3Q9P2K9 1392 aa20.51■□□□□ 0.87
E2F6-211ENST00000542100 SHROOM2Q13796 1616 aa20.5■□□□□ 0.87
E2F6-211ENST00000542100 TESK2Q96S53 571 aa20.5■□□□□ 0.87
E2F6-211ENST00000542100 PLCH2O75038 1416 aa20.49■□□□□ 0.87
E2F6-211ENST00000542100 MSH5O43196 834 aa20.49■□□□□ 0.87
E2F6-211ENST00000542100 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
E2F6-211ENST00000542100 PANK3Q9H999 370 aa20.48■□□□□ 0.87
E2F6-211ENST00000542100 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
E2F6-211ENST00000542100 RALBP1Q15311 655 aa20.48■□□□□ 0.87
E2F6-211ENST00000542100 ERICH6BQ5W0A0 696 aa20.48■□□□□ 0.87
E2F6-211ENST00000542100 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
E2F6-211ENST00000542100 MYO5CQ9NQX4 1742 aa20.45■□□□□ 0.86
E2F6-211ENST00000542100 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
E2F6-211ENST00000542100 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa20.43■□□□□ 0.86
E2F6-211ENST00000542100 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
E2F6-211ENST00000542100 UNC13BO14795 1591 aa20.43■□□□□ 0.86
E2F6-211ENST00000542100 MAST1Q9Y2H9 1570 aa20.42■□□□□ 0.86
E2F6-211ENST00000542100 NLRP13Q86W25 1043 aa20.42■□□□□ 0.86
E2F6-211ENST00000542100 DUOX2Q9NRD8 1548 aa20.42■□□□□ 0.86
E2F6-211ENST00000542100 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
E2F6-211ENST00000542100 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
E2F6-211ENST00000542100 GPRASP1Q5JY77 1395 aa20.4■□□□□ 0.86
E2F6-211ENST00000542100 CDCA7LQ96GN5 454 aa20.4■□□□□ 0.86
E2F6-211ENST00000542100 TMF1P82094 1093 aa20.39■□□□□ 0.85
E2F6-211ENST00000542100 CCDC136Q96JN2 1154 aa20.39■□□□□ 0.85
E2F6-211ENST00000542100 ERBINQ96RT1 1412 aa20.38■□□□□ 0.85
E2F6-211ENST00000542100 KIF3BO15066 747 aa20.38■□□□□ 0.85
E2F6-211ENST00000542100 IQGAP3Q86VI3 1631 aa20.38■□□□□ 0.85
E2F6-211ENST00000542100 PARD3Q8TEW0 1356 aa20.38■□□□□ 0.85
E2F6-211ENST00000542100 PLXNC1O60486 1568 aa20.37■□□□□ 0.85
E2F6-211ENST00000542100 RNF123Q5XPI4 1314 aa20.35■□□□□ 0.85
E2F6-211ENST00000542100 ABCC1P33527 1531 aa20.35■□□□□ 0.85
E2F6-211ENST00000542100 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
E2F6-211ENST00000542100 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.32■□□□□ 0.84
E2F6-211ENST00000542100 SCAPERQ9BY12 1400 aa20.32■□□□□ 0.84
E2F6-211ENST00000542100 E9PCH4 1651 aa20.32■□□□□ 0.84
E2F6-211ENST00000542100 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
E2F6-211ENST00000542100 MAGI2Q86UL8 1455 aa20.31■□□□□ 0.84
E2F6-211ENST00000542100 EXOC6Q8TAG9 804 aa20.3■□□□□ 0.84
E2F6-211ENST00000542100 ATP10AO60312 1499 aa20.29■□□□□ 0.84
E2F6-211ENST00000542100 RCAN3Q9UKA8 241 aa20.29■□□□□ 0.84
E2F6-211ENST00000542100 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa20.29■□□□□ 0.84
E2F6-211ENST00000542100 PLIN1O60240 522 aa20.29■□□□□ 0.84
E2F6-211ENST00000542100 FANCIQ9NVI1 1328 aa20.28■□□□□ 0.84
E2F6-211ENST00000542100 RRP1P56182 461 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
E2F6-211ENST00000542100 CFAP70Q5T0N1 1121 aa20.27■□□□□ 0.84
E2F6-211ENST00000542100 ADAMTS8Q9UP79 889 aa20.27■□□□□ 0.84
E2F6-211ENST00000542100 KNSTRNQ9Y448 316 aa20.26■□□□□ 0.83
E2F6-211ENST00000542100 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
E2F6-211ENST00000542100 FANCAO15360 1455 aa20.26■□□□□ 0.83
E2F6-211ENST00000542100 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa20.24■□□□□ 0.83
E2F6-211ENST00000542100 CHGAP10645 457 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
E2F6-211ENST00000542100 WDR7Q9Y4E6 1490 aa20.23■□□□□ 0.83
E2F6-211ENST00000542100 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa20.22■□□□□ 0.83
E2F6-211ENST00000542100 UGGT1Q9NYU2 1555 aa20.22■□□□□ 0.83
E2F6-211ENST00000542100 PPP2R1AP30153 589 aa20.21■□□□□ 0.83
E2F6-211ENST00000542100 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa20.21■□□□□ 0.83
E2F6-211ENST00000542100 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa20.21■□□□□ 0.83
E2F6-211ENST00000542100 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
E2F6-211ENST00000542100 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
E2F6-211ENST00000542100 ERICH6Q7L0X2 663 aa20.2■□□□□ 0.82
E2F6-211ENST00000542100 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
E2F6-211ENST00000542100 KANK1Q14678 1352 aa20.2■□□□□ 0.82
E2F6-211ENST00000542100 ADGRL1O94910 1474 aa20.2■□□□□ 0.82
E2F6-211ENST00000542100 BCL11AQ9H165 835 aa20.19■□□□□ 0.82
E2F6-211ENST00000542100 CLTCL1P53675 1640 aa20.19■□□□□ 0.82
E2F6-211ENST00000542100 PTPRTO14522 1441 aa20.18■□□□□ 0.82
E2F6-211ENST00000542100 GGT6Q6P531 493 aa20.17■□□□□ 0.82
E2F6-211ENST00000542100 SKAP1Q86WV1 359 aa20.17■□□□□ 0.82
E2F6-211ENST00000542100 ASXL2Q76L83 1435 aa20.17■□□□□ 0.82
E2F6-211ENST00000542100 ATP7AQ04656 1500 aa20.17■□□□□ 0.82
E2F6-211ENST00000542100 MADDQ8WXG6 1647 aa20.17■□□□□ 0.82
E2F6-211ENST00000542100 TRPM2O94759 1503 aa20.16■□□□□ 0.82
E2F6-211ENST00000542100 CCDC146Q8IYE0 955 aa20.16■□□□□ 0.82
E2F6-211ENST00000542100 LAMC1P11047 1609 aa20.16■□□□□ 0.82
E2F6-211ENST00000542100 PDE3BQ13370 1112 aa20.15■□□□□ 0.82
E2F6-211ENST00000542100 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
E2F6-211ENST00000542100 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.7 ms