RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517910.1

AP003356.1-202, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene AP003356.1, Length 2,770 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP003356.1-202ENST00000517910 CLCN1P35523 988 aa25.21■■□□□ 1.63
AP003356.1-202ENST00000517910 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP25.2■■□□□ 1.62
AP003356.1-202ENST00000517910 BECN1Q14457 450 aa25.2■■□□□ 1.62
AP003356.1-202ENST00000517910 RALGAPBQ86X10 1494 aa25.2■■□□□ 1.62
AP003356.1-202ENST00000517910 USP19O94966 1318 aa25.19■■□□□ 1.62
AP003356.1-202ENST00000517910 PKD2Q13563 968 aa25.19■■□□□ 1.62
AP003356.1-202ENST00000517910 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.18■■□□□ 1.62
AP003356.1-202ENST00000517910 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
AP003356.1-202ENST00000517910 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa25.18■■□□□ 1.62
AP003356.1-202ENST00000517910 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
AP003356.1-202ENST00000517910 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa25.17■■□□□ 1.62
AP003356.1-202ENST00000517910 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
AP003356.1-202ENST00000517910 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
AP003356.1-202ENST00000517910 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.15■■□□□ 1.62
AP003356.1-202ENST00000517910 E9PCH4 1651 aa25.15■■□□□ 1.62
AP003356.1-202ENST00000517910 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
AP003356.1-202ENST00000517910 PANK2Q9BZ23 570 aa25.15■■□□□ 1.62
AP003356.1-202ENST00000517910 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
AP003356.1-202ENST00000517910 SEC24BO95487 1268 aa25.12■■□□□ 1.61
AP003356.1-202ENST00000517910 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
AP003356.1-202ENST00000517910 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa25.12■■□□□ 1.61
AP003356.1-202ENST00000517910 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.12■■□□□ 1.61
AP003356.1-202ENST00000517910 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
AP003356.1-202ENST00000517910 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
AP003356.1-202ENST00000517910 DUSP27Q5VZP5 1158 aa25.1■■□□□ 1.61
AP003356.1-202ENST00000517910 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
AP003356.1-202ENST00000517910 NESP48681 1621 aa25.09■■□□□ 1.61
AP003356.1-202ENST00000517910 INSRP06213 1382 aa25.09■■□□□ 1.61
AP003356.1-202ENST00000517910 ANTXR1Q9H6X2 564 aa25.09■■□□□ 1.61
AP003356.1-202ENST00000517910 FSD2A1L4K1 749 aa25.09■■□□□ 1.61
AP003356.1-202ENST00000517910 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.08■■□□□ 1.61
AP003356.1-202ENST00000517910 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.07■■□□□ 1.6
AP003356.1-202ENST00000517910 ADAMTS8Q9UP79 889 aa25.06■■□□□ 1.6
AP003356.1-202ENST00000517910 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.06■■□□□ 1.6
AP003356.1-202ENST00000517910 TOPBP1Q92547 1522 aa25.03■■□□□ 1.6
AP003356.1-202ENST00000517910 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa25.02■■□□□ 1.6
AP003356.1-202ENST00000517910 IGHDP01880 384 aa25.02■■□□□ 1.6
AP003356.1-202ENST00000517910 GOLGA2Q08379 1002 aa25.01■■□□□ 1.59
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AP003356.1-202ENST00000517910 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
AP003356.1-202ENST00000517910 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa24.98■■□□□ 1.59
AP003356.1-202ENST00000517910 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
AP003356.1-202ENST00000517910 TBC1D2Q9BYX2 928 aa24.97■■□□□ 1.59
AP003356.1-202ENST00000517910 PANK3Q9H999 370 aa24.97■■□□□ 1.59
AP003356.1-202ENST00000517910 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
AP003356.1-202ENST00000517910 MRE11P49959 708 aa24.96■■□□□ 1.59
AP003356.1-202ENST00000517910 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.96■■□□□ 1.59
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AP003356.1-202ENST00000517910 BCAR3O75815 825 aa24.93■■□□□ 1.58
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AP003356.1-202ENST00000517910 DISP3Q9P2K9 1392 aa24.85■■□□□ 1.57
AP003356.1-202ENST00000517910 TPM2P07951 284 aa24.85■■□□□ 1.57
AP003356.1-202ENST00000517910 PDCL3Q9H2J4 239 aa24.85■■□□□ 1.57
AP003356.1-202ENST00000517910 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.85■■□□□ 1.57
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AP003356.1-202ENST00000517910 CGNL1Q0VF96 1302 aa24.83■■□□□ 1.57
AP003356.1-202ENST00000517910 CHMP5Q9NZZ3 219 aa24.83■■□□□ 1.57
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AP003356.1-202ENST00000517910 COG6Q9Y2V7 657 aa24.81■■□□□ 1.56
AP003356.1-202ENST00000517910 PPP2R1AP30153 589 aa24.8■■□□□ 1.56
AP003356.1-202ENST00000517910 CCDC146Q8IYE0 955 aa24.8■■□□□ 1.56
AP003356.1-202ENST00000517910 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
AP003356.1-202ENST00000517910 TESK2Q96S53 571 aa24.79■■□□□ 1.56
AP003356.1-202ENST00000517910 PANK1Q8TE04 598 aa24.79■■□□□ 1.56
AP003356.1-202ENST00000517910 CANXP27824 592 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
AP003356.1-202ENST00000517910 ADGRL2O95490 1459 aa24.77■■□□□ 1.56
AP003356.1-202ENST00000517910 PDE3AQ14432 1141 aa24.76■■□□□ 1.56
AP003356.1-202ENST00000517910 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
AP003356.1-202ENST00000517910 RGL3Q3MIN7 710 aa24.76■■□□□ 1.55
AP003356.1-202ENST00000517910 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
AP003356.1-202ENST00000517910 PRAG1Q86YV5 1406 aa24.75■■□□□ 1.55
AP003356.1-202ENST00000517910 TMF1P82094 1093 aa24.75■■□□□ 1.55
AP003356.1-202ENST00000517910 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa24.75■■□□□ 1.55
AP003356.1-202ENST00000517910 DDX11L8A8MPP1 907 aa24.74■■□□□ 1.55
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