RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504440.1

NPHP3-AS1-202, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,507 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MS4A3Q96HJ5 214 aa9.43□□□□□ -0.9
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MAPKBP1O60336 1514 aa9.42□□□□□ -0.9
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ZMYND10O75800 440 aa9.41□□□□□ -0.9
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa9.41□□□□□ -0.9
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ADAMTS12P58397 1594 aa9.41□□□□□ -0.9
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CAMK2BQ13554 666 aa9.4□□□□□ -0.9
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SMYD5Q6GMV2 418 aa9.4□□□□□ -0.9
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SETD5Q9C0A6 1442 aa9.4□□□□□ -0.91
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 C14orf37Q86TY3 774 aa9.4□□□□□ -0.91
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TIAM1Q13009 1591 aa9.39□□□□□ -0.91
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa9.39□□□□□ -0.91
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FHAD1B1AJZ9 1412 aa9.39□□□□□ -0.91
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ERICH6Q7L0X2 663 aa9.37□□□□□ -0.91
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FHOD3Q2V2M9 1422 aa9.37□□□□□ -0.91
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa9.36□□□□□ -0.91
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP9.36□□□□□ -0.91
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CHD1O14646 1710 aa9.35□□□□□ -0.91
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TTLL13PA6NNM8 815 aa9.35□□□□□ -0.91
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa9.35□□□□□ -0.91
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SYNJ2O15056 1496 aa9.35□□□□□ -0.91
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 BARGINQ6ZT62 677 aa9.33□□□□□ -0.92
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GRIN2AQ12879 1464 aa9.33□□□□□ -0.92
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DPY19L2Q6NUT2 758 aa9.33□□□□□ -0.92
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MAP3K1Q13233 1512 aa9.33□□□□□ -0.92
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DPYSL4O14531 572 aa9.32□□□□□ -0.92
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GPIHBP1Q8IV16 184 aa9.32□□□□□ -0.92
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 EMILIN3Q9NT22 766 aa9.32□□□□□ -0.92
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TIE1P35590 1138 aa9.31□□□□□ -0.92
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 C19orf67A6NJJ6 358 aa9.3□□□□□ -0.92
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DSG2Q14126 1118 aa9.3□□□□□ -0.92
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TRIM35Q9UPQ4 493 aa9.3□□□□□ -0.92
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CLASP1Q7Z460 1538 aa9.29□□□□□ -0.92
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TRIM52Q96A61 297 aa9.29□□□□□ -0.92
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CEP170Q5SW79 1584 aa9.28□□□□□ -0.92
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NUP160Q12769 1436 aa9.28□□□□□ -0.92
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PTPRKQ15262 1439 aa9.28□□□□□ -0.92
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 IQGAP2Q13576 1575 aa9.27□□□□□ -0.93
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa9.27□□□□□ -0.93
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 AK7Q96M32 723 aa9.27□□□□□ -0.93
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CFAP43Q8NDM7 1665 aa9.26□□□□□ -0.93
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MICALL2Q8IY33 904 aa9.26□□□□□ -0.93
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 EFCAB5A4FU69 1503 aa9.26□□□□□ -0.93
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa9.26□□□□□ -0.93
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SAMD9Q5K651 1589 aa9.25□□□□□ -0.93
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MYT1Q01538 1121 aa9.25□□□□□ -0.93
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PDIA6Q15084 440 aa9.25□□□□□ -0.93
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FYCO1Q9BQS8 1478 aa9.24□□□□□ -0.93
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FGD6Q6ZV73 1430 aa9.24□□□□□ -0.93
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 MTUS2Q5JR59 1369 aa9.24□□□□□ -0.93
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TMC2Q8TDI7 906 aa9.24□□□□□ -0.93
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CHIC2Q9UKJ5 165 aa9.24□□□□□ -0.93
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ARHGEF11O15085 1522 aa9.23□□□□□ -0.93
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 UGGT2Q9NYU1 1516 aa9.23□□□□□ -0.93
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ANP32CO43423 234 aa9.23□□□□□ -0.93
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ARID3CA6NKF2 412 aa9.23□□□□□ -0.93
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 IL27Q8NEV9 243 aa9.23□□□□□ -0.93
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa9.23□□□□□ -0.93
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TONSLQ96HA7 1378 aa9.22□□□□□ -0.93
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FOXK1P85037 733 aa9.22□□□□□ -0.93
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa9.22□□□□□ -0.93
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa9.22□□□□□ -0.93
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa9.22□□□□□ -0.93
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ARXQ96QS3 562 aa9.22□□□□□ -0.93
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CCDC18Q5T9S5 1454 aa9.21□□□□□ -0.93
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ERCC6L2Q5T890 1561 aa9.21□□□□□ -0.93
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP9.2□□□□□ -0.94
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 KDM4CQ9H3R0 1056 aa9.2□□□□□ -0.94
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 TRIM66O15016 1216 aa9.2□□□□□ -0.94
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 PLPP6Q8IY26 295 aa9.2□□□□□ -0.94
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 DISP1Q96F81 1524 aa9.19□□□□□ -0.94
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 FMN1Q68DA7 1419 aa9.19□□□□□ -0.94
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 SHROOM2Q13796 1616 aa9.19□□□□□ -0.94
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 C2orf72A6NCS6 295 aa9.19□□□□□ -0.94
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 CCER2I3L3R5 266 aa9.19□□□□□ -0.94
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NAIPQ13075 1403 aa9.19□□□□□ -0.94
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 KIAA0556O60303 1618 aa9.18□□□□□ -0.94
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 NCOA2Q15596 1464 aa9.18□□□□□ -0.94
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 HFM1A2PYH4 1435 aa9.18□□□□□ -0.94
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 GRXCR2A6NFK2 248 aa9.18□□□□□ -0.94
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 JPH4Q96JJ6 628 aa9.18□□□□□ -0.94
NPHP3-AS1-202ENST00000504440 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.5 ms