RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494398.5

CERKL-213, Transcript of ceramide kinase like, humanhuman

TSL 2

Gene CERKL, Length 2,391 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERKL-213ENST00000494398 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa29.21■■■□□ 2.27
CERKL-213ENST00000494398 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
CERKL-213ENST00000494398 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa29.2■■■□□ 2.26
CERKL-213ENST00000494398 PLCH2O75038 1416 aa29.19■■■□□ 2.26
CERKL-213ENST00000494398 ZBED9Q6R2W3 1325 aa29.19■■■□□ 2.26
CERKL-213ENST00000494398 RGL3Q3MIN7 710 aa29.17■■■□□ 2.26
CERKL-213ENST00000494398 UNC13BO14795 1591 aa29.17■■■□□ 2.26
CERKL-213ENST00000494398 PLXNC1O60486 1568 aa29.15■■■□□ 2.26
CERKL-213ENST00000494398 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa29.15■■■□□ 2.26
CERKL-213ENST00000494398 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.14■■■□□ 2.26
CERKL-213ENST00000494398 DUOX2Q9NRD8 1548 aa29.13■■■□□ 2.25
CERKL-213ENST00000494398 PLA2R1Q13018 1463 aa29.12■■■□□ 2.25
CERKL-213ENST00000494398 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
CERKL-213ENST00000494398 PRAG1Q86YV5 1406 aa29.11■■■□□ 2.25
CERKL-213ENST00000494398 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
CERKL-213ENST00000494398 ERBINQ96RT1 1412 aa29.09■■■□□ 2.25
CERKL-213ENST00000494398 IQGAP3Q86VI3 1631 aa29.07■■■□□ 2.24
CERKL-213ENST00000494398 NBPF1Q3BBV0 1214 aa29.04■■■□□ 2.24
CERKL-213ENST00000494398 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa29.04■■■□□ 2.24
CERKL-213ENST00000494398 ERICH6BQ5W0A0 696 aa29.03■■■□□ 2.24
CERKL-213ENST00000494398 A2MP01023 1474 aa29.02■■■□□ 2.24
CERKL-213ENST00000494398 TMC1Q8TDI8 760 aa29.02■■■□□ 2.24
CERKL-213ENST00000494398 ABCC1P33527 1531 aa29.02■■■□□ 2.24
CERKL-213ENST00000494398 MAGI2Q86UL8 1455 aa29■■■□□ 2.23
CERKL-213ENST00000494398 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa29■■■□□ 2.23
CERKL-213ENST00000494398 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
CERKL-213ENST00000494398 ATP10AO60312 1499 aa28.99■■■□□ 2.23
CERKL-213ENST00000494398 GPRASP1Q5JY77 1395 aa28.98■■■□□ 2.23
CERKL-213ENST00000494398 AFAP1Q8N556 730 aa28.97■■■□□ 2.23
CERKL-213ENST00000494398 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
CERKL-213ENST00000494398 RALBP1Q15311 655 aa28.96■■■□□ 2.23
CERKL-213ENST00000494398 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.23
CERKL-213ENST00000494398 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
CERKL-213ENST00000494398 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa28.92■■■□□ 2.22
CERKL-213ENST00000494398 PPP4R2Q9NY27 417 aa28.91■■■□□ 2.22
CERKL-213ENST00000494398 ARAP3Q8WWN8 1544 aa28.9■■■□□ 2.22
CERKL-213ENST00000494398 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
CERKL-213ENST00000494398 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
CERKL-213ENST00000494398 WDR7Q9Y4E6 1490 aa28.87■■■□□ 2.21
CERKL-213ENST00000494398 MYT1Q01538 1121 aa28.86■■■□□ 2.21
CERKL-213ENST00000494398 TESK2Q96S53 571 aa28.86■■■□□ 2.21
CERKL-213ENST00000494398 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
CERKL-213ENST00000494398 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
CERKL-213ENST00000494398 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
CERKL-213ENST00000494398 E9PCH4 1651 aa28.85■■■□□ 2.21
CERKL-213ENST00000494398 NUDCQ9Y266 331 aa28.84■■■□□ 2.21
CERKL-213ENST00000494398 LAMC1P11047 1609 aa28.84■■■□□ 2.21
CERKL-213ENST00000494398 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa28.83■■■□□ 2.21
CERKL-213ENST00000494398 FANCAO15360 1455 aa28.81■■■□□ 2.2
CERKL-213ENST00000494398 MYT1LQ9UL68 1186 aa28.81■■■□□ 2.2
CERKL-213ENST00000494398 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
CERKL-213ENST00000494398 DISP3Q9P2K9 1392 aa28.81■■■□□ 2.2
CERKL-213ENST00000494398 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
CERKL-213ENST00000494398 TMF1P82094 1093 aa28.81■■■□□ 2.2
CERKL-213ENST00000494398 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
CERKL-213ENST00000494398 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa28.79■■■□□ 2.2
CERKL-213ENST00000494398 NLRP13Q86W25 1043 aa28.79■■■□□ 2.2
CERKL-213ENST00000494398 PARD3Q8TEW0 1356 aa28.77■■■□□ 2.2
CERKL-213ENST00000494398 KANK1Q14678 1352 aa28.76■■■□□ 2.19
CERKL-213ENST00000494398 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa28.75■■■□□ 2.19
CERKL-213ENST00000494398 KIF3BO15066 747 aa28.74■■■□□ 2.19
CERKL-213ENST00000494398 PANK3Q9H999 370 aa28.74■■■□□ 2.19
CERKL-213ENST00000494398 STAC3Q96MF2 364 aa28.73■■■□□ 2.19
CERKL-213ENST00000494398 TRPM2O94759 1503 aa28.73■■■□□ 2.19
CERKL-213ENST00000494398 PTPRTO14522 1441 aa28.73■■■□□ 2.19
CERKL-213ENST00000494398 SCAPERQ9BY12 1400 aa28.73■■■□□ 2.19
CERKL-213ENST00000494398 ATP7AQ04656 1500 aa28.73■■■□□ 2.19
CERKL-213ENST00000494398 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa28.72■■■□□ 2.19
CERKL-213ENST00000494398 ADGRL1O94910 1474 aa28.72■■■□□ 2.19
CERKL-213ENST00000494398 ABCA9Q8IUA7 1624 aa28.71■■■□□ 2.19
CERKL-213ENST00000494398 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.19
CERKL-213ENST00000494398 ASXL2Q76L83 1435 aa28.69■■■□□ 2.18
CERKL-213ENST00000494398 DEPDC5O75140 1603 aa28.68■■■□□ 2.18
CERKL-213ENST00000494398 RNF123Q5XPI4 1314 aa28.67■■■□□ 2.18
CERKL-213ENST00000494398 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
CERKL-213ENST00000494398 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
CERKL-213ENST00000494398 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa28.64■■■□□ 2.18
CERKL-213ENST00000494398 MADDQ8WXG6 1647 aa28.64■■■□□ 2.18
CERKL-213ENST00000494398 TET3O43151 1660 aa28.64■■■□□ 2.18
CERKL-213ENST00000494398 CLTCL1P53675 1640 aa28.62■■■□□ 2.17
CERKL-213ENST00000494398 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.61■■■□□ 2.17
CERKL-213ENST00000494398 VWDEQ8N2E2 1590 aa28.61■■■□□ 2.17
CERKL-213ENST00000494398 CEP152O94986 1710 aa28.61■■■□□ 2.17
CERKL-213ENST00000494398 CDCA8Q53HL2 280 aa28.59■■■□□ 2.17
CERKL-213ENST00000494398 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
CERKL-213ENST00000494398 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
CERKL-213ENST00000494398 KNSTRNQ9Y448 316 aa28.55■■■□□ 2.16
CERKL-213ENST00000494398 OSCARQ8IYS5 282 aa28.54■■■□□ 2.16
CERKL-213ENST00000494398 PDE3BQ13370 1112 aa28.53■■■□□ 2.16
CERKL-213ENST00000494398 IQGAP1P46940 1657 aa28.53■■■□□ 2.16
CERKL-213ENST00000494398 ANP32EQ9BTT0 268 aa28.52■■■□□ 2.16
CERKL-213ENST00000494398 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
CERKL-213ENST00000494398 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa28.5■■■□□ 2.15
CERKL-213ENST00000494398 CCDC136Q96JN2 1154 aa28.5■■■□□ 2.15
CERKL-213ENST00000494398 MROH1Q8NDA8 1641 aa28.5■■■□□ 2.15
CERKL-213ENST00000494398 INSRP06213 1382 aa28.48■■■□□ 2.15
CERKL-213ENST00000494398 NEURL4Q96JN8 1562 aa28.47■■■□□ 2.15
CERKL-213ENST00000494398 CFAP70Q5T0N1 1121 aa28.46■■■□□ 2.15
CERKL-213ENST00000494398 RCAN3Q9UKA8 241 aa28.46■■■□□ 2.15
CERKL-213ENST00000494398 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa28.46■■■□□ 2.15
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