RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480273.5

RTEL1-TNFRSF6B-201, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,751 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BICRAQ9NZM4 1560 aa21.46■■□□□ 1.03
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCDC146Q8IYE0 955 aa21.45■■□□□ 1.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PDE3BQ13370 1112 aa21.45■■□□□ 1.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CLUAP1Q96AJ1 413 aa21.44■■□□□ 1.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DNAJC5BQ9UF47 199 aa21.44■■□□□ 1.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RSPH6AQ9H0K4 717 aa21.44■■□□□ 1.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TPM4P67936 248 aa21.43■■□□□ 1.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SYNJ1O43426 1573 aa21.42■■□□□ 1.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC4A3P48751 1232 aa21.41■■□□□ 1.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GSE1Q14687 1217 aa21.41■■□□□ 1.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa21.41■■□□□ 1.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CLSTN1O94985 981 aa21.41■■□□□ 1.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PDE4AP27815 886 aa21.41■■□□□ 1.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAM69CQ0P6D2 419 aa21.41■■□□□ 1.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TOPBP1Q92547 1522 aa21.41■■□□□ 1.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DDX11L8A8MPP1 907 aa21.41■■□□□ 1.02
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IFT140Q96RY7 1462 aa21.41■■□□□ 1.02
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa21.39■■□□□ 1.02
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAM161AQ3B820 660 aa21.36■■□□□ 1.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EID1Q9Y6B2 187 aa21.36■■□□□ 1.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PHF14O94880 888 aa21.36■■□□□ 1.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HMMRO75330 724 aa21.35■■□□□ 1.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PRDM2Q13029 1718 aa21.34■■□□□ 1.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ST18O60284 1047 aa21.34■■□□□ 1.01
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 STK31Q9BXU1 1019 aa21.33■■□□□ 1.01
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GPATCH3Q96I76 525 aa21.32■■□□□ 1
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FANCIQ9NVI1 1328 aa21.32■■□□□ 1
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EXOC6Q8TAG9 804 aa21.32■■□□□ 1
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KIF15Q9NS87 1388 aa21.32■■□□□ 1
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PLIN1O60240 522 aa21.31■■□□□ 1
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.3■■□□□ 1
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 VSIG10Q8N0Z9 540 aa21.29■■□□□ 1
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.27■■□□□ 1
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP21.27■□□□□ 0.99
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TOP2BQ02880 1626 aa21.26■□□□□ 0.99
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZBED9Q6R2W3 1325 aa21.25■□□□□ 0.99
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.21■□□□□ 0.99
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TERF2IPQ9NYB0 399 aa21.2■□□□□ 0.98
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CHMP4AQ9BY43 222 aa21.19■□□□□ 0.98
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
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RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HDAC5Q9UQL6 1122 aa21.18■□□□□ 0.98
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SYNJ2O15056 1496 aa21.17■□□□□ 0.98
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NUTM2FA1L443 756 aa21.17■□□□□ 0.98
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TPM3P06753 285 aa21.17■□□□□ 0.98
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RASSF8Q8NHQ8 419 aa21.16■□□□□ 0.98
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.16■□□□□ 0.98
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa21.16■□□□□ 0.98
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RILPL2Q969X0 211 aa21.16■□□□□ 0.98
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 E9PSI1 815 aa21.15■□□□□ 0.98
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 COG6Q9Y2V7 657 aa21.15■□□□□ 0.98
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa21.14■□□□□ 0.98
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