RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468347.1

SHQ1-204, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 134 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-204ENST00000468347 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
SHQ1-204ENST00000468347 STK24Q9Y6E0 443 aa8.23□□□□□ -1.09
SHQ1-204ENST00000468347 TJAP1Q5JTD0 557 aa8.22□□□□□ -1.09
SHQ1-204ENST00000468347 ZDHHC16Q969W1 377 aa8.22□□□□□ -1.09
SHQ1-204ENST00000468347 JPH4Q96JJ6 628 aa8.22□□□□□ -1.09
SHQ1-204ENST00000468347 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa8.21□□□□□ -1.1
SHQ1-204ENST00000468347 DGAT1O75907 488 aa8.21□□□□□ -1.1
SHQ1-204ENST00000468347 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
SHQ1-204ENST00000468347 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
SHQ1-204ENST00000468347 HPS5Q9UPZ3 1129 aa8.21□□□□□ -1.1
SHQ1-204ENST00000468347 TRIM67Q6ZTA4 783 aa8.19□□□□□ -1.1
SHQ1-204ENST00000468347 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP8.18□□□□□ -1.1
SHQ1-204ENST00000468347 PPP1R37O75864 691 aa8.17□□□□□ -1.1
SHQ1-204ENST00000468347 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
SHQ1-204ENST00000468347 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
SHQ1-204ENST00000468347 KIAA1468Q9P260 1216 aa8.15□□□□□ -1.1
SHQ1-204ENST00000468347 COL9A1P20849 921 aa8.14□□□□□ -1.11
SHQ1-204ENST00000468347 LRCH3Q96II8 777 aa8.14□□□□□ -1.11
SHQ1-204ENST00000468347 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
SHQ1-204ENST00000468347 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
SHQ1-204ENST00000468347 TAOK2Q9UL54 1235 aa8.13□□□□□ -1.11
SHQ1-204ENST00000468347 MTRQ99707 1265 aa8.12□□□□□ -1.11
SHQ1-204ENST00000468347 IL21Q9HBE4 155 aa8.12□□□□□ -1.11
SHQ1-204ENST00000468347 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
SHQ1-204ENST00000468347 STK25O00506 426 aa8.09□□□□□ -1.11
SHQ1-204ENST00000468347 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
SHQ1-204ENST00000468347 ST8SIA5O15466 376 aa8.08□□□□□ -1.12
SHQ1-204ENST00000468347 PRR20EP86478 221 aa8.08□□□□□ -1.12
SHQ1-204ENST00000468347 PRR20CP86479 221 aa8.08□□□□□ -1.12
SHQ1-204ENST00000468347 PRR20DP86480 221 aa8.08□□□□□ -1.12
SHQ1-204ENST00000468347 PRR20BP86481 221 aa8.08□□□□□ -1.12
SHQ1-204ENST00000468347 PRR20AP86496 221 aa8.08□□□□□ -1.12
SHQ1-204ENST00000468347 AAASQ9NRG9 546 aa8.08□□□□□ -1.12
SHQ1-204ENST00000468347 PPP4CP60510 307 aa8.07□□□□□ -1.12
SHQ1-204ENST00000468347 ZNF516Q92618 1163 aa8.07□□□□□ -1.12
SHQ1-204ENST00000468347 FAM187AA6NFU0 413 aa8.06□□□□□ -1.12
SHQ1-204ENST00000468347 EVI5O60447 810 aa8.05□□□□□ -1.12
SHQ1-204ENST00000468347 GGCXP38435 758 aa8.04□□□□□ -1.12
SHQ1-204ENST00000468347 LCE2CQ5TA81 110 aa8.04□□□□□ -1.12
SHQ1-204ENST00000468347 FAM181BA6NEQ2 426 aa8.03□□□□□ -1.12
SHQ1-204ENST00000468347 NKX2-3Q8TAU0 364 aa8.03□□□□□ -1.12
SHQ1-204ENST00000468347 TMUB1Q9BVT8 246 aa8.02□□□□□ -1.13
SHQ1-204ENST00000468347 SLC19A1P41440 591 aa8.01□□□□□ -1.13
SHQ1-204ENST00000468347 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
SHQ1-204ENST00000468347 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa8□□□□□ -1.13
SHQ1-204ENST00000468347 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa7.99□□□□□ -1.13
SHQ1-204ENST00000468347 SPRYD7Q5W111 196 aa7.98□□□□□ -1.13
SHQ1-204ENST00000468347 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
SHQ1-204ENST00000468347 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
SHQ1-204ENST00000468347 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
SHQ1-204ENST00000468347 DACH1Q9UI36 760 aa7.96□□□□□ -1.14
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SHQ1-204ENST00000468347 FBXW7Q969H0 707 aa7.95□□□□□ -1.14
SHQ1-204ENST00000468347 GDF9O60383 454 aa7.94□□□□□ -1.14
SHQ1-204ENST00000468347 TNFRSF10AO00220 468 aa7.93□□□□□ -1.14
SHQ1-204ENST00000468347 TYW1BQ6NUM6 668 aa7.93□□□□□ -1.14
SHQ1-204ENST00000468347 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa7.92□□□□□ -1.14
SHQ1-204ENST00000468347 TERTO14746 1132 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
SHQ1-204ENST00000468347 ZNF697Q5TEC3 545 aa7.91□□□□□ -1.14
SHQ1-204ENST00000468347 SAMD7Q7Z3H4 446 aa7.91□□□□□ -1.14
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SHQ1-204ENST00000468347 LORP23490 312 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
SHQ1-204ENST00000468347 PHF14O94880 888 aa7.88□□□□□ -1.15
SHQ1-204ENST00000468347 APLP1P51693 650 aa7.88□□□□□ -1.15
SHQ1-204ENST00000468347 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa7.88□□□□□ -1.15
SHQ1-204ENST00000468347 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa7.88□□□□□ -1.15
SHQ1-204ENST00000468347 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa7.87□□□□□ -1.15
SHQ1-204ENST00000468347 MAP3K9P80192 1104 aa7.85□□□□□ -1.15
SHQ1-204ENST00000468347 LIAT1Q6ZQX7 453 aa7.85□□□□□ -1.15
SHQ1-204ENST00000468347 AVPP01185 164 aa7.84□□□□□ -1.15
SHQ1-204ENST00000468347 COPS2P61201 443 aa7.84□□□□□ -1.15
SHQ1-204ENST00000468347 PACS2Q86VP3 889 aa7.84□□□□□ -1.15
SHQ1-204ENST00000468347 AXIN1O15169 862 aa7.83□□□□□ -1.16
SHQ1-204ENST00000468347 TSKSQ9UJT2 592 aa7.83□□□□□ -1.16
SHQ1-204ENST00000468347 ZPR1O75312 459 aa7.82□□□□□ -1.16
SHQ1-204ENST00000468347 ANKLE1Q8NAG6 615 aa7.81□□□□□ -1.16
SHQ1-204ENST00000468347 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa7.81□□□□□ -1.16
SHQ1-204ENST00000468347 CTC1Q2NKJ3 1217 aa7.8□□□□□ -1.16
SHQ1-204ENST00000468347 KCTD17Q8N5Z5 321 aa7.8□□□□□ -1.16
SHQ1-204ENST00000468347 XP32Q5T750 250 aa7.79□□□□□ -1.16
SHQ1-204ENST00000468347 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
SHQ1-204ENST00000468347 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
SHQ1-204ENST00000468347 EPAS1Q99814 870 aa7.78□□□□□ -1.16
SHQ1-204ENST00000468347 SMAPO00193 183 aa7.77□□□□□ -1.17
SHQ1-204ENST00000468347 GMPRP36959 345 aa7.76□□□□□ -1.17
SHQ1-204ENST00000468347 LMOD2Q6P5Q4 547 aa7.76□□□□□ -1.17
SHQ1-204ENST00000468347 PKD2L1Q9P0L9 805 aa7.76□□□□□ -1.17
SHQ1-204ENST00000468347 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
SHQ1-204ENST00000468347 RNF40O75150 1001 aa7.75□□□□□ -1.17
SHQ1-204ENST00000468347 SLC16A10Q8TF71 515 aa7.73□□□□□ -1.17
SHQ1-204ENST00000468347 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa7.73□□□□□ -1.17
SHQ1-204ENST00000468347 KCNMA1Q12791 1236 aa7.72□□□□□ -1.17
SHQ1-204ENST00000468347 FOXC1Q12948 553 aa7.72□□□□□ -1.17
SHQ1-204ENST00000468347 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
SHQ1-204ENST00000468347 TRIM47Q96LD4 638 aa7.72□□□□□ -1.17
SHQ1-204ENST00000468347 TOR4AQ9NXH8 423 aa7.72□□□□□ -1.17
SHQ1-204ENST00000468347 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.18
SHQ1-204ENST00000468347 PDE4AP27815 886 aa7.71□□□□□ -1.18
SHQ1-204ENST00000468347 NECTIN2Q92692 538 aa7.71□□□□□ -1.18
SHQ1-204ENST00000468347 EMILIN3Q9NT22 766 aa7.71□□□□□ -1.18
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