RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465425.1

SYNE4-204, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

TSL 2

Gene SYNE4, Length 2,339 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-204ENST00000465425 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.9■■□□□ 1.58
SYNE4-204ENST00000465425 SHROOM2Q13796 1616 aa24.9■■□□□ 1.58
SYNE4-204ENST00000465425 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.88■■□□□ 1.57
SYNE4-204ENST00000465425 TMC1Q8TDI8 760 aa24.87■■□□□ 1.57
SYNE4-204ENST00000465425 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.87■■□□□ 1.57
SYNE4-204ENST00000465425 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.87■■□□□ 1.57
SYNE4-204ENST00000465425 ABCC2Q92887 1545 aa24.86■■□□□ 1.57
SYNE4-204ENST00000465425 UNC13BO14795 1591 aa24.84■■□□□ 1.57
SYNE4-204ENST00000465425 ANP32EQ9BTT0 268 aa24.84■■□□□ 1.57
SYNE4-204ENST00000465425 RGL3Q3MIN7 710 aa24.84■■□□□ 1.57
SYNE4-204ENST00000465425 PRAG1Q86YV5 1406 aa24.83■■□□□ 1.57
SYNE4-204ENST00000465425 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.83■■□□□ 1.57
SYNE4-204ENST00000465425 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
SYNE4-204ENST00000465425 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
SYNE4-204ENST00000465425 PLXNC1O60486 1568 aa24.81■■□□□ 1.56
SYNE4-204ENST00000465425 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
SYNE4-204ENST00000465425 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.79■■□□□ 1.56
SYNE4-204ENST00000465425 RALBP1Q15311 655 aa24.79■■□□□ 1.56
SYNE4-204ENST00000465425 NUDCQ9Y266 331 aa24.79■■□□□ 1.56
SYNE4-204ENST00000465425 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa24.78■■□□□ 1.56
SYNE4-204ENST00000465425 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
SYNE4-204ENST00000465425 PLA2R1Q13018 1463 aa24.77■■□□□ 1.56
SYNE4-204ENST00000465425 DUOX2Q9NRD8 1548 aa24.77■■□□□ 1.56
SYNE4-204ENST00000465425 IQGAP3Q86VI3 1631 aa24.76■■□□□ 1.55
SYNE4-204ENST00000465425 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
SYNE4-204ENST00000465425 A2MP01023 1474 aa24.74■■□□□ 1.55
SYNE4-204ENST00000465425 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa24.74■■□□□ 1.55
SYNE4-204ENST00000465425 ERBINQ96RT1 1412 aa24.74■■□□□ 1.55
SYNE4-204ENST00000465425 PLCH2O75038 1416 aa24.73■■□□□ 1.55
SYNE4-204ENST00000465425 NBPF1Q3BBV0 1214 aa24.73■■□□□ 1.55
SYNE4-204ENST00000465425 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa24.73■■□□□ 1.55
SYNE4-204ENST00000465425 E9PCH4 1651 aa24.72■■□□□ 1.55
SYNE4-204ENST00000465425 GPRASP1Q5JY77 1395 aa24.72■■□□□ 1.55
SYNE4-204ENST00000465425 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
SYNE4-204ENST00000465425 MAGI2Q86UL8 1455 aa24.68■■□□□ 1.54
SYNE4-204ENST00000465425 ATP10AO60312 1499 aa24.67■■□□□ 1.54
SYNE4-204ENST00000465425 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
SYNE4-204ENST00000465425 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
SYNE4-204ENST00000465425 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa24.67■■□□□ 1.54
SYNE4-204ENST00000465425 NLRP13Q86W25 1043 aa24.66■■□□□ 1.54
SYNE4-204ENST00000465425 LAMC1P11047 1609 aa24.65■■□□□ 1.54
SYNE4-204ENST00000465425 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
SYNE4-204ENST00000465425 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.64■■□□□ 1.54
SYNE4-204ENST00000465425 ABCC1P33527 1531 aa24.64■■□□□ 1.53
SYNE4-204ENST00000465425 RNF123Q5XPI4 1314 aa24.64■■□□□ 1.53
SYNE4-204ENST00000465425 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.53
SYNE4-204ENST00000465425 FANCIQ9NVI1 1328 aa24.63■■□□□ 1.53
SYNE4-204ENST00000465425 PARD3Q8TEW0 1356 aa24.63■■□□□ 1.53
SYNE4-204ENST00000465425 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.61■■□□□ 1.53
SYNE4-204ENST00000465425 TESK2Q96S53 571 aa24.61■■□□□ 1.53
SYNE4-204ENST00000465425 TMF1P82094 1093 aa24.6■■□□□ 1.53
SYNE4-204ENST00000465425 DISP3Q9P2K9 1392 aa24.6■■□□□ 1.53
SYNE4-204ENST00000465425 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
SYNE4-204ENST00000465425 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
SYNE4-204ENST00000465425 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.59■■□□□ 1.53
SYNE4-204ENST00000465425 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa24.59■■□□□ 1.53
SYNE4-204ENST00000465425 CCDC136Q96JN2 1154 aa24.56■■□□□ 1.52
SYNE4-204ENST00000465425 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.54■■□□□ 1.52
SYNE4-204ENST00000465425 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
SYNE4-204ENST00000465425 PANK3Q9H999 370 aa24.53■■□□□ 1.52
SYNE4-204ENST00000465425 AFAP1Q8N556 730 aa24.53■■□□□ 1.52
SYNE4-204ENST00000465425 MSH5O43196 834 aa24.52■■□□□ 1.52
SYNE4-204ENST00000465425 ARAP3Q8WWN8 1544 aa24.51■■□□□ 1.51
SYNE4-204ENST00000465425 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
SYNE4-204ENST00000465425 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
SYNE4-204ENST00000465425 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa24.49■■□□□ 1.51
SYNE4-204ENST00000465425 PDE3BQ13370 1112 aa24.48■■□□□ 1.51
SYNE4-204ENST00000465425 ERICH6Q7L0X2 663 aa24.47■■□□□ 1.51
SYNE4-204ENST00000465425 TRPM2O94759 1503 aa24.47■■□□□ 1.51
SYNE4-204ENST00000465425 STAC3Q96MF2 364 aa24.46■■□□□ 1.51
SYNE4-204ENST00000465425 KANK1Q14678 1352 aa24.44■■□□□ 1.5
SYNE4-204ENST00000465425 RRP1P56182 461 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
SYNE4-204ENST00000465425 MADDQ8WXG6 1647 aa24.44■■□□□ 1.5
SYNE4-204ENST00000465425 RCAN3Q9UKA8 241 aa24.44■■□□□ 1.5
SYNE4-204ENST00000465425 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.44■■□□□ 1.5
SYNE4-204ENST00000465425 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.43■■□□□ 1.5
SYNE4-204ENST00000465425 PTPRTO14522 1441 aa24.42■■□□□ 1.5
SYNE4-204ENST00000465425 FANCAO15360 1455 aa24.41■■□□□ 1.5
SYNE4-204ENST00000465425 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa24.41■■□□□ 1.5
SYNE4-204ENST00000465425 CDCA8Q53HL2 280 aa24.41■■□□□ 1.5
SYNE4-204ENST00000465425 INSRP06213 1382 aa24.41■■□□□ 1.5
SYNE4-204ENST00000465425 CEP152O94986 1710 aa24.4■■□□□ 1.5
SYNE4-204ENST00000465425 DEPDC5O75140 1603 aa24.4■■□□□ 1.5
SYNE4-204ENST00000465425 KNSTRNQ9Y448 316 aa24.39■■□□□ 1.5
SYNE4-204ENST00000465425 ATP7AQ04656 1500 aa24.39■■□□□ 1.5
SYNE4-204ENST00000465425 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa24.39■■□□□ 1.5
SYNE4-204ENST00000465425 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
SYNE4-204ENST00000465425 TET3O43151 1660 aa24.38■■□□□ 1.49
SYNE4-204ENST00000465425 CLTCL1P53675 1640 aa24.38■■□□□ 1.49
SYNE4-204ENST00000465425 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
SYNE4-204ENST00000465425 KIF3BO15066 747 aa24.37■■□□□ 1.49
SYNE4-204ENST00000465425 IQGAP1P46940 1657 aa24.37■■□□□ 1.49
SYNE4-204ENST00000465425 SCAPERQ9BY12 1400 aa24.37■■□□□ 1.49
SYNE4-204ENST00000465425 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
SYNE4-204ENST00000465425 ABCA9Q8IUA7 1624 aa24.35■■□□□ 1.49
SYNE4-204ENST00000465425 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
SYNE4-204ENST00000465425 ADGRL1O94910 1474 aa24.34■■□□□ 1.49
SYNE4-204ENST00000465425 CDCA7LQ96GN5 454 aa24.33■■□□□ 1.49
SYNE4-204ENST00000465425 EXOC6Q8TAG9 804 aa24.32■■□□□ 1.48
SYNE4-204ENST00000465425 VWDEQ8N2E2 1590 aa24.31■■□□□ 1.48
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