RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440184.1

CBX1P1-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 1, humanhuman

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Gene CBX1P1, Length 427 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P1-201ENST00000440184 NBR1Q14596 966 aa8.62□□□□□ -1.03
CBX1P1-201ENST00000440184 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa8.62□□□□□ -1.03
CBX1P1-201ENST00000440184 ERBB3P21860 1342 aa8.6□□□□□ -1.03
CBX1P1-201ENST00000440184 FAM205CA6NFA0 338 aa8.6□□□□□ -1.03
CBX1P1-201ENST00000440184 PHF14O94880 888 aa8.6□□□□□ -1.03
CBX1P1-201ENST00000440184 GRXCR2A6NFK2 248 aa8.59□□□□□ -1.03
CBX1P1-201ENST00000440184 OSBPP22059 807 aa8.59□□□□□ -1.03
CBX1P1-201ENST00000440184 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CBX1P1-201ENST00000440184 ZNF454Q8N9F8 522 aa8.59□□□□□ -1.03
CBX1P1-201ENST00000440184 BCANQ96GW7 911 aa8.59□□□□□ -1.03
CBX1P1-201ENST00000440184 HS3ST6Q96QI5 342 aa8.59□□□□□ -1.03
CBX1P1-201ENST00000440184 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CBX1P1-201ENST00000440184 MRC2Q9UBG0 1479 aa8.57□□□□□ -1.04
CBX1P1-201ENST00000440184 WDR62O43379 1518 aa8.56□□□□□ -1.04
CBX1P1-201ENST00000440184 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa8.56□□□□□ -1.04
CBX1P1-201ENST00000440184 TYW1BQ6NUM6 668 aa8.56□□□□□ -1.04
CBX1P1-201ENST00000440184 EPAS1Q99814 870 aa8.56□□□□□ -1.04
CBX1P1-201ENST00000440184 ADAM33Q9BZ11 813 aa8.56□□□□□ -1.04
CBX1P1-201ENST00000440184 PRDM2Q13029 1718 aa8.56□□□□□ -1.04
CBX1P1-201ENST00000440184 PDS5BQ9NTI5 1447 aa8.55□□□□□ -1.04
CBX1P1-201ENST00000440184 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CBX1P1-201ENST00000440184 POTEGQ6S5H5 508 aa8.55□□□□□ -1.04
CBX1P1-201ENST00000440184 POTEEQ6S8J3 1075 aa8.55□□□□□ -1.04
CBX1P1-201ENST00000440184 ZDHHC16Q969W1 377 aa8.55□□□□□ -1.04
CBX1P1-201ENST00000440184 POTEMA6NI47 508 aa8.54□□□□□ -1.04
CBX1P1-201ENST00000440184 FBXW7Q969H0 707 aa8.54□□□□□ -1.04
CBX1P1-201ENST00000440184 CEP164Q9UPV0 1460 aa8.53□□□□□ -1.04
CBX1P1-201ENST00000440184 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CBX1P1-201ENST00000440184 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP8.53□□□□□ -1.04
CBX1P1-201ENST00000440184 ZNF687Q8N1G0 1237 aa8.53□□□□□ -1.04
CBX1P1-201ENST00000440184 CADPSQ9ULU8 1353 aa8.52□□□□□ -1.05
CBX1P1-201ENST00000440184 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CBX1P1-201ENST00000440184 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CBX1P1-201ENST00000440184 BCL2L12Q9HB09 334 aa8.52□□□□□ -1.05
CBX1P1-201ENST00000440184 FANCD2Q9BXW9 1451 aa8.51□□□□□ -1.05
CBX1P1-201ENST00000440184 SMYD5Q6GMV2 418 aa8.51□□□□□ -1.05
CBX1P1-201ENST00000440184 CDHR5Q9HBB8 845 aa8.5□□□□□ -1.05
CBX1P1-201ENST00000440184 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CBX1P1-201ENST00000440184 MAP3K7O43318 606 aa8.49□□□□□ -1.05
CBX1P1-201ENST00000440184 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa8.49□□□□□ -1.05
CBX1P1-201ENST00000440184 GPR37O15354 613 aa8.48□□□□□ -1.05
CBX1P1-201ENST00000440184 LMOD2Q6P5Q4 547 aa8.48□□□□□ -1.05
CBX1P1-201ENST00000440184 AXIN2Q9Y2T1 843 aa8.48□□□□□ -1.05
CBX1P1-201ENST00000440184 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CBX1P1-201ENST00000440184 COL9A1P20849 921 aa8.47□□□□□ -1.05
CBX1P1-201ENST00000440184 PSEN2P49810 448 aa8.47□□□□□ -1.05
CBX1P1-201ENST00000440184 KCNK17Q96T54 332 aa8.47□□□□□ -1.05
CBX1P1-201ENST00000440184 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
CBX1P1-201ENST00000440184 CHD1O14646 1710 aa8.46□□□□□ -1.05
CBX1P1-201ENST00000440184 ARHGAP33O14559 1287 aa8.46□□□□□ -1.06
CBX1P1-201ENST00000440184 PTPREP23469 700 aa8.46□□□□□ -1.06
CBX1P1-201ENST00000440184 PBX2P40425 430 aa8.46□□□□□ -1.06
CBX1P1-201ENST00000440184 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa8.46□□□□□ -1.06
CBX1P1-201ENST00000440184 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa8.46□□□□□ -1.06
CBX1P1-201ENST00000440184 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa8.46□□□□□ -1.06
CBX1P1-201ENST00000440184 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa8.46□□□□□ -1.06
CBX1P1-201ENST00000440184 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa8.46□□□□□ -1.06
CBX1P1-201ENST00000440184 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CBX1P1-201ENST00000440184 DMRTA1Q5VZB9 504 aa8.45□□□□□ -1.06
CBX1P1-201ENST00000440184 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa8.44□□□□□ -1.06
CBX1P1-201ENST00000440184 PTGDRQ13258 359 aa8.44□□□□□ -1.06
CBX1P1-201ENST00000440184 CDAN1Q8IWY9 1227 aa8.44□□□□□ -1.06
CBX1P1-201ENST00000440184 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
CBX1P1-201ENST00000440184 NUTM2FA1L443 756 aa8.43□□□□□ -1.06
CBX1P1-201ENST00000440184 GPIHBP1Q8IV16 184 aa8.43□□□□□ -1.06
CBX1P1-201ENST00000440184 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
CBX1P1-201ENST00000440184 CFTRP13569 1480 aa8.42□□□□□ -1.06
CBX1P1-201ENST00000440184 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
CBX1P1-201ENST00000440184 ZBED2Q9BTP6 218 aa8.41□□□□□ -1.06
CBX1P1-201ENST00000440184 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP8.4□□□□□ -1.06
CBX1P1-201ENST00000440184 FCHSD2O94868 740 aa8.39□□□□□ -1.07
CBX1P1-201ENST00000440184 TTC13Q8NBP0 860 aa8.39□□□□□ -1.07
CBX1P1-201ENST00000440184 CERKQ8TCT0 537 aa8.39□□□□□ -1.07
CBX1P1-201ENST00000440184 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CBX1P1-201ENST00000440184 SLC4A5Q9BY07 1137 aa8.39□□□□□ -1.07
CBX1P1-201ENST00000440184 FAM198AQ9UFP1 575 aa8.39□□□□□ -1.07
CBX1P1-201ENST00000440184 CCDC88BA6NC98 1476 aa8.38□□□□□ -1.07
CBX1P1-201ENST00000440184 PROX2Q3B8N5 592 aa8.38□□□□□ -1.07
CBX1P1-201ENST00000440184 KCNH8Q96L42 1107 aa8.38□□□□□ -1.07
CBX1P1-201ENST00000440184 FECHP22830 423 aa8.37□□□□□ -1.07
CBX1P1-201ENST00000440184 PRSS12P56730 875 aa8.37□□□□□ -1.07
CBX1P1-201ENST00000440184 CDCA7LQ96GN5 454 aa8.37□□□□□ -1.07
CBX1P1-201ENST00000440184 TSKSQ9UJT2 592 aa8.37□□□□□ -1.07
CBX1P1-201ENST00000440184 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa8.37□□□□□ -1.07
CBX1P1-201ENST00000440184 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa8.36□□□□□ -1.07
CBX1P1-201ENST00000440184 TK2O00142 265 aa8.36□□□□□ -1.07
CBX1P1-201ENST00000440184 HIC1Q14526 733 aa8.36□□□□□ -1.07
CBX1P1-201ENST00000440184 PADI6Q6TGC4 694 aa8.36□□□□□ -1.07
CBX1P1-201ENST00000440184 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CBX1P1-201ENST00000440184 TOPBP1Q92547 1522 aa8.35□□□□□ -1.07
CBX1P1-201ENST00000440184 C3orf80F5H4A9 247 aa8.35□□□□□ -1.07
CBX1P1-201ENST00000440184 GNPATO15228 680 aa8.35□□□□□ -1.07
CBX1P1-201ENST00000440184 ZMYND10O75800 440 aa8.35□□□□□ -1.07
CBX1P1-201ENST00000440184 ADGRD1Q6QNK2 874 aa8.35□□□□□ -1.07
CBX1P1-201ENST00000440184 ARHGEF11O15085 1522 aa8.34□□□□□ -1.07
CBX1P1-201ENST00000440184 HRO43593 1189 aa8.34□□□□□ -1.07
CBX1P1-201ENST00000440184 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
CBX1P1-201ENST00000440184 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa8.34□□□□□ -1.07
CBX1P1-201ENST00000440184 PCDH10Q9P2E7 1040 aa8.34□□□□□ -1.07
CBX1P1-201ENST00000440184 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
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