RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397054.7

P3H1-204, Transcript of prolyl 3-hydroxylase 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene P3H1, Length 2,705 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H1-204ENST00000397054 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.29■■□□□ 1.64
P3H1-204ENST00000397054 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
P3H1-204ENST00000397054 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
P3H1-204ENST00000397054 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.29■■□□□ 1.64
P3H1-204ENST00000397054 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
P3H1-204ENST00000397054 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.27■■□□□ 1.64
P3H1-204ENST00000397054 SYCP2Q9BX26 1530 aa25.26■■□□□ 1.63
P3H1-204ENST00000397054 PLA2R1Q13018 1463 aa25.24■■□□□ 1.63
P3H1-204ENST00000397054 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.22■■□□□ 1.63
P3H1-204ENST00000397054 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25.22■■□□□ 1.63
P3H1-204ENST00000397054 PREX2Q70Z35 1606 aa25.21■■□□□ 1.63
P3H1-204ENST00000397054 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.21■■□□□ 1.63
P3H1-204ENST00000397054 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.2■■□□□ 1.62
P3H1-204ENST00000397054 PRAG1Q86YV5 1406 aa25.2■■□□□ 1.62
P3H1-204ENST00000397054 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.19■■□□□ 1.62
P3H1-204ENST00000397054 ERICH6Q7L0X2 663 aa25.18■■□□□ 1.62
P3H1-204ENST00000397054 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
P3H1-204ENST00000397054 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP25.16■■□□□ 1.62
P3H1-204ENST00000397054 RNF123Q5XPI4 1314 aa25.16■■□□□ 1.62
P3H1-204ENST00000397054 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
P3H1-204ENST00000397054 A2MP01023 1474 aa25.15■■□□□ 1.62
P3H1-204ENST00000397054 CHD1O14646 1710 aa25.13■■□□□ 1.61
P3H1-204ENST00000397054 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
P3H1-204ENST00000397054 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.13■■□□□ 1.61
P3H1-204ENST00000397054 DISP3Q9P2K9 1392 aa25.12■■□□□ 1.61
P3H1-204ENST00000397054 RALBP1Q15311 655 aa25.12■■□□□ 1.61
P3H1-204ENST00000397054 CCDC136Q96JN2 1154 aa25.12■■□□□ 1.61
P3H1-204ENST00000397054 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
P3H1-204ENST00000397054 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa25.11■■□□□ 1.61
P3H1-204ENST00000397054 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
P3H1-204ENST00000397054 TESK2Q96S53 571 aa25.1■■□□□ 1.61
P3H1-204ENST00000397054 E9PCH4 1651 aa25.09■■□□□ 1.61
P3H1-204ENST00000397054 BCL11AQ9H165 835 aa25.07■■□□□ 1.6
P3H1-204ENST00000397054 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
P3H1-204ENST00000397054 PARD3Q8TEW0 1356 aa25.05■■□□□ 1.6
P3H1-204ENST00000397054 CDCA7LQ96GN5 454 aa25.05■■□□□ 1.6
P3H1-204ENST00000397054 PANK3Q9H999 370 aa25.05■■□□□ 1.6
P3H1-204ENST00000397054 NLRP13Q86W25 1043 aa25.05■■□□□ 1.6
P3H1-204ENST00000397054 UNC13BO14795 1591 aa25.04■■□□□ 1.6
P3H1-204ENST00000397054 GPRASP1Q5JY77 1395 aa25.02■■□□□ 1.6
P3H1-204ENST00000397054 EXOC6Q8TAG9 804 aa25■■□□□ 1.59
P3H1-204ENST00000397054 MAST1Q9Y2H9 1570 aa25■■□□□ 1.59
P3H1-204ENST00000397054 ABCC2Q92887 1545 aa24.99■■□□□ 1.59
P3H1-204ENST00000397054 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
P3H1-204ENST00000397054 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.99■■□□□ 1.59
P3H1-204ENST00000397054 AFAP1Q8N556 730 aa24.98■■□□□ 1.59
P3H1-204ENST00000397054 RRP1P56182 461 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
P3H1-204ENST00000397054 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.97■■□□□ 1.59
P3H1-204ENST00000397054 ERBINQ96RT1 1412 aa24.97■■□□□ 1.59
P3H1-204ENST00000397054 SHROOM2Q13796 1616 aa24.97■■□□□ 1.59
P3H1-204ENST00000397054 IQGAP3Q86VI3 1631 aa24.97■■□□□ 1.59
P3H1-204ENST00000397054 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
P3H1-204ENST00000397054 RCAN3Q9UKA8 241 aa24.96■■□□□ 1.59
P3H1-204ENST00000397054 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
P3H1-204ENST00000397054 PLXNC1O60486 1568 aa24.94■■□□□ 1.58
P3H1-204ENST00000397054 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa24.93■■□□□ 1.58
P3H1-204ENST00000397054 DUOX2Q9NRD8 1548 aa24.93■■□□□ 1.58
P3H1-204ENST00000397054 PLCH2O75038 1416 aa24.93■■□□□ 1.58
P3H1-204ENST00000397054 PLIN1O60240 522 aa24.92■■□□□ 1.58
P3H1-204ENST00000397054 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
P3H1-204ENST00000397054 TMF1P82094 1093 aa24.92■■□□□ 1.58
P3H1-204ENST00000397054 MAGI2Q86UL8 1455 aa24.88■■□□□ 1.57
P3H1-204ENST00000397054 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
P3H1-204ENST00000397054 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
P3H1-204ENST00000397054 ATP10AO60312 1499 aa24.86■■□□□ 1.57
P3H1-204ENST00000397054 SKAP1Q86WV1 359 aa24.85■■□□□ 1.57
P3H1-204ENST00000397054 ADAMTS8Q9UP79 889 aa24.84■■□□□ 1.57
P3H1-204ENST00000397054 NBR1Q14596 966 aa24.84■■□□□ 1.57
P3H1-204ENST00000397054 ABCC1P33527 1531 aa24.83■■□□□ 1.57
P3H1-204ENST00000397054 LAMC1P11047 1609 aa24.82■■□□□ 1.56
P3H1-204ENST00000397054 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
P3H1-204ENST00000397054 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
P3H1-204ENST00000397054 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.8■■□□□ 1.56
P3H1-204ENST00000397054 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa24.79■■□□□ 1.56
P3H1-204ENST00000397054 PDE3BQ13370 1112 aa24.79■■□□□ 1.56
P3H1-204ENST00000397054 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
P3H1-204ENST00000397054 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.78■■□□□ 1.56
P3H1-204ENST00000397054 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
P3H1-204ENST00000397054 PPP2R1AP30153 589 aa24.77■■□□□ 1.56
P3H1-204ENST00000397054 KNSTRNQ9Y448 316 aa24.76■■□□□ 1.55
P3H1-204ENST00000397054 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
P3H1-204ENST00000397054 C20orf194Q5TEA3 1177 aa24.76■■□□□ 1.55
P3H1-204ENST00000397054 MADDQ8WXG6 1647 aa24.75■■□□□ 1.55
P3H1-204ENST00000397054 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
P3H1-204ENST00000397054 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
P3H1-204ENST00000397054 CRBNQ96SW2 442 aa24.74■■□□□ 1.55
P3H1-204ENST00000397054 KIF3BO15066 747 aa24.74■■□□□ 1.55
P3H1-204ENST00000397054 DEKP35659 375 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
P3H1-204ENST00000397054 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa24.72■■□□□ 1.55
P3H1-204ENST00000397054 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa24.72■■□□□ 1.55
P3H1-204ENST00000397054 CLTCL1P53675 1640 aa24.71■■□□□ 1.55
P3H1-204ENST00000397054 CFAP70Q5T0N1 1121 aa24.7■■□□□ 1.54
P3H1-204ENST00000397054 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
P3H1-204ENST00000397054 UGGT1Q9NYU2 1555 aa24.69■■□□□ 1.54
P3H1-204ENST00000397054 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.69■■□□□ 1.54
P3H1-204ENST00000397054 CCDC146Q8IYE0 955 aa24.68■■□□□ 1.54
P3H1-204ENST00000397054 TRPM2O94759 1503 aa24.68■■□□□ 1.54
P3H1-204ENST00000397054 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.67■■□□□ 1.54
P3H1-204ENST00000397054 IQGAP1P46940 1657 aa24.67■■□□□ 1.54
P3H1-204ENST00000397054 SCAPERQ9BY12 1400 aa24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.4 ms