RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393408.7

CBX1-202, Transcript of chromobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CBX1, Length 2,422 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-202ENST00000393408 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa25.54■■□□□ 1.68
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CBX1-202ENST00000393408 TMC1Q8TDI8 760 aa25.52■■□□□ 1.68
CBX1-202ENST00000393408 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
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CBX1-202ENST00000393408 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa25.49■■□□□ 1.67
CBX1-202ENST00000393408 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
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CBX1-202ENST00000393408 UNC13BO14795 1591 aa25.46■■□□□ 1.67
CBX1-202ENST00000393408 MAST1Q9Y2H9 1570 aa25.46■■□□□ 1.67
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CBX1-202ENST00000393408 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25.43■■□□□ 1.66
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CBX1-202ENST00000393408 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.4■■□□□ 1.66
CBX1-202ENST00000393408 PLA2R1Q13018 1463 aa25.39■■□□□ 1.66
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CBX1-202ENST00000393408 A2MP01023 1474 aa25.36■■□□□ 1.65
CBX1-202ENST00000393408 PARD3Q8TEW0 1356 aa25.36■■□□□ 1.65
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CBX1-202ENST00000393408 CHD1O14646 1710 aa25.33■■□□□ 1.64
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CBX1-202ENST00000393408 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
CBX1-202ENST00000393408 NLRP13Q86W25 1043 aa25.31■■□□□ 1.64
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CBX1-202ENST00000393408 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
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CBX1-202ENST00000393408 MAGI2Q86UL8 1455 aa25.27■■□□□ 1.64
CBX1-202ENST00000393408 ATP10AO60312 1499 aa25.26■■□□□ 1.64
CBX1-202ENST00000393408 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.26■■□□□ 1.631e-7■■□□□ 14.1
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CBX1-202ENST00000393408 ABCC2Q92887 1545 aa25.25■■□□□ 1.63
CBX1-202ENST00000393408 DISP3Q9P2K9 1392 aa25.24■■□□□ 1.63
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CBX1-202ENST00000393408 PDE3BQ13370 1112 aa25.21■■□□□ 1.63
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CBX1-202ENST00000393408 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
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CBX1-202ENST00000393408 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.08■■□□□ 1.61
CBX1-202ENST00000393408 CDCA7LQ96GN5 454 aa25.08■■□□□ 1.61
CBX1-202ENST00000393408 IQGAP1P46940 1657 aa25.08■■□□□ 1.61
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CBX1-202ENST00000393408 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.05■■□□□ 1.6
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CBX1-202ENST00000393408 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa25.03■■□□□ 1.6
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CBX1-202ENST00000393408 CEP152O94986 1710 aa25.02■■□□□ 1.6
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CBX1-202ENST00000393408 ARAP3Q8WWN8 1544 aa24.95■■□□□ 1.58
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CBX1-202ENST00000393408 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.93■■□□□ 1.58
CBX1-202ENST00000393408 PLIN1O60240 522 aa24.93■■□□□ 1.58
CBX1-202ENST00000393408 STAC3Q96MF2 364 aa24.93■■□□□ 1.58
CBX1-202ENST00000393408 KNSTRNQ9Y448 316 aa24.93■■□□□ 1.58
CBX1-202ENST00000393408 TET3O43151 1660 aa24.93■■□□□ 1.58
CBX1-202ENST00000393408 PPP2R1AP30153 589 aa24.92■■□□□ 1.58
CBX1-202ENST00000393408 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
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