RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392539.3

HOXD13-201, Transcript of homeobox D13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD13, Length 2,240 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13-201ENST00000392539 MYO5CQ9NQX4 1742 aa35.95■■■■□ 3.35
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HOXD13-201ENST00000392539 PLXNC1O60486 1568 aa35.91■■■■□ 3.34
HOXD13-201ENST00000392539 E9PCH4 1651 aa35.91■■■■□ 3.34
HOXD13-201ENST00000392539 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa35.91■■■■□ 3.34
HOXD13-201ENST00000392539 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa35.9■■■■□ 3.34
HOXD13-201ENST00000392539 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP35.9■■■■□ 3.34
HOXD13-201ENST00000392539 CCDC144AA2RUR9 1427 aa35.89■■■■□ 3.34
HOXD13-201ENST00000392539 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa35.89■■■■□ 3.34
HOXD13-201ENST00000392539 ABCC2Q92887 1545 aa35.89■■■■□ 3.34
HOXD13-201ENST00000392539 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP35.86■■■■□ 3.33
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HOXD13-201ENST00000392539 PRAG1Q86YV5 1406 aa35.84■■■■□ 3.33
HOXD13-201ENST00000392539 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP35.83■■■■□ 3.33
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HOXD13-201ENST00000392539 LAMC1P11047 1609 aa35.79■■■■□ 3.32
HOXD13-201ENST00000392539 TMC1Q8TDI8 760 aa35.79■■■■□ 3.32
HOXD13-201ENST00000392539 DUOX2Q9NRD8 1548 aa35.78■■■■□ 3.32
HOXD13-201ENST00000392539 NUDCQ9Y266 331 aa35.77■■■■□ 3.32
HOXD13-201ENST00000392539 PLA2R1Q13018 1463 aa35.77■■■■□ 3.32
HOXD13-201ENST00000392539 RALBP1Q15311 655 aa35.76■■■■□ 3.32
HOXD13-201ENST00000392539 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.76■■■■□ 3.32
HOXD13-201ENST00000392539 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP35.75■■■■□ 3.31
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HOXD13-201ENST00000392539 GPRASP1Q5JY77 1395 aa35.72■■■■□ 3.31
HOXD13-201ENST00000392539 MAGI2Q86UL8 1455 aa35.71■■■■□ 3.31
HOXD13-201ENST00000392539 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP35.71■■■■□ 3.31
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HOXD13-201ENST00000392539 RNF123Q5XPI4 1314 aa35.67■■■■□ 3.3
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HOXD13-201ENST00000392539 RGL3Q3MIN7 710 aa35.65■■■■□ 3.3
HOXD13-201ENST00000392539 FANCIQ9NVI1 1328 aa35.65■■■■□ 3.3
HOXD13-201ENST00000392539 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa35.65■■■■□ 3.3
HOXD13-201ENST00000392539 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa35.61■■■■□ 3.29
HOXD13-201ENST00000392539 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP35.6■■■■□ 3.29
HOXD13-201ENST00000392539 NBPF1Q3BBV0 1214 aa35.6■■■■□ 3.29
HOXD13-201ENST00000392539 ABCC1P33527 1531 aa35.6■■■■□ 3.29
HOXD13-201ENST00000392539 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa35.59■■■■□ 3.29
HOXD13-201ENST00000392539 PARD3Q8TEW0 1356 aa35.57■■■■□ 3.29
HOXD13-201ENST00000392539 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.55■■■■□ 3.28
HOXD13-201ENST00000392539 NLRP13Q86W25 1043 aa35.53■■■■□ 3.28
HOXD13-201ENST00000392539 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP35.51■■■■□ 3.28
HOXD13-201ENST00000392539 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa35.5■■■■□ 3.27
HOXD13-201ENST00000392539 TESK2Q96S53 571 aa35.49■■■■□ 3.27
HOXD13-201ENST00000392539 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP35.48■■■■□ 3.27
HOXD13-201ENST00000392539 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa35.46■■■■□ 3.27
HOXD13-201ENST00000392539 MSH5O43196 834 aa35.46■■■■□ 3.27
HOXD13-201ENST00000392539 ARAP3Q8WWN8 1544 aa35.46■■■■□ 3.27
HOXD13-201ENST00000392539 DISP3Q9P2K9 1392 aa35.46■■■■□ 3.27
HOXD13-201ENST00000392539 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa35.42■■■■□ 3.26
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HOXD13-201ENST00000392539 CCDC136Q96JN2 1154 aa35.37■■■■□ 3.25
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HOXD13-201ENST00000392539 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa35.37■■■■□ 3.25
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HOXD13-201ENST00000392539 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa35.36■■■■□ 3.25
HOXD13-201ENST00000392539 PDE3BQ13370 1112 aa35.35■■■■□ 3.25
HOXD13-201ENST00000392539 DEPDC5O75140 1603 aa35.35■■■■□ 3.25
HOXD13-201ENST00000392539 IQGAP1P46940 1657 aa35.34■■■■□ 3.25
HOXD13-201ENST00000392539 PANK3Q9H999 370 aa35.33■■■■□ 3.25
HOXD13-201ENST00000392539 TET3O43151 1660 aa35.29■■■■□ 3.24
HOXD13-201ENST00000392539 STAC3Q96MF2 364 aa35.29■■■■□ 3.24
HOXD13-201ENST00000392539 PTPRTO14522 1441 aa35.28■■■■□ 3.24
HOXD13-201ENST00000392539 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP35.28■■■■□ 3.24
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HOXD13-201ENST00000392539 RCAN3Q9UKA8 241 aa35.23■■■■□ 3.23
HOXD13-201ENST00000392539 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP35.23■■■■□ 3.23
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HOXD13-201ENST00000392539 WDR7Q9Y4E6 1490 aa35.2■■■■□ 3.23
HOXD13-201ENST00000392539 VWDEQ8N2E2 1590 aa35.19■■■■□ 3.22
HOXD13-201ENST00000392539 KANK1Q14678 1352 aa35.18■■■■□ 3.22
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HOXD13-201ENST00000392539 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa35.17■■■■□ 3.22
HOXD13-201ENST00000392539 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP35.17■■■■□ 3.22
HOXD13-201ENST00000392539 SYNMO15061 1565 aa35.16■■■■□ 3.22
HOXD13-201ENST00000392539 NEURL4Q96JN8 1562 aa35.15■■■■□ 3.22
HOXD13-201ENST00000392539 CDCA8Q53HL2 280 aa35.15■■■■□ 3.22
HOXD13-201ENST00000392539 FANCAO15360 1455 aa35.15■■■■□ 3.22
HOXD13-201ENST00000392539 KNSTRNQ9Y448 316 aa35.09■■■■□ 3.21
HOXD13-201ENST00000392539 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP35.06■■■■□ 3.2
HOXD13-201ENST00000392539 EXOC6Q8TAG9 804 aa35.06■■■■□ 3.2
HOXD13-201ENST00000392539 CDCA7LQ96GN5 454 aa35.05■■■■□ 3.2
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