RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375175.1

TMOD1-202, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TMOD1, Length 2,516 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-202ENST00000375175 CCDC141Q6ZP82 1450 aa17.81■□□□□ 0.44
TMOD1-202ENST00000375175 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa17.81■□□□□ 0.44
TMOD1-202ENST00000375175 RSPH4AQ5TD94 716 aa17.81■□□□□ 0.44
TMOD1-202ENST00000375175 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa17.81■□□□□ 0.44
TMOD1-202ENST00000375175 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
TMOD1-202ENST00000375175 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP17.8■□□□□ 0.441e-6■■□□□ 12.3
TMOD1-202ENST00000375175 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa17.79■□□□□ 0.44
TMOD1-202ENST00000375175 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
TMOD1-202ENST00000375175 RGL3Q3MIN7 710 aa17.78■□□□□ 0.44
TMOD1-202ENST00000375175 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa17.78■□□□□ 0.44
TMOD1-202ENST00000375175 FAM135AQ9P2D6 1515 aa17.77■□□□□ 0.44
TMOD1-202ENST00000375175 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
TMOD1-202ENST00000375175 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
TMOD1-202ENST00000375175 NUDCQ9Y266 331 aa17.76■□□□□ 0.43
TMOD1-202ENST00000375175 PREX2Q70Z35 1606 aa17.76■□□□□ 0.43
TMOD1-202ENST00000375175 CCDC144AA2RUR9 1427 aa17.75■□□□□ 0.43
TMOD1-202ENST00000375175 ARHGAP5Q13017 1502 aa17.74■□□□□ 0.43
TMOD1-202ENST00000375175 SYCP2Q9BX26 1530 aa17.73■□□□□ 0.43
TMOD1-202ENST00000375175 RALBP1Q15311 655 aa17.71■□□□□ 0.43
TMOD1-202ENST00000375175 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
TMOD1-202ENST00000375175 NBPF1Q3BBV0 1214 aa17.7■□□□□ 0.42
TMOD1-202ENST00000375175 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
TMOD1-202ENST00000375175 CHD1O14646 1710 aa17.69■□□□□ 0.42
TMOD1-202ENST00000375175 TTC37Q6PGP7 1564 aa17.69■□□□□ 0.42
TMOD1-202ENST00000375175 PRAG1Q86YV5 1406 aa17.69■□□□□ 0.42
TMOD1-202ENST00000375175 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP17.68■□□□□ 0.428e-6■□□□□ 8.1
TMOD1-202ENST00000375175 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP17.68■□□□□ 0.42
TMOD1-202ENST00000375175 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP17.67■□□□□ 0.42
TMOD1-202ENST00000375175 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa17.66■□□□□ 0.42
TMOD1-202ENST00000375175 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa17.65■□□□□ 0.42
TMOD1-202ENST00000375175 PLA2R1Q13018 1463 aa17.65■□□□□ 0.42
TMOD1-202ENST00000375175 MAST1Q9Y2H9 1570 aa17.64■□□□□ 0.41
TMOD1-202ENST00000375175 UNC13BO14795 1591 aa17.64■□□□□ 0.41
TMOD1-202ENST00000375175 CCDC136Q96JN2 1154 aa17.64■□□□□ 0.41
TMOD1-202ENST00000375175 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP17.63■□□□□ 0.41
TMOD1-202ENST00000375175 RNF123Q5XPI4 1314 aa17.63■□□□□ 0.41
TMOD1-202ENST00000375175 A2MP01023 1474 aa17.63■□□□□ 0.41
TMOD1-202ENST00000375175 MYO5CQ9NQX4 1742 aa17.62■□□□□ 0.41
TMOD1-202ENST00000375175 ERCC6L2Q5T890 1561 aa17.62■□□□□ 0.41
TMOD1-202ENST00000375175 NLRP13Q86W25 1043 aa17.62■□□□□ 0.41
TMOD1-202ENST00000375175 E9PCH4 1651 aa17.62■□□□□ 0.41
TMOD1-202ENST00000375175 ABCC2Q92887 1545 aa17.61■□□□□ 0.41
TMOD1-202ENST00000375175 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP17.61■□□□□ 0.41
TMOD1-202ENST00000375175 IL27Q8NEV9 243 aa17.61■□□□□ 0.41
TMOD1-202ENST00000375175 SHROOM2Q13796 1616 aa17.6■□□□□ 0.41
TMOD1-202ENST00000375175 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa17.6■□□□□ 0.41
TMOD1-202ENST00000375175 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
TMOD1-202ENST00000375175 DUOX2Q9NRD8 1548 aa17.59■□□□□ 0.41
TMOD1-202ENST00000375175 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
TMOD1-202ENST00000375175 IQGAP3Q86VI3 1631 aa17.59■□□□□ 0.41
TMOD1-202ENST00000375175 GPRASP1Q5JY77 1395 aa17.59■□□□□ 0.41
TMOD1-202ENST00000375175 PLXNC1O60486 1568 aa17.59■□□□□ 0.41
TMOD1-202ENST00000375175 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP17.58■□□□□ 0.41
TMOD1-202ENST00000375175 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
TMOD1-202ENST00000375175 PARD3Q8TEW0 1356 aa17.58■□□□□ 0.4
TMOD1-202ENST00000375175 DISP3Q9P2K9 1392 aa17.57■□□□□ 0.4
TMOD1-202ENST00000375175 TESK2Q96S53 571 aa17.57■□□□□ 0.4
TMOD1-202ENST00000375175 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP17.57■□□□□ 0.4
TMOD1-202ENST00000375175 TMF1P82094 1093 aa17.56■□□□□ 0.4
TMOD1-202ENST00000375175 PANK3Q9H999 370 aa17.56■□□□□ 0.4
TMOD1-202ENST00000375175 PLCH2O75038 1416 aa17.55■□□□□ 0.4
TMOD1-202ENST00000375175 ERBINQ96RT1 1412 aa17.55■□□□□ 0.4
TMOD1-202ENST00000375175 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
TMOD1-202ENST00000375175 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
TMOD1-202ENST00000375175 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
TMOD1-202ENST00000375175 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
TMOD1-202ENST00000375175 RCAN3Q9UKA8 241 aa17.52■□□□□ 0.4
TMOD1-202ENST00000375175 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa17.52■□□□□ 0.39
TMOD1-202ENST00000375175 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa17.52■□□□□ 0.39
TMOD1-202ENST00000375175 LAMC1P11047 1609 aa17.52■□□□□ 0.39
TMOD1-202ENST00000375175 ATP10AO60312 1499 aa17.51■□□□□ 0.39
TMOD1-202ENST00000375175 RRP1P56182 461 aaKnown RBP17.51■□□□□ 0.39
TMOD1-202ENST00000375175 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP17.51■□□□□ 0.39
TMOD1-202ENST00000375175 PDE3BQ13370 1112 aa17.5■□□□□ 0.39
TMOD1-202ENST00000375175 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP17.5■□□□□ 0.39
TMOD1-202ENST00000375175 MAGI2Q86UL8 1455 aa17.49■□□□□ 0.39
TMOD1-202ENST00000375175 AFAP1Q8N556 730 aa17.49■□□□□ 0.39
TMOD1-202ENST00000375175 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP17.48■□□□□ 0.39
TMOD1-202ENST00000375175 EXOC6Q8TAG9 804 aa17.48■□□□□ 0.39
TMOD1-202ENST00000375175 CDCA7LQ96GN5 454 aa17.48■□□□□ 0.39
TMOD1-202ENST00000375175 ABCC1P33527 1531 aa17.47■□□□□ 0.39
TMOD1-202ENST00000375175 KNSTRNQ9Y448 316 aa17.44■□□□□ 0.38
TMOD1-202ENST00000375175 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa17.43■□□□□ 0.38
TMOD1-202ENST00000375175 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
TMOD1-202ENST00000375175 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
TMOD1-202ENST00000375175 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa17.4■□□□□ 0.38
TMOD1-202ENST00000375175 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
TMOD1-202ENST00000375175 CDCA8Q53HL2 280 aa17.39■□□□□ 0.37
TMOD1-202ENST00000375175 ADAMTS8Q9UP79 889 aa17.39■□□□□ 0.37
TMOD1-202ENST00000375175 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP17.39■□□□□ 0.37
TMOD1-202ENST00000375175 PLIN1O60240 522 aa17.39■□□□□ 0.37
TMOD1-202ENST00000375175 CLASP1Q7Z460 1538 aa17.39■□□□□ 0.37
TMOD1-202ENST00000375175 MADDQ8WXG6 1647 aa17.38■□□□□ 0.37
TMOD1-202ENST00000375175 KANK1Q14678 1352 aa17.38■□□□□ 0.37
TMOD1-202ENST00000375175 KIF3BO15066 747 aa17.38■□□□□ 0.37
TMOD1-202ENST00000375175 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP17.38■□□□□ 0.37
TMOD1-202ENST00000375175 TRPM2O94759 1503 aa17.37■□□□□ 0.37
TMOD1-202ENST00000375175 NEFMP07197 916 aa17.37■□□□□ 0.37
TMOD1-202ENST00000375175 PPP2R1AP30153 589 aa17.37■□□□□ 0.37
TMOD1-202ENST00000375175 STAC3Q96MF2 364 aa17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59 ms