RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368815.6

EDRF1-205, Transcript of erythroid differentiation regulatory factor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene EDRF1, Length 4,123 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1-205ENST00000368815 MLH3Q9UHC1 1453 aa14.81□□□□□ -0.04
EDRF1-205ENST00000368815 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
EDRF1-205ENST00000368815 DAPK1P53355 1430 aa14.8□□□□□ -0.04
EDRF1-205ENST00000368815 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
EDRF1-205ENST00000368815 PREX2Q70Z35 1606 aa14.8□□□□□ -0.04
EDRF1-205ENST00000368815 ABCC1P33527 1531 aa14.79□□□□□ -0.04
EDRF1-205ENST00000368815 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa14.79□□□□□ -0.04
EDRF1-205ENST00000368815 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa14.79□□□□□ -0.04
EDRF1-205ENST00000368815 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
EDRF1-205ENST00000368815 MPHOSPH9Q99550 1183 aa14.79□□□□□ -0.04
EDRF1-205ENST00000368815 ATP7AQ04656 1500 aa14.78□□□□□ -0.04
EDRF1-205ENST00000368815 DMRT2Q9Y5R5 561 aa14.78□□□□□ -0.04
EDRF1-205ENST00000368815 PKD2Q13563 968 aa14.78□□□□□ -0.04
EDRF1-205ENST00000368815 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
EDRF1-205ENST00000368815 ABCC5O15440 1437 aa14.77□□□□□ -0.04
EDRF1-205ENST00000368815 CNTLNQ9NXG0 1405 aa14.77□□□□□ -0.04
EDRF1-205ENST00000368815 ZMYM3Q14202 1370 aa14.77□□□□□ -0.05
EDRF1-205ENST00000368815 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa14.77□□□□□ -0.05
EDRF1-205ENST00000368815 HECW2Q9P2P5 1572 aa14.76□□□□□ -0.05
EDRF1-205ENST00000368815 C14orf37Q86TY3 774 aa14.76□□□□□ -0.05
EDRF1-205ENST00000368815 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa14.76□□□□□ -0.05
EDRF1-205ENST00000368815 PTPN23Q9H3S7 1636 aa14.75□□□□□ -0.05
EDRF1-205ENST00000368815 ANKLE2Q86XL3 938 aa14.73□□□□□ -0.05
EDRF1-205ENST00000368815 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa14.73□□□□□ -0.05
EDRF1-205ENST00000368815 FAM9BQ8IZU0 186 aa14.73□□□□□ -0.05
EDRF1-205ENST00000368815 MBD5Q9P267 1494 aa14.72□□□□□ -0.05
EDRF1-205ENST00000368815 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa14.72□□□□□ -0.05
EDRF1-205ENST00000368815 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa14.7□□□□□ -0.06
EDRF1-205ENST00000368815 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa14.7□□□□□ -0.06
EDRF1-205ENST00000368815 DCAF11Q8TEB1 546 aa14.7□□□□□ -0.06
EDRF1-205ENST00000368815 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
EDRF1-205ENST00000368815 CARD11Q9BXL7 1154 aa14.7□□□□□ -0.06
EDRF1-205ENST00000368815 TNRQ92752 1358 aa14.69□□□□□ -0.06
EDRF1-205ENST00000368815 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP14.69□□□□□ -0.06
EDRF1-205ENST00000368815 TXNDC2Q86VQ3 553 aa14.69□□□□□ -0.06
EDRF1-205ENST00000368815 NCOA1Q15788 1441 aa14.69□□□□□ -0.06
EDRF1-205ENST00000368815 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa14.69□□□□□ -0.06
EDRF1-205ENST00000368815 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa14.69□□□□□ -0.06
EDRF1-205ENST00000368815 PTPRMP28827 1452 aa14.69□□□□□ -0.06
EDRF1-205ENST00000368815 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
EDRF1-205ENST00000368815 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
EDRF1-205ENST00000368815 L3MBTL2Q969R5 705 aa14.66□□□□□ -0.06
EDRF1-205ENST00000368815 SLC52A1Q9NWF4 448 aa14.66□□□□□ -0.06
EDRF1-205ENST00000368815 DUOX2Q9NRD8 1548 aa14.66□□□□□ -0.06
EDRF1-205ENST00000368815 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa14.65□□□□□ -0.06
EDRF1-205ENST00000368815 MRS2Q9HD23 443 aa14.65□□□□□ -0.06
EDRF1-205ENST00000368815 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
EDRF1-205ENST00000368815 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
EDRF1-205ENST00000368815 ROCK1Q13464 1354 aa14.63□□□□□ -0.07
EDRF1-205ENST00000368815 ARHGEF5Q12774 1597 aa14.62□□□□□ -0.07
EDRF1-205ENST00000368815 ERBINQ96RT1 1412 aa14.62□□□□□ -0.07
EDRF1-205ENST00000368815 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa14.62□□□□□ -0.07
EDRF1-205ENST00000368815 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
EDRF1-205ENST00000368815 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
EDRF1-205ENST00000368815 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa14.62□□□□□ -0.07
EDRF1-205ENST00000368815 TMC1Q8TDI8 760 aa14.61□□□□□ -0.07
EDRF1-205ENST00000368815 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa14.61□□□□□ -0.07
EDRF1-205ENST00000368815 KDM5CP41229 1560 aa14.61□□□□□ -0.07
EDRF1-205ENST00000368815 SHANK2Q9UPX8 1470 aa14.61□□□□□ -0.07
EDRF1-205ENST00000368815 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
EDRF1-205ENST00000368815 RICTORQ6R327 1708 aa14.6□□□□□ -0.07
EDRF1-205ENST00000368815 IDI1Q13907 227 aa14.6□□□□□ -0.07
EDRF1-205ENST00000368815 FAM135AQ9P2D6 1515 aa14.57□□□□□ -0.08
EDRF1-205ENST00000368815 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa14.57□□□□□ -0.08
EDRF1-205ENST00000368815 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
EDRF1-205ENST00000368815 MADDQ8WXG6 1647 aa14.56□□□□□ -0.08
EDRF1-205ENST00000368815 AGLP35573 1532 aa14.56□□□□□ -0.08
EDRF1-205ENST00000368815 ABCA6Q8N139 1617 aa14.56□□□□□ -0.08
EDRF1-205ENST00000368815 SLC26A8Q96RN1 970 aa14.56□□□□□ -0.08
EDRF1-205ENST00000368815 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
EDRF1-205ENST00000368815 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa14.54□□□□□ -0.08
EDRF1-205ENST00000368815 PTPRKQ15262 1439 aa14.54□□□□□ -0.08
EDRF1-205ENST00000368815 VGFO15240 615 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
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EDRF1-205ENST00000368815 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
EDRF1-205ENST00000368815 CCDC144AA2RUR9 1427 aa14.51□□□□□ -0.09
EDRF1-205ENST00000368815 KDM5DQ9BY66 1539 aa14.51□□□□□ -0.09
EDRF1-205ENST00000368815 ADGBQ8N7X0 1667 aa14.5□□□□□ -0.09
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EDRF1-205ENST00000368815 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
EDRF1-205ENST00000368815 HFM1A2PYH4 1435 aa14.49□□□□□ -0.09
EDRF1-205ENST00000368815 PIP4K2BP78356 416 aa14.49□□□□□ -0.09
EDRF1-205ENST00000368815 STK26Q9P289 416 aa14.49□□□□□ -0.09
EDRF1-205ENST00000368815 BCORL1Q5H9F3 1711 aa14.48□□□□□ -0.09
EDRF1-205ENST00000368815 NPATQ14207 1427 aa14.48□□□□□ -0.09
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EDRF1-205ENST00000368815 POGKQ9P215 609 aa14.46□□□□□ -0.09
EDRF1-205ENST00000368815 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
EDRF1-205ENST00000368815 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
EDRF1-205ENST00000368815 PZPP20742 1482 aa14.45□□□□□ -0.1
EDRF1-205ENST00000368815 MAST1Q9Y2H9 1570 aa14.44□□□□□ -0.1
EDRF1-205ENST00000368815 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP14.44□□□□□ -0.1
EDRF1-205ENST00000368815 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP14.44□□□□□ -0.1
EDRF1-205ENST00000368815 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP14.43□□□□□ -0.1
EDRF1-205ENST00000368815 TOM1O60784 492 aa14.43□□□□□ -0.1
EDRF1-205ENST00000368815 ATF3P18847 181 aa14.43□□□□□ -0.1
EDRF1-205ENST00000368815 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP14.43□□□□□ -0.1
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