RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367651.3

CITED2-201, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED2, Length 2,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2-201ENST00000367651 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.33■■□□□ 1.65
CITED2-201ENST00000367651 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
CITED2-201ENST00000367651 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
CITED2-201ENST00000367651 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
CITED2-201ENST00000367651 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.31■■□□□ 1.64
CITED2-201ENST00000367651 TSPY4P0CV99 314 aa25.27■■□□□ 1.64
CITED2-201ENST00000367651 TSPY10P0CW01 314 aa25.27■■□□□ 1.64
CITED2-201ENST00000367651 RALBP1Q15311 655 aa25.26■■□□□ 1.63
CITED2-201ENST00000367651 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.25■■□□□ 1.63
CITED2-201ENST00000367651 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.25■■□□□ 1.63
CITED2-201ENST00000367651 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa25.25■■□□□ 1.63
CITED2-201ENST00000367651 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
CITED2-201ENST00000367651 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
CITED2-201ENST00000367651 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa25.23■■□□□ 1.63
CITED2-201ENST00000367651 RRP1P56182 461 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
CITED2-201ENST00000367651 PRAG1Q86YV5 1406 aa25.22■■□□□ 1.63
CITED2-201ENST00000367651 PARD3Q8TEW0 1356 aa25.21■■□□□ 1.63
CITED2-201ENST00000367651 NBR1Q14596 966 aa25.2■■□□□ 1.63
CITED2-201ENST00000367651 EXOC6Q8TAG9 804 aa25.2■■□□□ 1.63
CITED2-201ENST00000367651 NBPF1Q3BBV0 1214 aa25.19■■□□□ 1.62
CITED2-201ENST00000367651 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.19■■□□□ 1.62
CITED2-201ENST00000367651 DEKP35659 375 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
CITED2-201ENST00000367651 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.17■■□□□ 1.62
CITED2-201ENST00000367651 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
CITED2-201ENST00000367651 NLRP13Q86W25 1043 aa25.16■■□□□ 1.62
CITED2-201ENST00000367651 RCAN3Q9UKA8 241 aa25.16■■□□□ 1.62
CITED2-201ENST00000367651 PLA2R1Q13018 1463 aa25.16■■□□□ 1.62
CITED2-201ENST00000367651 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
CITED2-201ENST00000367651 RGL3Q3MIN7 710 aa25.15■■□□□ 1.62
CITED2-201ENST00000367651 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
CITED2-201ENST00000367651 PREX2Q70Z35 1606 aa25.14■■□□□ 1.62
CITED2-201ENST00000367651 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25.14■■□□□ 1.62
CITED2-201ENST00000367651 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.13■■□□□ 1.61
CITED2-201ENST00000367651 A2MP01023 1474 aa25.13■■□□□ 1.61
CITED2-201ENST00000367651 CDCA7LQ96GN5 454 aa25.12■■□□□ 1.61
CITED2-201ENST00000367651 DISP3Q9P2K9 1392 aa25.12■■□□□ 1.61
CITED2-201ENST00000367651 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
CITED2-201ENST00000367651 SYCP2Q9BX26 1530 aa25.1■■□□□ 1.61
CITED2-201ENST00000367651 GPRASP1Q5JY77 1395 aa25.09■■□□□ 1.61
CITED2-201ENST00000367651 UNC13BO14795 1591 aa25.08■■□□□ 1.61
CITED2-201ENST00000367651 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
CITED2-201ENST00000367651 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.08■■□□□ 1.61
CITED2-201ENST00000367651 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.6
CITED2-201ENST00000367651 TESK2Q96S53 571 aa25.08■■□□□ 1.6
CITED2-201ENST00000367651 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.05■■□□□ 1.6
CITED2-201ENST00000367651 LAMC1P11047 1609 aa25.04■■□□□ 1.6
CITED2-201ENST00000367651 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.04■■□□□ 1.6
CITED2-201ENST00000367651 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
CITED2-201ENST00000367651 PDE3BQ13370 1112 aa25.03■■□□□ 1.6
CITED2-201ENST00000367651 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
CITED2-201ENST00000367651 PLIN1O60240 522 aa25.02■■□□□ 1.6
CITED2-201ENST00000367651 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
CITED2-201ENST00000367651 PANK3Q9H999 370 aa25.01■■□□□ 1.59
CITED2-201ENST00000367651 ERBINQ96RT1 1412 aa25.01■■□□□ 1.59
CITED2-201ENST00000367651 MAST1Q9Y2H9 1570 aa25.01■■□□□ 1.59
CITED2-201ENST00000367651 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25■■□□□ 1.59
CITED2-201ENST00000367651 IQGAP3Q86VI3 1631 aa24.99■■□□□ 1.59
CITED2-201ENST00000367651 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
CITED2-201ENST00000367651 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.99■■□□□ 1.59
CITED2-201ENST00000367651 CHD1O14646 1710 aa24.99■■□□□ 1.59
CITED2-201ENST00000367651 PDE4AP27815 886 aa24.98■■□□□ 1.59
CITED2-201ENST00000367651 SKAP1Q86WV1 359 aa24.98■■□□□ 1.59
CITED2-201ENST00000367651 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.96■■□□□ 1.59
CITED2-201ENST00000367651 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.96■■□□□ 1.592e-6■■□□□ 13.1
CITED2-201ENST00000367651 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
CITED2-201ENST00000367651 PLXNC1O60486 1568 aa24.94■■□□□ 1.58
CITED2-201ENST00000367651 BACH2Q9BYV9 841 aa24.94■■□□□ 1.58
CITED2-201ENST00000367651 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa24.94■■□□□ 1.58
CITED2-201ENST00000367651 CRBNQ96SW2 442 aa24.93■■□□□ 1.58
CITED2-201ENST00000367651 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
CITED2-201ENST00000367651 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa24.91■■□□□ 1.58
CITED2-201ENST00000367651 INSRP06213 1382 aa24.9■■□□□ 1.58
CITED2-201ENST00000367651 TMF1P82094 1093 aa24.89■■□□□ 1.58
CITED2-201ENST00000367651 C20orf194Q5TEA3 1177 aa24.88■■□□□ 1.57
CITED2-201ENST00000367651 MAGI2Q86UL8 1455 aa24.88■■□□□ 1.57
CITED2-201ENST00000367651 ATP10AO60312 1499 aa24.88■■□□□ 1.57
CITED2-201ENST00000367651 MS4A1P11836 297 aa24.87■■□□□ 1.57
CITED2-201ENST00000367651 ADAMTS8Q9UP79 889 aa24.87■■□□□ 1.57
CITED2-201ENST00000367651 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.86■■□□□ 1.57
CITED2-201ENST00000367651 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
CITED2-201ENST00000367651 DUOX2Q9NRD8 1548 aa24.85■■□□□ 1.57
CITED2-201ENST00000367651 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa24.83■■□□□ 1.57
CITED2-201ENST00000367651 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
CITED2-201ENST00000367651 MADDQ8WXG6 1647 aa24.81■■□□□ 1.56
CITED2-201ENST00000367651 IQGAP1P46940 1657 aa24.8■■□□□ 1.56
CITED2-201ENST00000367651 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.8■■□□□ 1.56
CITED2-201ENST00000367651 PPP2R1AP30153 589 aa24.79■■□□□ 1.56
CITED2-201ENST00000367651 SHROOM2Q13796 1616 aa24.76■■□□□ 1.55
CITED2-201ENST00000367651 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
CITED2-201ENST00000367651 KDM2BQ8NHM5 1336 aa24.75■■□□□ 1.55
CITED2-201ENST00000367651 DUSP27Q5VZP5 1158 aa24.75■■□□□ 1.55
CITED2-201ENST00000367651 ABCC2Q92887 1545 aa24.74■■□□□ 1.55
CITED2-201ENST00000367651 ZNF521Q96K83 1311 aa24.73■■□□□ 1.55
CITED2-201ENST00000367651 KNSTRNQ9Y448 316 aa24.73■■□□□ 1.55
CITED2-201ENST00000367651 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.72■■□□□ 1.55
CITED2-201ENST00000367651 SYNMO15061 1565 aa24.71■■□□□ 1.55
CITED2-201ENST00000367651 MYOM1P52179 1685 aa24.71■■□□□ 1.55
CITED2-201ENST00000367651 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa24.71■■□□□ 1.55
CITED2-201ENST00000367651 NEFMP07197 916 aa24.71■■□□□ 1.55
CITED2-201ENST00000367651 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP24.7■■□□□ 1.54
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