RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366554.2

OPN3-201, Transcript of opsin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN3, Length 2,620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-201ENST00000366554 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa28.25■■■□□ 2.11
OPN3-201ENST00000366554 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
OPN3-201ENST00000366554 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.23■■■□□ 2.11
OPN3-201ENST00000366554 USP19O94966 1318 aa28.22■■■□□ 2.11
OPN3-201ENST00000366554 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa28.22■■■□□ 2.11
OPN3-201ENST00000366554 RRP9O43818 475 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
OPN3-201ENST00000366554 CLCN1P35523 988 aa28.2■■■□□ 2.1
OPN3-201ENST00000366554 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
OPN3-201ENST00000366554 NESP48681 1621 aa28.19■■■□□ 2.1
OPN3-201ENST00000366554 RGS3P49796 1198 aa28.18■■■□□ 2.1
OPN3-201ENST00000366554 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
OPN3-201ENST00000366554 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.17■■■□□ 2.1
OPN3-201ENST00000366554 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
OPN3-201ENST00000366554 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
OPN3-201ENST00000366554 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.15■■■□□ 2.1
OPN3-201ENST00000366554 TOPBP1Q92547 1522 aa28.15■■■□□ 2.1
OPN3-201ENST00000366554 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP28.14■■■□□ 2.09
OPN3-201ENST00000366554 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
OPN3-201ENST00000366554 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
OPN3-201ENST00000366554 PKD2Q13563 968 aa28.12■■■□□ 2.09
OPN3-201ENST00000366554 ANTXR1Q9H6X2 564 aa28.12■■■□□ 2.09
OPN3-201ENST00000366554 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
OPN3-201ENST00000366554 FSD2A1L4K1 749 aa28.11■■■□□ 2.09
OPN3-201ENST00000366554 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa28.11■■■□□ 2.09
OPN3-201ENST00000366554 BECN1Q14457 450 aa28.09■■■□□ 2.09
OPN3-201ENST00000366554 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
OPN3-201ENST00000366554 DUSP27Q5VZP5 1158 aa28.09■■■□□ 2.09
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OPN3-201ENST00000366554 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
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OPN3-201ENST00000366554 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
OPN3-201ENST00000366554 SEC24BO95487 1268 aa28.03■■■□□ 2.08
OPN3-201ENST00000366554 PANK2Q9BZ23 570 aa28.02■■■□□ 2.08
OPN3-201ENST00000366554 NLRP1Q9C000 1473 aa28.01■■■□□ 2.07
OPN3-201ENST00000366554 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28■■■□□ 2.07
OPN3-201ENST00000366554 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
OPN3-201ENST00000366554 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa28■■■□□ 2.07
OPN3-201ENST00000366554 WDR62O43379 1518 aa28■■■□□ 2.07
OPN3-201ENST00000366554 ZNF521Q96K83 1311 aa27.99■■■□□ 2.07
OPN3-201ENST00000366554 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
OPN3-201ENST00000366554 ADAMTS8Q9UP79 889 aa27.98■■■□□ 2.07
OPN3-201ENST00000366554 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa27.97■■■□□ 2.07
OPN3-201ENST00000366554 ARXQ96QS3 562 aa27.95■■■□□ 2.06
OPN3-201ENST00000366554 ARID3CA6NKF2 412 aa27.94■■■□□ 2.06
OPN3-201ENST00000366554 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
OPN3-201ENST00000366554 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.94■■■□□ 2.06
OPN3-201ENST00000366554 ADGRL2O95490 1459 aa27.93■■■□□ 2.06
OPN3-201ENST00000366554 IGHDP01880 384 aa27.93■■■□□ 2.06
OPN3-201ENST00000366554 GOLGA2Q08379 1002 aa27.92■■■□□ 2.06
OPN3-201ENST00000366554 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa27.91■■■□□ 2.06
OPN3-201ENST00000366554 MCM4P33991 863 aa27.9■■■□□ 2.06
OPN3-201ENST00000366554 ADGBQ8N7X0 1667 aa27.9■■■□□ 2.06
OPN3-201ENST00000366554 MRE11P49959 708 aa27.88■■■□□ 2.05
OPN3-201ENST00000366554 TBC1D2Q9BYX2 928 aa27.88■■■□□ 2.05
OPN3-201ENST00000366554 SLFN5Q08AF3 891 aa27.88■■■□□ 2.05
OPN3-201ENST00000366554 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
OPN3-201ENST00000366554 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
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OPN3-201ENST00000366554 PANK3Q9H999 370 aa27.86■■■□□ 2.05
OPN3-201ENST00000366554 ESPNB1AK53 854 aa27.85■■■□□ 2.05
OPN3-201ENST00000366554 TBC1D32Q96NH3 1257 aa27.85■■■□□ 2.05
OPN3-201ENST00000366554 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa27.85■■■□□ 2.05
OPN3-201ENST00000366554 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa27.84■■■□□ 2.05
OPN3-201ENST00000366554 CEP170Q5SW79 1584 aa27.83■■■□□ 2.05
OPN3-201ENST00000366554 ERBB4Q15303 1308 aa27.82■■■□□ 2.04
OPN3-201ENST00000366554 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.81■■■□□ 2.04
OPN3-201ENST00000366554 MYH16Q9H6N6 1097 aa27.81■■■□□ 2.04
OPN3-201ENST00000366554 NUP155O75694 1391 aa27.81■■■□□ 2.04
OPN3-201ENST00000366554 DISP3Q9P2K9 1392 aa27.81■■■□□ 2.04
OPN3-201ENST00000366554 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa27.8■■■□□ 2.04
OPN3-201ENST00000366554 TRAK2O60296 914 aa27.8■■■□□ 2.04
OPN3-201ENST00000366554 TESK2Q96S53 571 aa27.8■■■□□ 2.04
OPN3-201ENST00000366554 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa27.79■■■□□ 2.04
OPN3-201ENST00000366554 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP27.79■■■□□ 2.04
OPN3-201ENST00000366554 BCAR3O75815 825 aa27.79■■■□□ 2.04
OPN3-201ENST00000366554 PRAG1Q86YV5 1406 aa27.78■■■□□ 2.04
OPN3-201ENST00000366554 IQGAP2Q13576 1575 aa27.78■■■□□ 2.04
OPN3-201ENST00000366554 GRPEL1Q9HAV7 217 aa27.78■■■□□ 2.04
OPN3-201ENST00000366554 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
OPN3-201ENST00000366554 KDM5DQ9BY66 1539 aa27.77■■■□□ 2.04
OPN3-201ENST00000366554 GPRASP1Q5JY77 1395 aa27.77■■■□□ 2.04
OPN3-201ENST00000366554 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
OPN3-201ENST00000366554 TPM2P07951 284 aa27.77■■■□□ 2.04
OPN3-201ENST00000366554 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP27.77■■■□□ 2.045e-6■□□□□ 10.2
OPN3-201ENST00000366554 PDCL3Q9H2J4 239 aa27.77■■■□□ 2.04
OPN3-201ENST00000366554 CGNL1Q0VF96 1302 aa27.77■■■□□ 2.04
OPN3-201ENST00000366554 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.04
OPN3-201ENST00000366554 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
OPN3-201ENST00000366554 CROCC2H7BZ55 1655 aa27.75■■■□□ 2.03
OPN3-201ENST00000366554 NBPF1Q3BBV0 1214 aa27.75■■■□□ 2.03
OPN3-201ENST00000366554 ZMYM3Q14202 1370 aa27.74■■■□□ 2.03
OPN3-201ENST00000366554 CLUAP1Q96AJ1 413 aa27.74■■■□□ 2.03
OPN3-201ENST00000366554 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP27.74■■■□□ 2.03
OPN3-201ENST00000366554 PDE3AQ14432 1141 aa27.73■■■□□ 2.03
OPN3-201ENST00000366554 PPP2R1AP30153 589 aa27.72■■■□□ 2.03
OPN3-201ENST00000366554 CHMP5Q9NZZ3 219 aa27.72■■■□□ 2.03
OPN3-201ENST00000366554 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
OPN3-201ENST00000366554 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.03
OPN3-201ENST00000366554 ERBINQ96RT1 1412 aa27.69■■■□□ 2.02
OPN3-201ENST00000366554 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
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