RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362861.1

RNU6-1079P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1079, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1079P, Length 110 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1079P-201ENST00000362861 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP2.86□□□□□ -1.95
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa2.86□□□□□ -1.95
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MICALL2Q8IY33 904 aa2.85□□□□□ -1.95
RNU6-1079P-201ENST00000362861 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.95
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MSTNO14793 375 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NUBP1P53384 320 aa2.83□□□□□ -1.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PYGBP11216 843 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 BCAMP50895 628 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP2.82□□□□□ -1.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 WBP1LQ9NX94 342 aa2.82□□□□□ -1.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SOWAHBA6NEL2 793 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 AXIN1O15169 862 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SLC34A2O95436 690 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP2.81□□□□□ -1.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NPAS3Q8IXF0 933 aa2.81□□□□□ -1.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP2.81□□□□□ -1.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CTC1Q2NKJ3 1217 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MIER1Q8N108 512 aa2.8□□□□□ -1.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SLURP2P0DP57 97 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GGCXP38435 758 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PSEN1P49768 467 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SENP2Q9HC62 589 aa2.79□□□□□ -1.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SPDYE4A6NLX3 237 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 AVPP01185 164 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KANK3Q6NY19 840 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TRIM47Q96LD4 638 aa2.78□□□□□ -1.96
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SPOCK3Q9BQ16 436 aa2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TNFRSF10AO00220 468 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GDF9O60383 454 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SLC19A1P41440 591 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TJAP1Q5JTD0 557 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CABP2Q9NPB3 220 aa2.76□□□□□ -1.97
RNU6-1079P-201ENST00000362861 IRS1P35568 1242 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SPRYD7Q5W111 196 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZBED2Q9BTP6 218 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1079P-201ENST00000362861 H3BM21 787 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FZD5Q13467 585 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1079P-201ENST00000362861 GALNT6Q8NCL4 622 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KIFC2Q96AC6 838 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TMUB1Q9BVT8 246 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ADAMTS8Q9UP79 889 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ERBB4Q15303 1308 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1079P-201ENST00000362861 IL21Q9HBE4 155 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF697Q5TEC3 545 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PROCP04070 461 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LAPTM4BQ86VI4 370 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-1079P-201ENST00000362861 BCL2L12Q9HB09 334 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PTPREP23469 700 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-1079P-201ENST00000362861 VEGFBP49765 207 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LMOD2Q6P5Q4 547 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MTRQ99707 1265 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-1079P-201ENST00000362861 HPS5Q9UPZ3 1129 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-1079P-201ENST00000362861 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP2.67□□□□□ -1.98
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RABGEF1Q9UJ41 708 aa2.67□□□□□ -1.98
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TXKP42681 527 aa2.66□□□□□ -1.98
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KIF3CO14782 793 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-1079P-201ENST00000362861 KRTAP1-1Q07627 177 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PLCD3Q8N3E9 789 aa2.65□□□□□ -1.99
RNU6-1079P-201ENST00000362861 VSIG8P0DPA2 414 aa2.64□□□□□ -1.99
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
RNU6-1079P-201ENST00000362861 C2orf72A6NCS6 295 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZBTB22O15209 634 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ITGB2P05107 769 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-1079P-201ENST00000362861 BAG6P46379 1132 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF516Q92618 1163 aa2.63□□□□□ -1.99
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NKX2-3Q8TAU0 364 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LRCH3Q96II8 777 aa2.62□□□□□ -1.99
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FURINP09958 794 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-1079P-201ENST00000362861 MARSP56192 900 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LCE5AQ5TCM9 118 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-1079P-201ENST00000362861 NBPF11Q86T75 865 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-1079P-201ENST00000362861 TOR4AQ9NXH8 423 aa2.61□□□□□ -1.99
RNU6-1079P-201ENST00000362861 RNF223E7ERA6 249 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PPP4CP60510 307 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-1079P-201ENST00000362861 SCO2A0A1W2PP80 73 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1079P-201ENST00000362861 LIAT1Q6ZQX7 453 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1079P-201ENST00000362861 EFCAB3Q8N7B9 438 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ZNF454Q8N9F8 522 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1079P-201ENST00000362861 DCAF5Q96JK2 942 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PKD2L1Q9P0L9 805 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1079P-201ENST00000362861 PAX4O43316 350 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-1079P-201ENST00000362861 FOXC1Q12948 553 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-1079P-201ENST00000362861 CYP4X1Q8N118 509 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-1079P-201ENST00000362861 ANKLE1Q8NAG6 615 aa2.58□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.8 ms