RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362832.1

RNU6-170P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 170, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-170P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-170P-201ENST00000362832 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa4.38□□□□□ -1.71
RNU6-170P-201ENST00000362832 STK25O00506 426 aa4.38□□□□□ -1.71
RNU6-170P-201ENST00000362832 PPP1R18Q6NYC8 613 aa4.38□□□□□ -1.71
RNU6-170P-201ENST00000362832 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP4.38□□□□□ -1.71
RNU6-170P-201ENST00000362832 HPS5Q9UPZ3 1129 aa4.37□□□□□ -1.71
RNU6-170P-201ENST00000362832 MYT1Q01538 1121 aa4.36□□□□□ -1.71
RNU6-170P-201ENST00000362832 PKDCCQ504Y2 493 aa4.36□□□□□ -1.71
RNU6-170P-201ENST00000362832 TJAP1Q5JTD0 557 aa4.35□□□□□ -1.71
RNU6-170P-201ENST00000362832 LRCH3Q96II8 777 aa4.35□□□□□ -1.71
RNU6-170P-201ENST00000362832 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
RNU6-170P-201ENST00000362832 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
RNU6-170P-201ENST00000362832 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
RNU6-170P-201ENST00000362832 KIAA1468Q9P260 1216 aa4.35□□□□□ -1.71
RNU6-170P-201ENST00000362832 DGAT1O75907 488 aa4.34□□□□□ -1.71
RNU6-170P-201ENST00000362832 COL9A1P20849 921 aa4.34□□□□□ -1.71
RNU6-170P-201ENST00000362832 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
RNU6-170P-201ENST00000362832 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
RNU6-170P-201ENST00000362832 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
RNU6-170P-201ENST00000362832 EVI5O60447 810 aa4.32□□□□□ -1.72
RNU6-170P-201ENST00000362832 WFS1O76024 890 aa4.32□□□□□ -1.72
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
RNU6-170P-201ENST00000362832 IL21Q9HBE4 155 aa4.32□□□□□ -1.72
RNU6-170P-201ENST00000362832 PPP4CP60510 307 aa4.31□□□□□ -1.72
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRIM67Q6ZTA4 783 aa4.31□□□□□ -1.72
RNU6-170P-201ENST00000362832 MTRQ99707 1265 aa4.31□□□□□ -1.72
RNU6-170P-201ENST00000362832 WIPF1O43516 503 aa4.3□□□□□ -1.72
RNU6-170P-201ENST00000362832 GGCXP38435 758 aa4.29□□□□□ -1.72
RNU6-170P-201ENST00000362832 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF516Q92618 1163 aa4.28□□□□□ -1.72
RNU6-170P-201ENST00000362832 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa4.28□□□□□ -1.72
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM187AA6NFU0 413 aa4.27□□□□□ -1.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa4.27□□□□□ -1.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 PRR20EP86478 221 aa4.27□□□□□ -1.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 PRR20CP86479 221 aa4.27□□□□□ -1.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 PRR20DP86480 221 aa4.27□□□□□ -1.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 PRR20BP86481 221 aa4.27□□□□□ -1.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 PRR20AP86496 221 aa4.27□□□□□ -1.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa4.27□□□□□ -1.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 ST8SIA5O15466 376 aa4.26□□□□□ -1.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 TYW1BQ6NUM6 668 aa4.26□□□□□ -1.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 FBXW7Q969H0 707 aa4.26□□□□□ -1.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMUB1Q9BVT8 246 aa4.26□□□□□ -1.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLC19A1P41440 591 aa4.25□□□□□ -1.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 NKX2-3Q8TAU0 364 aa4.25□□□□□ -1.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 AAASQ9NRG9 546 aa4.25□□□□□ -1.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM181BA6NEQ2 426 aa4.23□□□□□ -1.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 PHF14O94880 888 aa4.23□□□□□ -1.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 MAP3K9P80192 1104 aa4.23□□□□□ -1.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa4.23□□□□□ -1.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa4.23□□□□□ -1.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 SPRYD7Q5W111 196 aa4.22□□□□□ -1.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 SAMD7Q7Z3H4 446 aa4.22□□□□□ -1.73
RNU6-170P-201ENST00000362832 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP4.21□□□□□ -1.74
RNU6-170P-201ENST00000362832 TNFRSF10AO00220 468 aa4.21□□□□□ -1.74
RNU6-170P-201ENST00000362832 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP4.21□□□□□ -1.74
RNU6-170P-201ENST00000362832 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP4.21□□□□□ -1.74
RNU6-170P-201ENST00000362832 GDF9O60383 454 aa4.2□□□□□ -1.74
RNU6-170P-201ENST00000362832 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP4.2□□□□□ -1.74
RNU6-170P-201ENST00000362832 APLP1P51693 650 aa4.2□□□□□ -1.74
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF697Q5TEC3 545 aa4.2□□□□□ -1.74
RNU6-170P-201ENST00000362832 PACS2Q86VP3 889 aa4.2□□□□□ -1.74
RNU6-170P-201ENST00000362832 RNF223E7ERA6 249 aa4.19□□□□□ -1.74
RNU6-170P-201ENST00000362832 COPS2P61201 443 aa4.19□□□□□ -1.74
RNU6-170P-201ENST00000362832 LCE2CQ5TA81 110 aa4.19□□□□□ -1.74
RNU6-170P-201ENST00000362832 CRIPAKQ8N1N5 446 aa4.19□□□□□ -1.74
RNU6-170P-201ENST00000362832 DACH1Q9UI36 760 aa4.19□□□□□ -1.74
RNU6-170P-201ENST00000362832 PDE4AP27815 886 aa4.18□□□□□ -1.74
RNU6-170P-201ENST00000362832 EPAS1Q99814 870 aa4.18□□□□□ -1.74
RNU6-170P-201ENST00000362832 TSKSQ9UJT2 592 aa4.18□□□□□ -1.74
RNU6-170P-201ENST00000362832 SMAPO00193 183 aa4.17□□□□□ -1.74
RNU6-170P-201ENST00000362832 TERTO14746 1132 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
RNU6-170P-201ENST00000362832 RNF40O75150 1001 aa4.17□□□□□ -1.74
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZPR1O75312 459 aa4.17□□□□□ -1.74
RNU6-170P-201ENST00000362832 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa4.17□□□□□ -1.74
RNU6-170P-201ENST00000362832 RGL2O15211 777 aa4.16□□□□□ -1.74
RNU6-170P-201ENST00000362832 LIAT1Q6ZQX7 453 aa4.16□□□□□ -1.74
RNU6-170P-201ENST00000362832 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
RNU6-170P-201ENST00000362832 AXIN1O15169 862 aa4.15□□□□□ -1.75
RNU6-170P-201ENST00000362832 ANKLE1Q8NAG6 615 aa4.15□□□□□ -1.75
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa4.15□□□□□ -1.75
RNU6-170P-201ENST00000362832 AVPP01185 164 aa4.14□□□□□ -1.75
RNU6-170P-201ENST00000362832 HDGFP51858 240 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
RNU6-170P-201ENST00000362832 NECTIN2Q92692 538 aa4.14□□□□□ -1.75
RNU6-170P-201ENST00000362832 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
RNU6-170P-201ENST00000362832 EMILIN3Q9NT22 766 aa4.14□□□□□ -1.75
RNU6-170P-201ENST00000362832 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
RNU6-170P-201ENST00000362832 CTC1Q2NKJ3 1217 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-170P-201ENST00000362832 LMOD2Q6P5Q4 547 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-170P-201ENST00000362832 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
RNU6-170P-201ENST00000362832 PNMA3Q9UL41 463 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-170P-201ENST00000362832 NBPF26B4DH59 902 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-170P-201ENST00000362832 LORP23490 312 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
RNU6-170P-201ENST00000362832 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
RNU6-170P-201ENST00000362832 FOXC1Q12948 553 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-170P-201ENST00000362832 TATDN2Q93075 761 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-170P-201ENST00000362832 CDCA7LQ96GN5 454 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-170P-201ENST00000362832 PKD2L1Q9P0L9 805 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-170P-201ENST00000362832 C3orf80F5H4A9 247 aa4.1□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.2 ms