RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-201ENST00000353258 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
GDE1-201ENST00000353258 CHD1O14646 1710 aa22.43■■□□□ 1.18
GDE1-201ENST00000353258 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
GDE1-201ENST00000353258 PDE4AP27815 886 aa22.41■■□□□ 1.18
GDE1-201ENST00000353258 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
GDE1-201ENST00000353258 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.4■■□□□ 1.18
GDE1-201ENST00000353258 KIF15Q9NS87 1388 aa22.37■■□□□ 1.17
GDE1-201ENST00000353258 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
GDE1-201ENST00000353258 BACH2Q9BYV9 841 aa22.36■■□□□ 1.17
GDE1-201ENST00000353258 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa22.35■■□□□ 1.17
GDE1-201ENST00000353258 GSE1Q14687 1217 aa22.34■■□□□ 1.17
GDE1-201ENST00000353258 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.34■■□□□ 1.17
GDE1-201ENST00000353258 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.33■■□□□ 1.17
GDE1-201ENST00000353258 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.33■■□□□ 1.16
GDE1-201ENST00000353258 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.33■■□□□ 1.16
GDE1-201ENST00000353258 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.32■■□□□ 1.16
GDE1-201ENST00000353258 MBD5Q9P267 1494 aa22.32■■□□□ 1.16
GDE1-201ENST00000353258 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
GDE1-201ENST00000353258 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.31■■□□□ 1.16
GDE1-201ENST00000353258 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
GDE1-201ENST00000353258 USP47Q96K76 1375 aa22.29■■□□□ 1.16
GDE1-201ENST00000353258 MS4A1P11836 297 aa22.28■■□□□ 1.16
GDE1-201ENST00000353258 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.27■■□□□ 1.16
GDE1-201ENST00000353258 PREX2Q70Z35 1606 aa22.26■■□□□ 1.15
GDE1-201ENST00000353258 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.26■■□□□ 1.15
GDE1-201ENST00000353258 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.26■■□□□ 1.15
GDE1-201ENST00000353258 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
GDE1-201ENST00000353258 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.25■■□□□ 1.15
GDE1-201ENST00000353258 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.25■■□□□ 1.15
GDE1-201ENST00000353258 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.25■■□□□ 1.15
GDE1-201ENST00000353258 NFKBIBQ15653 356 aa22.25■■□□□ 1.15
GDE1-201ENST00000353258 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
GDE1-201ENST00000353258 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.24■■□□□ 1.15
GDE1-201ENST00000353258 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
GDE1-201ENST00000353258 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.23■■□□□ 1.15
GDE1-201ENST00000353258 DDRGK1Q96HY6 314 aa22.23■■□□□ 1.15
GDE1-201ENST00000353258 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.22■■□□□ 1.15
GDE1-201ENST00000353258 TMC1Q8TDI8 760 aa22.21■■□□□ 1.15
GDE1-201ENST00000353258 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.21■■□□□ 1.152e-6■■□□□ 11.5
GDE1-201ENST00000353258 SHROOM2Q13796 1616 aa22.21■■□□□ 1.15
GDE1-201ENST00000353258 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.19■■□□□ 1.14
GDE1-201ENST00000353258 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.19■■□□□ 1.14
GDE1-201ENST00000353258 RGL3Q3MIN7 710 aa22.18■■□□□ 1.14
GDE1-201ENST00000353258 KDM5CP41229 1560 aa22.17■■□□□ 1.14
GDE1-201ENST00000353258 SLC4A3P48751 1232 aa22.17■■□□□ 1.14
GDE1-201ENST00000353258 SKAP1Q86WV1 359 aa22.17■■□□□ 1.14
GDE1-201ENST00000353258 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.17■■□□□ 1.14
GDE1-201ENST00000353258 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.17■■□□□ 1.14
GDE1-201ENST00000353258 ABCC2Q92887 1545 aa22.17■■□□□ 1.14
GDE1-201ENST00000353258 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.14■■□□□ 1.14
GDE1-201ENST00000353258 RALGAPBQ86X10 1494 aa22.14■■□□□ 1.13
GDE1-201ENST00000353258 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.14■■□□□ 1.13
GDE1-201ENST00000353258 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.12■■□□□ 1.13
GDE1-201ENST00000353258 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
GDE1-201ENST00000353258 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.11■■□□□ 1.13
GDE1-201ENST00000353258 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.11■■□□□ 1.13
GDE1-201ENST00000353258 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.1■■□□□ 1.13
GDE1-201ENST00000353258 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.09■■□□□ 1.13
GDE1-201ENST00000353258 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
GDE1-201ENST00000353258 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
GDE1-201ENST00000353258 FAM43AQ8N2R8 423 aa22.07■■□□□ 1.12
GDE1-201ENST00000353258 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
GDE1-201ENST00000353258 NBPF1Q3BBV0 1214 aa22.05■■□□□ 1.12
GDE1-201ENST00000353258 PLA2R1Q13018 1463 aa22.04■■□□□ 1.12
GDE1-201ENST00000353258 PLIN1O60240 522 aa22.04■■□□□ 1.12
GDE1-201ENST00000353258 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.04■■□□□ 1.12
GDE1-201ENST00000353258 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.03■■□□□ 1.12
GDE1-201ENST00000353258 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
GDE1-201ENST00000353258 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
GDE1-201ENST00000353258 PLCH2O75038 1416 aa22.01■■□□□ 1.11
GDE1-201ENST00000353258 UNC13BO14795 1591 aa22.01■■□□□ 1.11
GDE1-201ENST00000353258 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
GDE1-201ENST00000353258 CLASP1Q7Z460 1538 aa22■■□□□ 1.11
GDE1-201ENST00000353258 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22■■□□□ 1.11
GDE1-201ENST00000353258 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
GDE1-201ENST00000353258 CRBNQ96SW2 442 aa22■■□□□ 1.11
GDE1-201ENST00000353258 PRAG1Q86YV5 1406 aa21.99■■□□□ 1.11
GDE1-201ENST00000353258 AFAP1Q8N556 730 aa21.99■■□□□ 1.11
GDE1-201ENST00000353258 CDCA7LQ96GN5 454 aa21.99■■□□□ 1.11
GDE1-201ENST00000353258 PLXNC1O60486 1568 aa21.98■■□□□ 1.11
GDE1-201ENST00000353258 PDE3BQ13370 1112 aa21.97■■□□□ 1.11
GDE1-201ENST00000353258 A2MP01023 1474 aa21.97■■□□□ 1.11
GDE1-201ENST00000353258 DUOX2Q9NRD8 1548 aa21.96■■□□□ 1.11
GDE1-201ENST00000353258 IQGAP3Q86VI3 1631 aa21.95■■□□□ 1.1
GDE1-201ENST00000353258 PKNOX2Q96KN3 472 aa21.95■■□□□ 1.1
GDE1-201ENST00000353258 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa21.94■■□□□ 1.1
GDE1-201ENST00000353258 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
GDE1-201ENST00000353258 RALBP1Q15311 655 aa21.93■■□□□ 1.1
GDE1-201ENST00000353258 ABCC1P33527 1531 aa21.93■■□□□ 1.1
GDE1-201ENST00000353258 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa21.92■■□□□ 1.1
GDE1-201ENST00000353258 ERBINQ96RT1 1412 aa21.91■■□□□ 1.1
GDE1-201ENST00000353258 FAM161AQ3B820 660 aa21.9■■□□□ 1.1
GDE1-201ENST00000353258 C8orf34Q49A92 452 aa21.9■■□□□ 1.1
GDE1-201ENST00000353258 KDM2BQ8NHM5 1336 aa21.89■■□□□ 1.09
GDE1-201ENST00000353258 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
GDE1-201ENST00000353258 C20orf194Q5TEA3 1177 aa21.87■■□□□ 1.09
GDE1-201ENST00000353258 NLRP13Q86W25 1043 aa21.86■■□□□ 1.09
GDE1-201ENST00000353258 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
GDE1-201ENST00000353258 MAGI2Q86UL8 1455 aa21.85■■□□□ 1.09
GDE1-201ENST00000353258 DISP3Q9P2K9 1392 aa21.84■■□□□ 1.09
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