RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM69CQ0P6D2 419 aa20.6■□□□□ 0.89
SH3BP4-201ENST00000344528 COG3Q96JB2 828 aa20.59■□□□□ 0.89
SH3BP4-201ENST00000344528 CFTRP13569 1480 aa20.58■□□□□ 0.89
SH3BP4-201ENST00000344528 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
SH3BP4-201ENST00000344528 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.88
SH3BP4-201ENST00000344528 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa20.55■□□□□ 0.88
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
SH3BP4-201ENST00000344528 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP20.54■□□□□ 0.88
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SH3BP4-201ENST00000344528 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
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SH3BP4-201ENST00000344528 CLUAP1Q96AJ1 413 aa20.53■□□□□ 0.88
SH3BP4-201ENST00000344528 NRDCO43847 1150 aa20.52■□□□□ 0.88
SH3BP4-201ENST00000344528 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
SH3BP4-201ENST00000344528 GPATCH3Q96I76 525 aa20.52■□□□□ 0.88
SH3BP4-201ENST00000344528 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa20.52■□□□□ 0.88
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SH3BP4-201ENST00000344528 SLC4A10Q6U841 1118 aa20.52■□□□□ 0.87
SH3BP4-201ENST00000344528 FYCO1Q9BQS8 1478 aa20.52■□□□□ 0.87
SH3BP4-201ENST00000344528 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa20.51■□□□□ 0.87
SH3BP4-201ENST00000344528 TAF7LQ5H9L4 462 aa20.51■□□□□ 0.87
SH3BP4-201ENST00000344528 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
SH3BP4-201ENST00000344528 CHMP3Q9Y3E7 222 aa20.49■□□□□ 0.87
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SH3BP4-201ENST00000344528 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.48■□□□□ 0.87
SH3BP4-201ENST00000344528 NCOA2Q15596 1464 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP4-201ENST00000344528 SYNJ2O15056 1496 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP4-201ENST00000344528 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP4-201ENST00000344528 NGEFQ8N5V2 710 aa20.47■□□□□ 0.87
SH3BP4-201ENST00000344528 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
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SH3BP4-201ENST00000344528 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SH3BP4-201ENST00000344528 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
SH3BP4-201ENST00000344528 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
SH3BP4-201ENST00000344528 C1orf141Q5JVX7 400 aa20.45■□□□□ 0.86
SH3BP4-201ENST00000344528 IFT140Q96RY7 1462 aa20.45■□□□□ 0.86
SH3BP4-201ENST00000344528 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
SH3BP4-201ENST00000344528 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP4-201ENST00000344528 TEFQ10587 303 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP4-201ENST00000344528 PRDM2Q13029 1718 aa20.42■□□□□ 0.86
SH3BP4-201ENST00000344528 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa20.42■□□□□ 0.86
SH3BP4-201ENST00000344528 GBP4Q96PP9 640 aa20.42■□□□□ 0.86
SH3BP4-201ENST00000344528 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
SH3BP4-201ENST00000344528 HMGXB3Q12766 1538 aa20.41■□□□□ 0.86
SH3BP4-201ENST00000344528 PTMSP20962 102 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP4-201ENST00000344528 AFAP1Q8N556 730 aa20.4■□□□□ 0.86
SH3BP4-201ENST00000344528 NESP48681 1621 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP4-201ENST00000344528 ZBED9Q6R2W3 1325 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP4-201ENST00000344528 ARHGAP5Q13017 1502 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP4-201ENST00000344528 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
SH3BP4-201ENST00000344528 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
SH3BP4-201ENST00000344528 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
SH3BP4-201ENST00000344528 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa20.38■□□□□ 0.85
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SH3BP4-201ENST00000344528 EVA1CP58658 441 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP4-201ENST00000344528 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
SH3BP4-201ENST00000344528 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
SH3BP4-201ENST00000344528 APAF1O14727 1248 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP4-201ENST00000344528 PSME1Q06323 249 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP4-201ENST00000344528 TOPBP1Q92547 1522 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP4-201ENST00000344528 EFCAB5A4FU69 1503 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP4-201ENST00000344528 ARAP1Q96P48 1450 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP4-201ENST00000344528 SYNJ1O43426 1573 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP4-201ENST00000344528 TTC5Q8N0Z6 440 aa20.33■□□□□ 0.84
SH3BP4-201ENST00000344528 BCL2L13Q9BXK5 485 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP4-201ENST00000344528 CCDC7Q96M83 1385 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP4-201ENST00000344528 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SH3BP4-201ENST00000344528 PRXQ9BXM0 1461 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP4-201ENST00000344528 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa20.32■□□□□ 0.84
SH3BP4-201ENST00000344528 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SH3BP4-201ENST00000344528 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SH3BP4-201ENST00000344528 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP4-201ENST00000344528 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
SH3BP4-201ENST00000344528 KIF7Q2M1P5 1343 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP4-201ENST00000344528 NEXNQ0ZGT2 675 aa20.31■□□□□ 0.84
SH3BP4-201ENST00000344528 RRP1P56182 461 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
SH3BP4-201ENST00000344528 G3V3G9 751 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP4-201ENST00000344528 RIPK4P57078 832 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP4-201ENST00000344528 DCAF8Q5TAQ9 597 aa20.29■□□□□ 0.84
SH3BP4-201ENST00000344528 HFM1A2PYH4 1435 aa20.28■□□□□ 0.84
SH3BP4-201ENST00000344528 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
SH3BP4-201ENST00000344528 RUNDC1Q96C34 613 aa20.28■□□□□ 0.84
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SH3BP4-201ENST00000344528 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
SH3BP4-201ENST00000344528 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
SH3BP4-201ENST00000344528 TOP2BQ02880 1626 aa20.27■□□□□ 0.84
SH3BP4-201ENST00000344528 ATF3P18847 181 aa20.27■□□□□ 0.84
SH3BP4-201ENST00000344528 CCDC34Q96HJ3 373 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP4-201ENST00000344528 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
SH3BP4-201ENST00000344528 ST18O60284 1047 aa20.26■□□□□ 0.83
SH3BP4-201ENST00000344528 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
SH3BP4-201ENST00000344528 DRC7Q8IY82 874 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP4-201ENST00000344528 DDX19BQ9UMR2 479 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP4-201ENST00000344528 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM132EQ6IEE7 984 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP4-201ENST00000344528 KIF3AQ9Y496 699 aa20.25■□□□□ 0.83
SH3BP4-201ENST00000344528 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.24■□□□□ 0.83
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