RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319331.3

LRRN1-201, Transcript of leucine rich repeat neuronal 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRN1, Length 3,823 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN1-201ENST00000319331 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
LRRN1-201ENST00000319331 PRDM2Q13029 1718 aa19.19■□□□□ 0.66
LRRN1-201ENST00000319331 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
LRRN1-201ENST00000319331 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
LRRN1-201ENST00000319331 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
LRRN1-201ENST00000319331 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa19.17■□□□□ 0.66
LRRN1-201ENST00000319331 NBPF1Q3BBV0 1214 aa19.16■□□□□ 0.66
LRRN1-201ENST00000319331 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP19.16■□□□□ 0.66
LRRN1-201ENST00000319331 TPRNQ4KMQ1 711 aa19.16■□□□□ 0.66
LRRN1-201ENST00000319331 PANK1Q8TE04 598 aa19.14■□□□□ 0.65
LRRN1-201ENST00000319331 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP19.14■□□□□ 0.65
LRRN1-201ENST00000319331 BCAR3O75815 825 aa19.13■□□□□ 0.65
LRRN1-201ENST00000319331 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa19.13■□□□□ 0.65
LRRN1-201ENST00000319331 MRC2Q9UBG0 1479 aa19.13■□□□□ 0.65
LRRN1-201ENST00000319331 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
LRRN1-201ENST00000319331 PTPN23Q9H3S7 1636 aa19.12■□□□□ 0.65
LRRN1-201ENST00000319331 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa19.11■□□□□ 0.65
LRRN1-201ENST00000319331 MYH16Q9H6N6 1097 aa19.11■□□□□ 0.65
LRRN1-201ENST00000319331 HSCBQ8IWL3 235 aa19.11■□□□□ 0.65
LRRN1-201ENST00000319331 MAP3K1Q13233 1512 aa19.09■□□□□ 0.65
LRRN1-201ENST00000319331 FAM43AQ8N2R8 423 aa19.09■□□□□ 0.65
LRRN1-201ENST00000319331 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa19.09■□□□□ 0.65
LRRN1-201ENST00000319331 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa19.07■□□□□ 0.64
LRRN1-201ENST00000319331 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
LRRN1-201ENST00000319331 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa19.05■□□□□ 0.64
LRRN1-201ENST00000319331 PKNOX2Q96KN3 472 aa19.04■□□□□ 0.64
LRRN1-201ENST00000319331 CDCA8Q53HL2 280 aa19.03■□□□□ 0.64
LRRN1-201ENST00000319331 GOLGA6L22H0YM25 854 aa19.02■□□□□ 0.64
LRRN1-201ENST00000319331 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP19.02■□□□□ 0.63
LRRN1-201ENST00000319331 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.63
LRRN1-201ENST00000319331 RNF123Q5XPI4 1314 aa19.01■□□□□ 0.63
LRRN1-201ENST00000319331 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
LRRN1-201ENST00000319331 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
LRRN1-201ENST00000319331 ITPRIPQ8IWB1 547 aa18.99■□□□□ 0.63
LRRN1-201ENST00000319331 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa18.98■□□□□ 0.63
LRRN1-201ENST00000319331 MORC1Q86VD1 984 aa18.98■□□□□ 0.63
LRRN1-201ENST00000319331 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
LRRN1-201ENST00000319331 MSNP26038 577 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
LRRN1-201ENST00000319331 C8orf34Q49A92 452 aa18.97■□□□□ 0.63
LRRN1-201ENST00000319331 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa18.97■□□□□ 0.63
LRRN1-201ENST00000319331 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
LRRN1-201ENST00000319331 PPP2R1AP30153 589 aa18.95■□□□□ 0.62
LRRN1-201ENST00000319331 CGNL1Q0VF96 1302 aa18.95■□□□□ 0.62
LRRN1-201ENST00000319331 PTMAP06454 111 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
LRRN1-201ENST00000319331 TRAK2O60296 914 aa18.95■□□□□ 0.62
LRRN1-201ENST00000319331 PANK2Q9BZ23 570 aa18.95■□□□□ 0.62
LRRN1-201ENST00000319331 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
LRRN1-201ENST00000319331 MIA2Q96PC5 1412 aa18.94■□□□□ 0.62
LRRN1-201ENST00000319331 E9PSI1 815 aa18.94■□□□□ 0.62
LRRN1-201ENST00000319331 SLC24A1O60721 1099 aa18.94■□□□□ 0.62
LRRN1-201ENST00000319331 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
LRRN1-201ENST00000319331 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP18.94■□□□□ 0.62
LRRN1-201ENST00000319331 GRIN2BQ13224 1484 aa18.93■□□□□ 0.62
LRRN1-201ENST00000319331 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP18.93■□□□□ 0.62
LRRN1-201ENST00000319331 CCDC144AA2RUR9 1427 aa18.93■□□□□ 0.62
LRRN1-201ENST00000319331 SEC24BO95487 1268 aa18.93■□□□□ 0.62
LRRN1-201ENST00000319331 CFAP53Q96M91 514 aa18.93■□□□□ 0.62
LRRN1-201ENST00000319331 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa18.93■□□□□ 0.62
LRRN1-201ENST00000319331 IGHDP01880 384 aa18.92■□□□□ 0.62
LRRN1-201ENST00000319331 SMC4Q9NTJ3 1288 aa18.92■□□□□ 0.62
LRRN1-201ENST00000319331 IFT140Q96RY7 1462 aa18.92■□□□□ 0.62
LRRN1-201ENST00000319331 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa18.92■□□□□ 0.62
LRRN1-201ENST00000319331 APBB1O00213 710 aa18.92■□□□□ 0.62
LRRN1-201ENST00000319331 DAPK1P53355 1430 aa18.91■□□□□ 0.62
LRRN1-201ENST00000319331 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa18.91■□□□□ 0.62
LRRN1-201ENST00000319331 EFCAB5A4FU69 1503 aa18.91■□□□□ 0.62
LRRN1-201ENST00000319331 DUSP27Q5VZP5 1158 aa18.9■□□□□ 0.62
LRRN1-201ENST00000319331 GBP4Q96PP9 640 aa18.9■□□□□ 0.62
LRRN1-201ENST00000319331 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
LRRN1-201ENST00000319331 C22orf23Q9BZE7 217 aa18.9■□□□□ 0.62
LRRN1-201ENST00000319331 CHMP5Q9NZZ3 219 aa18.9■□□□□ 0.62
LRRN1-201ENST00000319331 PLCB2Q00722 1185 aa18.89■□□□□ 0.61
LRRN1-201ENST00000319331 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa18.89■□□□□ 0.61
LRRN1-201ENST00000319331 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
LRRN1-201ENST00000319331 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
LRRN1-201ENST00000319331 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa18.88■□□□□ 0.61
LRRN1-201ENST00000319331 CUL7Q14999 1698 aa18.88■□□□□ 0.61
LRRN1-201ENST00000319331 FAM13BQ9NYF5 915 aa18.87■□□□□ 0.61
LRRN1-201ENST00000319331 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
LRRN1-201ENST00000319331 MCM4P33991 863 aa18.87■□□□□ 0.61
LRRN1-201ENST00000319331 RBM10P98175 930 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
LRRN1-201ENST00000319331 TBC1D2Q9BYX2 928 aa18.85■□□□□ 0.61
LRRN1-201ENST00000319331 ABCC5O15440 1437 aa18.85■□□□□ 0.61
LRRN1-201ENST00000319331 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
LRRN1-201ENST00000319331 DDX11L8A8MPP1 907 aa18.84■□□□□ 0.61
LRRN1-201ENST00000319331 SLFN5Q08AF3 891 aa18.84■□□□□ 0.61
LRRN1-201ENST00000319331 LNPKQ9C0E8 428 aa18.84■□□□□ 0.61
LRRN1-201ENST00000319331 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP18.83■□□□□ 0.61
LRRN1-201ENST00000319331 MRE11P49959 708 aa18.83■□□□□ 0.61
LRRN1-201ENST00000319331 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.61
LRRN1-201ENST00000319331 ZMYND15Q9H091 742 aa18.83■□□□□ 0.6
LRRN1-201ENST00000319331 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa18.81■□□□□ 0.6
LRRN1-201ENST00000319331 ESPNB1AK53 854 aa18.81■□□□□ 0.6
LRRN1-201ENST00000319331 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
LRRN1-201ENST00000319331 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
LRRN1-201ENST00000319331 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
LRRN1-201ENST00000319331 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
LRRN1-201ENST00000319331 JPH4Q96JJ6 628 aa18.8■□□□□ 0.6
LRRN1-201ENST00000319331 GRPEL1Q9HAV7 217 aa18.8■□□□□ 0.6
LRRN1-201ENST00000319331 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.2 ms