RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294702.5

GFI1-201, Transcript of growth factor independent 1 transcriptional repressor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene GFI1, Length 2,784 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1-201ENST00000294702 KDM5CP41229 1560 aa25.41■■□□□ 1.66
GFI1-201ENST00000294702 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.41■■□□□ 1.66
GFI1-201ENST00000294702 MBD5Q9P267 1494 aa25.41■■□□□ 1.66
GFI1-201ENST00000294702 NLRP13Q86W25 1043 aa25.4■■□□□ 1.66
GFI1-201ENST00000294702 PANK2Q9BZ23 570 aa25.39■■□□□ 1.65
GFI1-201ENST00000294702 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
GFI1-201ENST00000294702 FSD2A1L4K1 749 aa25.33■■□□□ 1.65
GFI1-201ENST00000294702 ANTXR1Q9H6X2 564 aa25.32■■□□□ 1.64
GFI1-201ENST00000294702 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
GFI1-201ENST00000294702 SEC24BO95487 1268 aa25.32■■□□□ 1.64
GFI1-201ENST00000294702 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa25.31■■□□□ 1.64
GFI1-201ENST00000294702 PLEKHG5O94827 1062 aa25.31■■□□□ 1.64
GFI1-201ENST00000294702 PODXL2Q9NZ53 605 aa25.31■■□□□ 1.64
GFI1-201ENST00000294702 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa25.31■■□□□ 1.64
GFI1-201ENST00000294702 PARD3Q8TEW0 1356 aa25.3■■□□□ 1.64
GFI1-201ENST00000294702 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.3■■□□□ 1.64
GFI1-201ENST00000294702 CARD11Q9BXL7 1154 aa25.29■■□□□ 1.64
GFI1-201ENST00000294702 KIF14Q15058 1648 aa25.26■■□□□ 1.63
GFI1-201ENST00000294702 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
GFI1-201ENST00000294702 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
GFI1-201ENST00000294702 BECN1Q14457 450 aa25.24■■□□□ 1.63
GFI1-201ENST00000294702 ROCK1Q13464 1354 aa25.24■■□□□ 1.63
GFI1-201ENST00000294702 PZPP20742 1482 aa25.24■■□□□ 1.63
GFI1-201ENST00000294702 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
GFI1-201ENST00000294702 SAMD9Q5K651 1589 aa25.23■■□□□ 1.63
GFI1-201ENST00000294702 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.22■■□□□ 1.63
GFI1-201ENST00000294702 PBRM1Q86U86 1689 aa25.21■■□□□ 1.63
GFI1-201ENST00000294702 ERBB4Q15303 1308 aa25.21■■□□□ 1.63
GFI1-201ENST00000294702 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
GFI1-201ENST00000294702 DAPK1P53355 1430 aa25.2■■□□□ 1.62
GFI1-201ENST00000294702 DUSP27Q5VZP5 1158 aa25.2■■□□□ 1.62
GFI1-201ENST00000294702 RALGAPBQ86X10 1494 aa25.19■■□□□ 1.62
GFI1-201ENST00000294702 E9PCH4 1651 aa25.19■■□□□ 1.62
GFI1-201ENST00000294702 ABCC5O15440 1437 aa25.18■■□□□ 1.62
GFI1-201ENST00000294702 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa25.17■■□□□ 1.62
GFI1-201ENST00000294702 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.17■■□□□ 1.62
GFI1-201ENST00000294702 IGHDP01880 384 aa25.16■■□□□ 1.62
GFI1-201ENST00000294702 INSRP06213 1382 aa25.16■■□□□ 1.62
GFI1-201ENST00000294702 ESPNB1AK53 854 aa25.16■■□□□ 1.62
GFI1-201ENST00000294702 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
GFI1-201ENST00000294702 MCM4P33991 863 aa25.15■■□□□ 1.62
GFI1-201ENST00000294702 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
GFI1-201ENST00000294702 NLRP1Q9C000 1473 aa25.14■■□□□ 1.62
GFI1-201ENST00000294702 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.13■■□□□ 1.61
GFI1-201ENST00000294702 PKD2Q13563 968 aa25.13■■□□□ 1.61
GFI1-201ENST00000294702 TBC1D2Q9BYX2 928 aa25.13■■□□□ 1.61
GFI1-201ENST00000294702 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa25.12■■□□□ 1.61
GFI1-201ENST00000294702 ADAMTS8Q9UP79 889 aa25.12■■□□□ 1.61
GFI1-201ENST00000294702 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.12■■□□□ 1.61
GFI1-201ENST00000294702 MRE11P49959 708 aa25.11■■□□□ 1.61
GFI1-201ENST00000294702 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa25.11■■□□□ 1.61
GFI1-201ENST00000294702 CUL7Q14999 1698 aa25.1■■□□□ 1.61
GFI1-201ENST00000294702 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
GFI1-201ENST00000294702 PDCL3Q9H2J4 239 aa25.1■■□□□ 1.61
GFI1-201ENST00000294702 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa25.09■■□□□ 1.61
GFI1-201ENST00000294702 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
GFI1-201ENST00000294702 ARID3CA6NKF2 412 aa25.09■■□□□ 1.61
GFI1-201ENST00000294702 MYH16Q9H6N6 1097 aa25.09■■□□□ 1.61
GFI1-201ENST00000294702 TRAK2O60296 914 aa25.08■■□□□ 1.61
GFI1-201ENST00000294702 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.6
GFI1-201ENST00000294702 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
GFI1-201ENST00000294702 GRPEL1Q9HAV7 217 aa25.06■■□□□ 1.6
GFI1-201ENST00000294702 PRDM4Q9UKN5 801 aa25.05■■□□□ 1.6
GFI1-201ENST00000294702 TPM2P07951 284 aa25.05■■□□□ 1.6
GFI1-201ENST00000294702 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
GFI1-201ENST00000294702 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.04■■□□□ 1.6
GFI1-201ENST00000294702 ZNF521Q96K83 1311 aa25.04■■□□□ 1.6
GFI1-201ENST00000294702 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
GFI1-201ENST00000294702 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
GFI1-201ENST00000294702 TBC1D32Q96NH3 1257 aa25.03■■□□□ 1.6
GFI1-201ENST00000294702 ADAMTS12P58397 1594 aa25.03■■□□□ 1.6
GFI1-201ENST00000294702 GOLGA2Q08379 1002 aa25.03■■□□□ 1.6
GFI1-201ENST00000294702 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
GFI1-201ENST00000294702 BCAR3O75815 825 aa25.01■■□□□ 1.59
GFI1-201ENST00000294702 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
GFI1-201ENST00000294702 SYNJ2O15056 1496 aa25■■□□□ 1.59
GFI1-201ENST00000294702 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa24.99■■□□□ 1.59
GFI1-201ENST00000294702 SLFN5Q08AF3 891 aa24.99■■□□□ 1.59
GFI1-201ENST00000294702 PANK3Q9H999 370 aa24.97■■□□□ 1.59
GFI1-201ENST00000294702 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
GFI1-201ENST00000294702 RBM10P98175 930 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.59
GFI1-201ENST00000294702 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa24.95■■□□□ 1.59
GFI1-201ENST00000294702 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.95■■□□□ 1.58
GFI1-201ENST00000294702 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
GFI1-201ENST00000294702 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
GFI1-201ENST00000294702 GAS2L3Q86XJ1 694 aa24.93■■□□□ 1.58
GFI1-201ENST00000294702 CHMP5Q9NZZ3 219 aa24.93■■□□□ 1.58
GFI1-201ENST00000294702 CHD1O14646 1710 aa24.93■■□□□ 1.58
GFI1-201ENST00000294702 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
GFI1-201ENST00000294702 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.92■■□□□ 1.58
GFI1-201ENST00000294702 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.92■■□□□ 1.58
GFI1-201ENST00000294702 RIPK4P57078 832 aa24.89■■□□□ 1.57
GFI1-201ENST00000294702 CLUAP1Q96AJ1 413 aa24.89■■□□□ 1.57
GFI1-201ENST00000294702 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
GFI1-201ENST00000294702 DISP3Q9P2K9 1392 aa24.88■■□□□ 1.57
GFI1-201ENST00000294702 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP24.88■■□□□ 1.57
GFI1-201ENST00000294702 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
GFI1-201ENST00000294702 NBPF1Q3BBV0 1214 aa24.87■■□□□ 1.57
GFI1-201ENST00000294702 COG6Q9Y2V7 657 aa24.86■■□□□ 1.57
GFI1-201ENST00000294702 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.8 ms