RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264896.7

SCARB2-201, Transcript of scavenger receptor class B member 2, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCARB2, Length 4,792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2-201ENST00000264896 FGD1P98174 961 aa22.25■■□□□ 1.15
SCARB2-201ENST00000264896 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.24■■□□□ 1.15
SCARB2-201ENST00000264896 PLIN1O60240 522 aa22.22■■□□□ 1.15
SCARB2-201ENST00000264896 PLCB2Q00722 1185 aa22.22■■□□□ 1.15
SCARB2-201ENST00000264896 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SCARB2-201ENST00000264896 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.21■■□□□ 1.15
SCARB2-201ENST00000264896 PDE4AP27815 886 aa22.21■■□□□ 1.15
SCARB2-201ENST00000264896 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.21■■□□□ 1.15
SCARB2-201ENST00000264896 E9PSI1 815 aa22.2■■□□□ 1.14
SCARB2-201ENST00000264896 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SCARB2-201ENST00000264896 GBP4Q96PP9 640 aa22.19■■□□□ 1.14
SCARB2-201ENST00000264896 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.19■■□□□ 1.14
SCARB2-201ENST00000264896 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SCARB2-201ENST00000264896 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.14
SCARB2-201ENST00000264896 VGFO15240 615 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SCARB2-201ENST00000264896 APAF1O14727 1248 aa22.17■■□□□ 1.14
SCARB2-201ENST00000264896 CRBNQ96SW2 442 aa22.17■■□□□ 1.14
SCARB2-201ENST00000264896 LMOD3Q0VAK6 560 aa22.16■■□□□ 1.14
SCARB2-201ENST00000264896 CGNL1Q0VF96 1302 aa22.15■■□□□ 1.14
SCARB2-201ENST00000264896 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.15■■□□□ 1.14
SCARB2-201ENST00000264896 STK31Q9BXU1 1019 aa22.15■■□□□ 1.14
SCARB2-201ENST00000264896 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa22.15■■□□□ 1.14
SCARB2-201ENST00000264896 NGEFQ8N5V2 710 aa22.15■■□□□ 1.14
SCARB2-201ENST00000264896 TOP2BQ02880 1626 aa22.14■■□□□ 1.14
SCARB2-201ENST00000264896 STAC3Q96MF2 364 aa22.14■■□□□ 1.13
SCARB2-201ENST00000264896 CHMP4AQ9BY43 222 aa22.14■■□□□ 1.13
SCARB2-201ENST00000264896 FAM161AQ3B820 660 aa22.14■■□□□ 1.13
SCARB2-201ENST00000264896 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SCARB2-201ENST00000264896 EVC2Q86UK5 1308 aa22.13■■□□□ 1.13
SCARB2-201ENST00000264896 PTMSP20962 102 aa22.12■■□□□ 1.13
SCARB2-201ENST00000264896 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.12■■□□□ 1.13
SCARB2-201ENST00000264896 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
SCARB2-201ENST00000264896 MIA2Q96PC5 1412 aa22.12■■□□□ 1.13
SCARB2-201ENST00000264896 HMMRO75330 724 aa22.11■■□□□ 1.13
SCARB2-201ENST00000264896 BCL2L13Q9BXK5 485 aa22.11■■□□□ 1.13
SCARB2-201ENST00000264896 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SCARB2-201ENST00000264896 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SCARB2-201ENST00000264896 USP35Q9P2H5 1018 aa22.09■■□□□ 1.13
SCARB2-201ENST00000264896 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.08■■□□□ 1.13
SCARB2-201ENST00000264896 COG6Q9Y2V7 657 aa22.08■■□□□ 1.12
SCARB2-201ENST00000264896 EFCAB5A4FU69 1503 aa22.07■■□□□ 1.12
SCARB2-201ENST00000264896 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SCARB2-201ENST00000264896 MSNP26038 577 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SCARB2-201ENST00000264896 GRIN2BQ13224 1484 aa22.06■■□□□ 1.12
SCARB2-201ENST00000264896 HFM1A2PYH4 1435 aa22.05■■□□□ 1.12
SCARB2-201ENST00000264896 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SCARB2-201ENST00000264896 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
SCARB2-201ENST00000264896 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
SCARB2-201ENST00000264896 EID1Q9Y6B2 187 aa22.04■■□□□ 1.12
SCARB2-201ENST00000264896 SLC4A10Q6U841 1118 aa22.03■■□□□ 1.12
SCARB2-201ENST00000264896 TAOK2Q9UL54 1235 aa22.03■■□□□ 1.12
SCARB2-201ENST00000264896 TIAM1Q13009 1591 aa22.02■■□□□ 1.12
SCARB2-201ENST00000264896 AMPHP49418 695 aa22.01■■□□□ 1.11
SCARB2-201ENST00000264896 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa22■■□□□ 1.11
SCARB2-201ENST00000264896 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
SCARB2-201ENST00000264896 NRDCO43847 1150 aa22■■□□□ 1.11
SCARB2-201ENST00000264896 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22■■□□□ 1.11
SCARB2-201ENST00000264896 HMGXB3Q12766 1538 aa22■■□□□ 1.11
SCARB2-201ENST00000264896 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
SCARB2-201ENST00000264896 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa21.99■■□□□ 1.11
SCARB2-201ENST00000264896 NBPF8Q3BBV2 869 aa21.99■■□□□ 1.11
SCARB2-201ENST00000264896 PRDM2Q13029 1718 aa21.99■■□□□ 1.11
SCARB2-201ENST00000264896 NUTM2FA1L443 756 aa21.99■■□□□ 1.11
SCARB2-201ENST00000264896 SLC4A3P48751 1232 aa21.98■■□□□ 1.11
SCARB2-201ENST00000264896 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa21.98■■□□□ 1.11
SCARB2-201ENST00000264896 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.97■■□□□ 1.11
SCARB2-201ENST00000264896 COG3Q96JB2 828 aa21.97■■□□□ 1.11
SCARB2-201ENST00000264896 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.96■■□□□ 1.11
SCARB2-201ENST00000264896 TOPBP1Q92547 1522 aa21.96■■□□□ 1.11
SCARB2-201ENST00000264896 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
SCARB2-201ENST00000264896 RUNDC1Q96C34 613 aa21.96■■□□□ 1.11
SCARB2-201ENST00000264896 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
SCARB2-201ENST00000264896 NESP48681 1621 aa21.95■■□□□ 1.1
SCARB2-201ENST00000264896 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa21.94■■□□□ 1.1
SCARB2-201ENST00000264896 ANKRD45Q5TZF3 282 aa21.94■■□□□ 1.1
SCARB2-201ENST00000264896 DDX19BQ9UMR2 479 aa21.94■■□□□ 1.1
SCARB2-201ENST00000264896 ADAMTS8Q9UP79 889 aa21.94■■□□□ 1.1
SCARB2-201ENST00000264896 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
SCARB2-201ENST00000264896 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
SCARB2-201ENST00000264896 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa21.93■■□□□ 1.1
SCARB2-201ENST00000264896 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
SCARB2-201ENST00000264896 NPHP1O15259 732 aa21.91■■□□□ 1.1
SCARB2-201ENST00000264896 ST18O60284 1047 aa21.91■■□□□ 1.1
SCARB2-201ENST00000264896 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
SCARB2-201ENST00000264896 FOXD4L1Q9NU39 408 aa21.91■■□□□ 1.1
SCARB2-201ENST00000264896 RIPK4P57078 832 aa21.9■■□□□ 1.1
SCARB2-201ENST00000264896 GPATCH3Q96I76 525 aa21.9■■□□□ 1.1
SCARB2-201ENST00000264896 AFAP1Q8N556 730 aa21.9■■□□□ 1.1
SCARB2-201ENST00000264896 NBPF1Q3BBV0 1214 aa21.89■■□□□ 1.1
SCARB2-201ENST00000264896 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
SCARB2-201ENST00000264896 CDCA7LQ96GN5 454 aa21.88■■□□□ 1.09
SCARB2-201ENST00000264896 SYNJ2O15056 1496 aa21.88■■□□□ 1.09
SCARB2-201ENST00000264896 DRC7Q8IY82 874 aa21.87■■□□□ 1.09
SCARB2-201ENST00000264896 WDR97A6NE52 1622 aa21.87■■□□□ 1.09
SCARB2-201ENST00000264896 GSE1Q14687 1217 aa21.87■■□□□ 1.09
SCARB2-201ENST00000264896 DDX11L8A8MPP1 907 aa21.86■■□□□ 1.09
SCARB2-201ENST00000264896 OSCARQ8IYS5 282 aa21.86■■□□□ 1.09
SCARB2-201ENST00000264896 NAIPQ13075 1403 aa21.86■■□□□ 1.09
SCARB2-201ENST00000264896 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
SCARB2-201ENST00000264896 C9orf84Q5VXU9 1444 aa21.86■■□□□ 1.09
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