RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263966.7

USP13-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP13, Length 8,323 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13-201ENST00000263966 PPP4R2Q9NY27 417 aa20.44■□□□□ 0.86
USP13-201ENST00000263966 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
USP13-201ENST00000263966 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
USP13-201ENST00000263966 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP20.43■□□□□ 0.86
USP13-201ENST00000263966 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
USP13-201ENST00000263966 H3BQV1 296 aa20.43■□□□□ 0.86
USP13-201ENST00000263966 IFFO2Q5TF58 517 aa20.43■□□□□ 0.86
USP13-201ENST00000263966 NACADO15069 1562 aa20.42■□□□□ 0.86
USP13-201ENST00000263966 FBXW7Q969H0 707 aa20.41■□□□□ 0.86
USP13-201ENST00000263966 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa20.4■□□□□ 0.86
USP13-201ENST00000263966 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
USP13-201ENST00000263966 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa20.4■□□□□ 0.86
USP13-201ENST00000263966 SMC4Q9NTJ3 1288 aa20.4■□□□□ 0.86
USP13-201ENST00000263966 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
USP13-201ENST00000263966 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.86
USP13-201ENST00000263966 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.86
USP13-201ENST00000263966 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.86
USP13-201ENST00000263966 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa20.39■□□□□ 0.85
USP13-201ENST00000263966 RDXP35241 583 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
USP13-201ENST00000263966 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
USP13-201ENST00000263966 CEP162Q5TB80 1403 aa20.38■□□□□ 0.85
USP13-201ENST00000263966 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa20.38■□□□□ 0.85
USP13-201ENST00000263966 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.37■□□□□ 0.85
USP13-201ENST00000263966 SLC4A10Q6U841 1118 aa20.37■□□□□ 0.85
USP13-201ENST00000263966 TRIM29Q14134 588 aa20.37■□□□□ 0.85
USP13-201ENST00000263966 NEXNQ0ZGT2 675 aa20.37■□□□□ 0.85
USP13-201ENST00000263966 TTC5Q8N0Z6 440 aa20.37■□□□□ 0.85
USP13-201ENST00000263966 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
USP13-201ENST00000263966 PAF1Q8N7H5 531 aa20.36■□□□□ 0.85
USP13-201ENST00000263966 FAM184AQ8NB25 1140 aa20.36■□□□□ 0.85
USP13-201ENST00000263966 ST18O60284 1047 aa20.36■□□□□ 0.85
USP13-201ENST00000263966 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
USP13-201ENST00000263966 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
USP13-201ENST00000263966 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.35■□□□□ 0.85
USP13-201ENST00000263966 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
USP13-201ENST00000263966 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
USP13-201ENST00000263966 GPS2Q13227 327 aa20.34■□□□□ 0.85
USP13-201ENST00000263966 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
USP13-201ENST00000263966 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa20.33■□□□□ 0.84
USP13-201ENST00000263966 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa20.32■□□□□ 0.84
USP13-201ENST00000263966 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
USP13-201ENST00000263966 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
USP13-201ENST00000263966 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa20.31■□□□□ 0.84
USP13-201ENST00000263966 ERICH2A1L162 156 aa20.31■□□□□ 0.84
USP13-201ENST00000263966 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa20.3■□□□□ 0.84
USP13-201ENST00000263966 MIER1Q8N108 512 aa20.29■□□□□ 0.84
USP13-201ENST00000263966 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa20.28■□□□□ 0.84
USP13-201ENST00000263966 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa20.28■□□□□ 0.84
USP13-201ENST00000263966 EPS15P42566 896 aa20.27■□□□□ 0.84
USP13-201ENST00000263966 TRDNQ13061 729 aa20.27■□□□□ 0.84
USP13-201ENST00000263966 PRDM2Q13029 1718 aa20.26■□□□□ 0.83
USP13-201ENST00000263966 APPP05067 770 aa20.26■□□□□ 0.83
USP13-201ENST00000263966 UACAQ9BZF9 1416 aa20.25■□□□□ 0.83
USP13-201ENST00000263966 TEFQ10587 303 aa20.24■□□□□ 0.83
USP13-201ENST00000263966 TMEM132AQ24JP5 1023 aa20.24■□□□□ 0.83
USP13-201ENST00000263966 CALRP27797 417 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
USP13-201ENST00000263966 CDR1P51861 262 aa20.23■□□□□ 0.83
USP13-201ENST00000263966 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
USP13-201ENST00000263966 DDX58O95786 925 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
USP13-201ENST00000263966 RUFY2Q8WXA3 655 aa20.21■□□□□ 0.83
USP13-201ENST00000263966 BECN2A8MW95 431 aa20.2■□□□□ 0.82
USP13-201ENST00000263966 RALBP1Q15311 655 aa20.2■□□□□ 0.82
USP13-201ENST00000263966 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
USP13-201ENST00000263966 PSME1Q06323 249 aa20.19■□□□□ 0.82
USP13-201ENST00000263966 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP20.19■□□□□ 0.821e-6■■■■□ 20.1
USP13-201ENST00000263966 MCTP1Q6DN14 999 aa20.18■□□□□ 0.82
USP13-201ENST00000263966 MYO6Q9UM54 1294 aa20.18■□□□□ 0.82
USP13-201ENST00000263966 ATF3P18847 181 aa20.18■□□□□ 0.82
USP13-201ENST00000263966 CCDC173Q0VFZ6 552 aa20.18■□□□□ 0.82
USP13-201ENST00000263966 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
USP13-201ENST00000263966 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
USP13-201ENST00000263966 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa20.17■□□□□ 0.82
USP13-201ENST00000263966 CPLX1O14810 134 aa20.17■□□□□ 0.82
USP13-201ENST00000263966 BRMS1Q9HCU9 246 aa20.17■□□□□ 0.82
USP13-201ENST00000263966 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa20.16■□□□□ 0.82
USP13-201ENST00000263966 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
USP13-201ENST00000263966 IKQ13123 557 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
USP13-201ENST00000263966 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
USP13-201ENST00000263966 NFXL1Q6ZNB6 911 aa20.15■□□□□ 0.82
USP13-201ENST00000263966 COG3Q96JB2 828 aa20.15■□□□□ 0.82
USP13-201ENST00000263966 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa20.15■□□□□ 0.82
USP13-201ENST00000263966 PDS5BQ9NTI5 1447 aa20.15■□□□□ 0.82
USP13-201ENST00000263966 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
USP13-201ENST00000263966 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa20.14■□□□□ 0.82
USP13-201ENST00000263966 PHLDB1Q86UU1 1377 aa20.14■□□□□ 0.81
USP13-201ENST00000263966 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP20.14■□□□□ 0.81
USP13-201ENST00000263966 RUFY1Q96T51 708 aa20.14■□□□□ 0.81
USP13-201ENST00000263966 RILPL2Q969X0 211 aa20.14■□□□□ 0.81
USP13-201ENST00000263966 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
USP13-201ENST00000263966 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
USP13-201ENST00000263966 KIF3BO15066 747 aa20.13■□□□□ 0.81
USP13-201ENST00000263966 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
USP13-201ENST00000263966 XBP1P17861 261 aa20.12■□□□□ 0.81
USP13-201ENST00000263966 RNF20Q5VTR2 975 aa20.12■□□□□ 0.81
USP13-201ENST00000263966 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
USP13-201ENST00000263966 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
USP13-201ENST00000263966 ROCK1Q13464 1354 aa20.11■□□□□ 0.81
USP13-201ENST00000263966 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
USP13-201ENST00000263966 AK7Q96M32 723 aa20.11■□□□□ 0.81
USP13-201ENST00000263966 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
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