RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253008.2

PRDM12-201, Transcript of PR/SET domain 12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRDM12, Length 2,476 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12-201ENST00000253008 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.8■■□□□ 1.56
PRDM12-201ENST00000253008 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.8■■□□□ 1.56
PRDM12-201ENST00000253008 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
PRDM12-201ENST00000253008 NUDCQ9Y266 331 aa24.79■■□□□ 1.56
PRDM12-201ENST00000253008 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.79■■□□□ 1.56
PRDM12-201ENST00000253008 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.77■■□□□ 1.56
PRDM12-201ENST00000253008 PLA2R1Q13018 1463 aa24.75■■□□□ 1.55
PRDM12-201ENST00000253008 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
PRDM12-201ENST00000253008 PREX2Q70Z35 1606 aa24.73■■□□□ 1.55
PRDM12-201ENST00000253008 TTC37Q6PGP7 1564 aa24.73■■□□□ 1.55
PRDM12-201ENST00000253008 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.72■■□□□ 1.55
PRDM12-201ENST00000253008 FANCIQ9NVI1 1328 aa24.71■■□□□ 1.55
PRDM12-201ENST00000253008 PRAG1Q86YV5 1406 aa24.71■■□□□ 1.55
PRDM12-201ENST00000253008 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.71■■□□□ 1.55
PRDM12-201ENST00000253008 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.71■■□□□ 1.55
PRDM12-201ENST00000253008 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.69■■□□□ 1.54
PRDM12-201ENST00000253008 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
PRDM12-201ENST00000253008 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.68■■□□□ 1.54
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PRDM12-201ENST00000253008 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.67■■□□□ 1.54
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PRDM12-201ENST00000253008 A2MP01023 1474 aa24.66■■□□□ 1.54
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PRDM12-201ENST00000253008 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa24.63■■□□□ 1.53
PRDM12-201ENST00000253008 DISP3Q9P2K9 1392 aa24.62■■□□□ 1.53
PRDM12-201ENST00000253008 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
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PRDM12-201ENST00000253008 CCDC136Q96JN2 1154 aa24.61■■□□□ 1.53
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PRDM12-201ENST00000253008 PANK3Q9H999 370 aa24.55■■□□□ 1.52
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PRDM12-201ENST00000253008 CDCA7LQ96GN5 454 aa24.54■■□□□ 1.52
PRDM12-201ENST00000253008 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.53■■□□□ 1.52
PRDM12-201ENST00000253008 ABCC2Q92887 1545 aa24.52■■□□□ 1.52
PRDM12-201ENST00000253008 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.5■■□□□ 1.51
PRDM12-201ENST00000253008 ERICH6Q7L0X2 663 aa24.5■■□□□ 1.51
PRDM12-201ENST00000253008 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
PRDM12-201ENST00000253008 EXOC6Q8TAG9 804 aa24.49■■□□□ 1.51
PRDM12-201ENST00000253008 IQGAP3Q86VI3 1631 aa24.49■■□□□ 1.51
PRDM12-201ENST00000253008 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.49■■□□□ 1.51
PRDM12-201ENST00000253008 RRP1P56182 461 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
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PRDM12-201ENST00000253008 ERBINQ96RT1 1412 aa24.48■■□□□ 1.51
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PRDM12-201ENST00000253008 PLXNC1O60486 1568 aa24.47■■□□□ 1.51
PRDM12-201ENST00000253008 DUOX2Q9NRD8 1548 aa24.46■■□□□ 1.51
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PRDM12-201ENST00000253008 PLCH2O75038 1416 aa24.46■■□□□ 1.51
PRDM12-201ENST00000253008 BCL11AQ9H165 835 aa24.45■■□□□ 1.51
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PRDM12-201ENST00000253008 TMF1P82094 1093 aa24.43■■□□□ 1.5
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PRDM12-201ENST00000253008 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
PRDM12-201ENST00000253008 MAGI2Q86UL8 1455 aa24.4■■□□□ 1.5
PRDM12-201ENST00000253008 ATP10AO60312 1499 aa24.39■■□□□ 1.49
PRDM12-201ENST00000253008 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
PRDM12-201ENST00000253008 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
PRDM12-201ENST00000253008 ABCC1P33527 1531 aa24.35■■□□□ 1.49
PRDM12-201ENST00000253008 ADAMTS8Q9UP79 889 aa24.35■■□□□ 1.49
PRDM12-201ENST00000253008 LAMC1P11047 1609 aa24.34■■□□□ 1.49
PRDM12-201ENST00000253008 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
PRDM12-201ENST00000253008 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa24.32■■□□□ 1.48
PRDM12-201ENST00000253008 SKAP1Q86WV1 359 aa24.32■■□□□ 1.48
PRDM12-201ENST00000253008 PDE3BQ13370 1112 aa24.31■■□□□ 1.48
PRDM12-201ENST00000253008 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.31■■□□□ 1.48
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PRDM12-201ENST00000253008 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
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PRDM12-201ENST00000253008 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.28■■□□□ 1.48
PRDM12-201ENST00000253008 KNSTRNQ9Y448 316 aa24.27■■□□□ 1.48
PRDM12-201ENST00000253008 PPP2R1AP30153 589 aa24.27■■□□□ 1.48
PRDM12-201ENST00000253008 MADDQ8WXG6 1647 aa24.26■■□□□ 1.47
PRDM12-201ENST00000253008 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
PRDM12-201ENST00000253008 KIF3BO15066 747 aa24.25■■□□□ 1.47
PRDM12-201ENST00000253008 C20orf194Q5TEA3 1177 aa24.25■■□□□ 1.47
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PRDM12-201ENST00000253008 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa24.24■■□□□ 1.47
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PRDM12-201ENST00000253008 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa24.22■■□□□ 1.47
PRDM12-201ENST00000253008 CFAP70Q5T0N1 1121 aa24.21■■□□□ 1.47
PRDM12-201ENST00000253008 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
PRDM12-201ENST00000253008 TRPM2O94759 1503 aa24.21■■□□□ 1.47
PRDM12-201ENST00000253008 PTPRTO14522 1441 aa24.2■■□□□ 1.46
PRDM12-201ENST00000253008 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
PRDM12-201ENST00000253008 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
PRDM12-201ENST00000253008 SCAPERQ9BY12 1400 aa24.19■■□□□ 1.46
PRDM12-201ENST00000253008 UGGT1Q9NYU2 1555 aa24.19■■□□□ 1.46
PRDM12-201ENST00000253008 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
PRDM12-201ENST00000253008 IQGAP1P46940 1657 aa24.18■■□□□ 1.46
PRDM12-201ENST00000253008 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.18■■□□□ 1.46
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