RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249440.4

HOXD3-201, Transcript of homeobox D3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD3, Length 2,303 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD3-201ENST00000249440 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa22.42■■□□□ 1.18
HOXD3-201ENST00000249440 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXD3-201ENST00000249440 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXD3-201ENST00000249440 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXD3-201ENST00000249440 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXD3-201ENST00000249440 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXD3-201ENST00000249440 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.33■■□□□ 1.16
HOXD3-201ENST00000249440 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXD3-201ENST00000249440 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXD3-201ENST00000249440 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.31■■□□□ 1.16
HOXD3-201ENST00000249440 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
HOXD3-201ENST00000249440 TTC37Q6PGP7 1564 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXD3-201ENST00000249440 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.3■■□□□ 1.16
HOXD3-201ENST00000249440 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
HOXD3-201ENST00000249440 UNC13BO14795 1591 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD3-201ENST00000249440 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.28■■□□□ 1.16
HOXD3-201ENST00000249440 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
HOXD3-201ENST00000249440 ASXL2Q76L83 1435 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD3-201ENST00000249440 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXD3-201ENST00000249440 TMC1Q8TDI8 760 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXD3-201ENST00000249440 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXD3-201ENST00000249440 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
HOXD3-201ENST00000249440 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXD3-201ENST00000249440 PLXNC1O60486 1568 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXD3-201ENST00000249440 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXD3-201ENST00000249440 E9PCH4 1651 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXD3-201ENST00000249440 NUDCQ9Y266 331 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXD3-201ENST00000249440 RALBP1Q15311 655 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXD3-201ENST00000249440 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD3-201ENST00000249440 IQGAP3Q86VI3 1631 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD3-201ENST00000249440 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
HOXD3-201ENST00000249440 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
HOXD3-201ENST00000249440 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.14
HOXD3-201ENST00000249440 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.14
HOXD3-201ENST00000249440 PLA2R1Q13018 1463 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXD3-201ENST00000249440 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXD3-201ENST00000249440 RGL3Q3MIN7 710 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXD3-201ENST00000249440 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXD3-201ENST00000249440 GPRASP1Q5JY77 1395 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXD3-201ENST00000249440 LAMC1P11047 1609 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXD3-201ENST00000249440 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
HOXD3-201ENST00000249440 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXD3-201ENST00000249440 A2MP01023 1474 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXD3-201ENST00000249440 ERBINQ96RT1 1412 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD3-201ENST00000249440 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXD3-201ENST00000249440 ATP10AO60312 1499 aa22.14■■□□□ 1.14
HOXD3-201ENST00000249440 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXD3-201ENST00000249440 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
HOXD3-201ENST00000249440 PLCH2O75038 1416 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXD3-201ENST00000249440 NBPF1Q3BBV0 1214 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXD3-201ENST00000249440 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
HOXD3-201ENST00000249440 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXD3-201ENST00000249440 PARD3Q8TEW0 1356 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXD3-201ENST00000249440 NLRP13Q86W25 1043 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXD3-201ENST00000249440 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
HOXD3-201ENST00000249440 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXD3-201ENST00000249440 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXD3-201ENST00000249440 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
HOXD3-201ENST00000249440 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXD3-201ENST00000249440 ABCC1P33527 1531 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXD3-201ENST00000249440 TESK2Q96S53 571 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXD3-201ENST00000249440 MSH5O43196 834 aa22.04■■□□□ 1.12
HOXD3-201ENST00000249440 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.02■■□□□ 1.12
HOXD3-201ENST00000249440 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXD3-201ENST00000249440 TMF1P82094 1093 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXD3-201ENST00000249440 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.01■■□□□ 1.11
HOXD3-201ENST00000249440 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22■■□□□ 1.11
HOXD3-201ENST00000249440 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
HOXD3-201ENST00000249440 FAM69CQ0P6D2 419 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXD3-201ENST00000249440 PDE3BQ13370 1112 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXD3-201ENST00000249440 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXD3-201ENST00000249440 CD109Q6YHK3 1445 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXD3-201ENST00000249440 ARAP3Q8WWN8 1544 aa21.97■■□□□ 1.11
HOXD3-201ENST00000249440 TSPOAP1O95153 1857 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXD3-201ENST00000249440 PANK3Q9H999 370 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXD3-201ENST00000249440 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
HOXD3-201ENST00000249440 DIP2BQ9P265 1576 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXD3-201ENST00000249440 FANCAO15360 1455 aa21.95■■□□□ 1.1
HOXD3-201ENST00000249440 INSRP06213 1382 aa21.94■■□□□ 1.1
HOXD3-201ENST00000249440 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
HOXD3-201ENST00000249440 STAC3Q96MF2 364 aa21.94■■□□□ 1.1
HOXD3-201ENST00000249440 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa21.93■■□□□ 1.1
HOXD3-201ENST00000249440 ERICH6Q7L0X2 663 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXD3-201ENST00000249440 KIF13AQ9H1H9 1805 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXD3-201ENST00000249440 TRPM2O94759 1503 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXD3-201ENST00000249440 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXD3-201ENST00000249440 AFAP1Q8N556 730 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXD3-201ENST00000249440 MADDQ8WXG6 1647 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXD3-201ENST00000249440 CEP152O94986 1710 aa21.92■■□□□ 1.1
HOXD3-201ENST00000249440 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa21.91■■□□□ 1.1
HOXD3-201ENST00000249440 RRP1P56182 461 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
HOXD3-201ENST00000249440 RCAN3Q9UKA8 241 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXD3-201ENST00000249440 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXD3-201ENST00000249440 DEPDC5O75140 1603 aa21.89■■□□□ 1.1
HOXD3-201ENST00000249440 IQGAP1P46940 1657 aa21.89■■□□□ 1.09
HOXD3-201ENST00000249440 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
HOXD3-201ENST00000249440 PTPRTO14522 1441 aa21.88■■□□□ 1.09
HOXD3-201ENST00000249440 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
HOXD3-201ENST00000249440 TET3O43151 1660 aa21.86■■□□□ 1.09
HOXD3-201ENST00000249440 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
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