RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000164227.9

BCL3-201, Transcript of B cell CLL/lymphoma 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene BCL3, Length 2,038 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL3-201ENST00000164227 CHD1O14646 1710 aa36.13■■■■□ 3.37
BCL3-201ENST00000164227 FANCIQ9NVI1 1328 aa36.13■■■■□ 3.37
BCL3-201ENST00000164227 POLR3GLQ9BT43 218 aa36.12■■■■□ 3.37
BCL3-201ENST00000164227 SYCP2Q9BX26 1530 aa36.12■■■■□ 3.37
BCL3-201ENST00000164227 DCAF11Q8TEB1 546 aa36.12■■■■□ 3.37
BCL3-201ENST00000164227 TTC37Q6PGP7 1564 aa36.11■■■■□ 3.37
BCL3-201ENST00000164227 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa36.11■■■■□ 3.37
BCL3-201ENST00000164227 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP36.1■■■■□ 3.37
BCL3-201ENST00000164227 NUDCQ9Y266 331 aa36.1■■■■□ 3.37
BCL3-201ENST00000164227 LAMC1P11047 1609 aa36.09■■■■□ 3.37
BCL3-201ENST00000164227 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP36.09■■■■□ 3.37
BCL3-201ENST00000164227 PRAG1Q86YV5 1406 aa36.09■■■■□ 3.37
BCL3-201ENST00000164227 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa36.08■■■■□ 3.37
BCL3-201ENST00000164227 CCDC144AA2RUR9 1427 aa36.08■■■■□ 3.37
BCL3-201ENST00000164227 RNF123Q5XPI4 1314 aa36.08■■■■□ 3.37
BCL3-201ENST00000164227 ARHGAP5Q13017 1502 aa36.08■■■■□ 3.37
BCL3-201ENST00000164227 IQGAP3Q86VI3 1631 aa36.07■■■■□ 3.37
BCL3-201ENST00000164227 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP36.07■■■■□ 3.36
BCL3-201ENST00000164227 MYO5CQ9NQX4 1742 aa36.07■■■■□ 3.36
BCL3-201ENST00000164227 RALBP1Q15311 655 aa36.06■■■■□ 3.36
BCL3-201ENST00000164227 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa36.06■■■■□ 3.36
BCL3-201ENST00000164227 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP36.04■■■■□ 3.36
BCL3-201ENST00000164227 GPRASP1Q5JY77 1395 aa36.03■■■■□ 3.36
BCL3-201ENST00000164227 ABCC2Q92887 1545 aa36.03■■■■□ 3.36
BCL3-201ENST00000164227 TMC1Q8TDI8 760 aa36.02■■■■□ 3.36
BCL3-201ENST00000164227 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP36.02■■■■□ 3.36
BCL3-201ENST00000164227 PLA2R1Q13018 1463 aa36■■■■□ 3.35
BCL3-201ENST00000164227 ATP10AO60312 1499 aa35.98■■■■□ 3.35
BCL3-201ENST00000164227 MAGI2Q86UL8 1455 aa35.98■■■■□ 3.35
BCL3-201ENST00000164227 DUOX2Q9NRD8 1548 aa35.98■■■■□ 3.35
BCL3-201ENST00000164227 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP35.96■■■■□ 3.35
BCL3-201ENST00000164227 A2MP01023 1474 aa35.94■■■■□ 3.34
BCL3-201ENST00000164227 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP35.93■■■■□ 3.34
BCL3-201ENST00000164227 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa35.93■■■■□ 3.34
BCL3-201ENST00000164227 ERBINQ96RT1 1412 aa35.92■■■■□ 3.34
BCL3-201ENST00000164227 PARD3Q8TEW0 1356 aa35.88■■■■□ 3.33
BCL3-201ENST00000164227 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP35.87■■■■□ 3.33
BCL3-201ENST00000164227 MSH5O43196 834 aa35.87■■■■□ 3.33
BCL3-201ENST00000164227 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP35.86■■■■□ 3.33
BCL3-201ENST00000164227 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa35.84■■■■□ 3.33
BCL3-201ENST00000164227 PLCH2O75038 1416 aa35.83■■■■□ 3.33
BCL3-201ENST00000164227 NLRP13Q86W25 1043 aa35.81■■■■□ 3.32
BCL3-201ENST00000164227 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.81■■■■□ 3.32
BCL3-201ENST00000164227 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa35.8■■■■□ 3.32
BCL3-201ENST00000164227 INSRP06213 1382 aa35.78■■■■□ 3.32
BCL3-201ENST00000164227 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP35.78■■■■□ 3.32
BCL3-201ENST00000164227 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa35.77■■■■□ 3.32
BCL3-201ENST00000164227 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP35.77■■■■□ 3.32
BCL3-201ENST00000164227 NBPF1Q3BBV0 1214 aa35.77■■■■□ 3.32
BCL3-201ENST00000164227 ABCC1P33527 1531 aa35.76■■■■□ 3.32
BCL3-201ENST00000164227 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP35.76■■■■□ 3.32
BCL3-201ENST00000164227 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP35.76■■■■□ 3.31
BCL3-201ENST00000164227 RGL3Q3MIN7 710 aa35.75■■■■□ 3.31
BCL3-201ENST00000164227 TESK2Q96S53 571 aa35.73■■■■□ 3.31
BCL3-201ENST00000164227 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa35.71■■■■□ 3.31
BCL3-201ENST00000164227 PDE3BQ13370 1112 aa35.69■■■■□ 3.3
BCL3-201ENST00000164227 ARAP3Q8WWN8 1544 aa35.69■■■■□ 3.3
BCL3-201ENST00000164227 DISP3Q9P2K9 1392 aa35.67■■■■□ 3.3
BCL3-201ENST00000164227 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.66■■■■□ 3.3
BCL3-201ENST00000164227 CCDC136Q96JN2 1154 aa35.66■■■■□ 3.3
BCL3-201ENST00000164227 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa35.65■■■■□ 3.3
BCL3-201ENST00000164227 TMF1P82094 1093 aa35.62■■■■□ 3.29
BCL3-201ENST00000164227 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa35.59■■■■□ 3.29
BCL3-201ENST00000164227 MADDQ8WXG6 1647 aa35.59■■■■□ 3.29
BCL3-201ENST00000164227 STAC3Q96MF2 364 aa35.59■■■■□ 3.29
BCL3-201ENST00000164227 TRPM2O94759 1503 aa35.59■■■■□ 3.29
BCL3-201ENST00000164227 IQGAP1P46940 1657 aa35.58■■■■□ 3.29
BCL3-201ENST00000164227 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP35.58■■■■□ 3.29
BCL3-201ENST00000164227 ERICH6Q7L0X2 663 aa35.57■■■■□ 3.28
BCL3-201ENST00000164227 CEP152O94986 1710 aa35.56■■■■□ 3.28
BCL3-201ENST00000164227 RRP1P56182 461 aaKnown RBP35.56■■■■□ 3.28
BCL3-201ENST00000164227 DEPDC5O75140 1603 aa35.56■■■■□ 3.28
BCL3-201ENST00000164227 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa35.55■■■■□ 3.28
BCL3-201ENST00000164227 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa35.53■■■■□ 3.28
BCL3-201ENST00000164227 PANK3Q9H999 370 aa35.53■■■■□ 3.28
BCL3-201ENST00000164227 PTPRTO14522 1441 aa35.53■■■■□ 3.28
BCL3-201ENST00000164227 RCAN3Q9UKA8 241 aa35.51■■■■□ 3.28
BCL3-201ENST00000164227 OSCARQ8IYS5 282 aa35.5■■■■□ 3.27
BCL3-201ENST00000164227 SCAPERQ9BY12 1400 aa35.49■■■■□ 3.27
BCL3-201ENST00000164227 TET3O43151 1660 aa35.48■■■■□ 3.27
BCL3-201ENST00000164227 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP35.48■■■■□ 3.27
BCL3-201ENST00000164227 NEURL4Q96JN8 1562 aa35.47■■■■□ 3.27
BCL3-201ENST00000164227 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa35.46■■■■□ 3.27
BCL3-201ENST00000164227 WDR7Q9Y4E6 1490 aa35.45■■■■□ 3.27
BCL3-201ENST00000164227 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP35.44■■■■□ 3.26
BCL3-201ENST00000164227 VWDEQ8N2E2 1590 aa35.43■■■■□ 3.26
BCL3-201ENST00000164227 CLTCL1P53675 1640 aa35.43■■■■□ 3.26
BCL3-201ENST00000164227 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa35.42■■■■□ 3.26
BCL3-201ENST00000164227 SYNMO15061 1565 aa35.42■■■■□ 3.26
BCL3-201ENST00000164227 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP35.41■■■■□ 3.26
BCL3-201ENST00000164227 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP35.4■■■■□ 3.26
BCL3-201ENST00000164227 ABCA9Q8IUA7 1624 aa35.39■■■■□ 3.26
BCL3-201ENST00000164227 CDCA8Q53HL2 280 aa35.39■■■■□ 3.26
BCL3-201ENST00000164227 ATP7AQ04656 1500 aa35.35■■■■□ 3.25
BCL3-201ENST00000164227 EXOC6Q8TAG9 804 aa35.33■■■■□ 3.25
BCL3-201ENST00000164227 KANK1Q14678 1352 aa35.33■■■■□ 3.25
BCL3-201ENST00000164227 MYT1LQ9UL68 1186 aa35.32■■■■□ 3.25
BCL3-201ENST00000164227 AFAP1Q8N556 730 aa35.31■■■■□ 3.24
BCL3-201ENST00000164227 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP35.3■■■■□ 3.24
BCL3-201ENST00000164227 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa35.29■■■■□ 3.24
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