RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000064724.7

CLDN11-201, Transcript of claudin 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLDN11, Length 2,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN11-201ENST00000064724 PLXNC1O60486 1568 aa23.72■■□□□ 1.39
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CLDN11-201ENST00000064724 CCDC144AA2RUR9 1427 aa23.69■■□□□ 1.38
CLDN11-201ENST00000064724 PLA2R1Q13018 1463 aa23.68■■□□□ 1.38
CLDN11-201ENST00000064724 MYO5CQ9NQX4 1742 aa23.68■■□□□ 1.38
CLDN11-201ENST00000064724 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa23.67■■□□□ 1.38
CLDN11-201ENST00000064724 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa23.66■■□□□ 1.38
CLDN11-201ENST00000064724 PLCH2O75038 1416 aa23.66■■□□□ 1.38
CLDN11-201ENST00000064724 PRAG1Q86YV5 1406 aa23.66■■□□□ 1.38
CLDN11-201ENST00000064724 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.65■■□□□ 1.38
CLDN11-201ENST00000064724 DUOX2Q9NRD8 1548 aa23.64■■□□□ 1.38
CLDN11-201ENST00000064724 IQGAP3Q86VI3 1631 aa23.64■■□□□ 1.38
CLDN11-201ENST00000064724 MAGI2Q86UL8 1455 aa23.63■■□□□ 1.37
CLDN11-201ENST00000064724 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.63■■□□□ 1.37
CLDN11-201ENST00000064724 ATP10AO60312 1499 aa23.62■■□□□ 1.37
CLDN11-201ENST00000064724 ERBINQ96RT1 1412 aa23.62■■□□□ 1.37
CLDN11-201ENST00000064724 GPRASP1Q5JY77 1395 aa23.61■■□□□ 1.37
CLDN11-201ENST00000064724 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
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CLDN11-201ENST00000064724 A2MP01023 1474 aa23.58■■□□□ 1.37
CLDN11-201ENST00000064724 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
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CLDN11-201ENST00000064724 LAMC1P11047 1609 aa23.54■■□□□ 1.36
CLDN11-201ENST00000064724 RGL3Q3MIN7 710 aa23.54■■□□□ 1.36
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CLDN11-201ENST00000064724 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
CLDN11-201ENST00000064724 ARAP3Q8WWN8 1544 aa23.51■■□□□ 1.35
CLDN11-201ENST00000064724 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.51■■□□□ 1.35
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CLDN11-201ENST00000064724 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
CLDN11-201ENST00000064724 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
CLDN11-201ENST00000064724 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa23.49■■□□□ 1.35
CLDN11-201ENST00000064724 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
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CLDN11-201ENST00000064724 TESK2Q96S53 571 aa23.45■■□□□ 1.35
CLDN11-201ENST00000064724 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
CLDN11-201ENST00000064724 RNF123Q5XPI4 1314 aa23.45■■□□□ 1.34
CLDN11-201ENST00000064724 PARD3Q8TEW0 1356 aa23.44■■□□□ 1.34
CLDN11-201ENST00000064724 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
CLDN11-201ENST00000064724 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
CLDN11-201ENST00000064724 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa23.43■■□□□ 1.34
CLDN11-201ENST00000064724 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23.4■■□□□ 1.34
CLDN11-201ENST00000064724 NLRP13Q86W25 1043 aa23.4■■□□□ 1.34
CLDN11-201ENST00000064724 DISP3Q9P2K9 1392 aa23.38■■□□□ 1.33
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CLDN11-201ENST00000064724 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
CLDN11-201ENST00000064724 WDR7Q9Y4E6 1490 aa23.36■■□□□ 1.33
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CLDN11-201ENST00000064724 ANP32EQ9BTT0 268 aa23.35■■□□□ 1.33
CLDN11-201ENST00000064724 TMF1P82094 1093 aa23.34■■□□□ 1.33
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CLDN11-201ENST00000064724 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa23.33■■□□□ 1.33
CLDN11-201ENST00000064724 ABCA9Q8IUA7 1624 aa23.31■■□□□ 1.32
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CLDN11-201ENST00000064724 INSRP06213 1382 aa23.3■■□□□ 1.32
CLDN11-201ENST00000064724 MADDQ8WXG6 1647 aa23.3■■□□□ 1.32
CLDN11-201ENST00000064724 VWDEQ8N2E2 1590 aa23.3■■□□□ 1.32
CLDN11-201ENST00000064724 PANK3Q9H999 370 aa23.29■■□□□ 1.32
CLDN11-201ENST00000064724 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
CLDN11-201ENST00000064724 FANCIQ9NVI1 1328 aa23.29■■□□□ 1.32
CLDN11-201ENST00000064724 ATP7AQ04656 1500 aa23.29■■□□□ 1.32
CLDN11-201ENST00000064724 SCAPERQ9BY12 1400 aa23.27■■□□□ 1.32
CLDN11-201ENST00000064724 TET3O43151 1660 aa23.27■■□□□ 1.32
CLDN11-201ENST00000064724 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.27■■□□□ 1.31
CLDN11-201ENST00000064724 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa23.25■■□□□ 1.31
CLDN11-201ENST00000064724 KANK1Q14678 1352 aa23.25■■□□□ 1.31
CLDN11-201ENST00000064724 CEP152O94986 1710 aa23.25■■□□□ 1.31
CLDN11-201ENST00000064724 PDE3BQ13370 1112 aa23.24■■□□□ 1.31
CLDN11-201ENST00000064724 CLTCL1P53675 1640 aa23.24■■□□□ 1.31
CLDN11-201ENST00000064724 NEURL4Q96JN8 1562 aa23.24■■□□□ 1.31
CLDN11-201ENST00000064724 IQGAP1P46940 1657 aa23.23■■□□□ 1.31
CLDN11-201ENST00000064724 ADGRL1O94910 1474 aa23.22■■□□□ 1.31
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CLDN11-201ENST00000064724 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
CLDN11-201ENST00000064724 ASXL2Q76L83 1435 aa23.18■■□□□ 1.3
CLDN11-201ENST00000064724 MROH1Q8NDA8 1641 aa23.17■■□□□ 1.3
CLDN11-201ENST00000064724 MSH5O43196 834 aa23.15■■□□□ 1.3
CLDN11-201ENST00000064724 CCDC136Q96JN2 1154 aa23.15■■□□□ 1.3
CLDN11-201ENST00000064724 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa23.14■■□□□ 1.3
CLDN11-201ENST00000064724 RRP1P56182 461 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
CLDN11-201ENST00000064724 RCAN3Q9UKA8 241 aa23.13■■□□□ 1.29
CLDN11-201ENST00000064724 SYNMO15061 1565 aa23.12■■□□□ 1.29
CLDN11-201ENST00000064724 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
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