RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000107060.7

Eftud2-202, Transcript of 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Eftud2, Length 3,339 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Prdm16A2A935 1275 aa20.92■□□□□ 0.94
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cdk13Q69ZA1 1511 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Clstn2Q9ER65 966 aa20.9■□□□□ 0.94
Eftud2-202ENSMUST00000107060 PtprtQ99M80 1454 aa20.9■□□□□ 0.94
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cep170Q6A065 1588 aa20.9■□□□□ 0.94
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Polr3aB2RXC6 1390 aa20.9■□□□□ 0.94
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Atp7aQ64430 1491 aa20.89■□□□□ 0.93
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tarbp1E9Q368 1579 aa20.89■□□□□ 0.93
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Usp54Q8BL06 1588 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Kif1bQ60575 1816 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Plekhg5Q66T02 1073 aa20.87■□□□□ 0.93
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cd109Q8R422 1442 aa20.87■□□□□ 0.93
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rrp7aQ9D1C9 280 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Znf710Q3U288 666 aa20.85■□□□□ 0.93
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Setd1aE9PYH6 1716 aa20.85■□□□□ 0.93
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Myo5cE9Q1F5 1742 aa20.85■□□□□ 0.93
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Csrnp3P59055 597 aa20.84■□□□□ 0.93
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cwc22Q8C5N3 908 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rgl3Q3UYI5 709 aa20.83■□□□□ 0.93
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa20.83■□□□□ 0.92
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Stra8P70278 393 aa20.82■□□□□ 0.92
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Adamts13Q769J6 1426 aa20.82■□□□□ 0.92
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tubgcp6G5E8P0 1769 aa20.82■□□□□ 0.92
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Nos1Q9Z0J4 1429 aa20.8■□□□□ 0.92
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tmem131lQ3U3D7 1597 aa20.8■□□□□ 0.92
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Spag9Q58A65 1321 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fndc1E9Q043 1732 aa20.79■□□□□ 0.92
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Washc2Q6PGL7 1334 aa20.78■□□□□ 0.92
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Edc4Q3UJB9 1406 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm13695A2AK44 830 aa20.77■□□□□ 0.92
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rundc1Q0VDN7 615 aa20.77■□□□□ 0.92
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tnnt3Q9QZ47 272 aa20.75■□□□□ 0.91
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rock2P70336 1388 aa20.75■□□□□ 0.91
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Uggt2E9Q4X2 1504 aa20.73■□□□□ 0.91
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Map3k5O35099 1380 aa20.72■□□□□ 0.91
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pde4cQ3UEI1 686 aa20.72■□□□□ 0.91
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Topbp1Q6ZQF0 1515 aa20.72■□□□□ 0.91
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Card11Q8CIS0 1159 aa20.71■□□□□ 0.91
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Kdm5cP41230 1554 aa20.71■□□□□ 0.91
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Nsd2Q8BVE8 1365 aa20.7■□□□□ 0.91
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Znf518aB2RRF6 1478 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Aplp2Q06335 707 aa20.69■□□□□ 0.9
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tulp4Q9JIL5 1547 aa20.69■□□□□ 0.9
Eftud2-202ENSMUST00000107060 AnkarA2RT91 1465 aa20.68■□□□□ 0.9
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ylpm1Q9R0I7 1386 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Plch2A2AP18 1501 aa20.66■□□□□ 0.9
Eftud2-202ENSMUST00000107060 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa20.66■□□□□ 0.9
Eftud2-202ENSMUST00000107060 AglF8VPN4 1532 aa20.64■□□□□ 0.9
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Abca6Q8K441 1624 aa20.64■□□□□ 0.9
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Hnrnpul2Q00PI9 745 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Iqgap3F8VQ29 1632 aa20.64■□□□□ 0.89
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Kiaa0556Q8C753 1610 aa20.64■□□□□ 0.89
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Trpm1Q2TV84 1622 aa20.63■□□□□ 0.89
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Abca8aQ8K442 1620 aa20.63■□□□□ 0.89
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Grwd1Q810D6 446 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Prdm2A2A7B5 1709 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
Eftud2-202ENSMUST00000107060 PnisrA2AJT4 805 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Atp10aO54827 1508 aa20.62■□□□□ 0.89
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa20.61■□□□□ 0.89
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Prex1Q69ZK0 1650 aa20.6■□□□□ 0.89
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Abcc6Q9R1S7 1498 aa20.6■□□□□ 0.89
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Slc4a2P13808 1237 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Depdc5P61460 1591 aa20.59■□□□□ 0.89
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pola1P33609 1465 aa20.58■□□□□ 0.89
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cdc42bpgQ80UW5 1551 aa20.57■□□□□ 0.88
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cep152A2AUM9 1736 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Akap12Q9WTQ5 1684 aa20.56■□□□□ 0.88
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Exoc6Q8R313 802 aa20.55■□□□□ 0.88
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ak9G3UYQ4 1894 aa20.55■□□□□ 0.88
Eftud2-202ENSMUST00000107060 OvosQ3UU35 1456 aa20.54■□□□□ 0.88
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ehbp1l1Q99MS7 1716 aa20.54■□□□□ 0.88
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Lemd3Q9WU40 921 aa20.53■□□□□ 0.88
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Clasp1Q80TV8 1535 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa20.52■□□□□ 0.88
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mrs2Q5NCE8 434 aa20.52■□□□□ 0.87
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Wwc2Q6NXJ0 1187 aa20.51■□□□□ 0.87
Eftud2-202ENSMUST00000107060 AdgbG3UZ78 1657 aa20.51■□□□□ 0.87
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Adgrb3Q80ZF8 1522 aa20.51■□□□□ 0.87
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tecpr2Q3UH45 1423 aa20.5■□□□□ 0.87
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Zmym4A2A791 1549 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Col17a1Q07563 1470 aa20.5■□□□□ 0.87
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Itsn2Q9Z0R6 1659 aa20.49■□□□□ 0.87
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rims1Q99NE5 1463 aa20.49■□□□□ 0.87
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ttc21bQ0HA38 1315 aa20.49■□□□□ 0.87
Eftud2-202ENSMUST00000107060 RereQ80TZ9 1558 aa20.48■□□□□ 0.87
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ino80Q6ZPV2 1559 aa20.48■□□□□ 0.87
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Sbno1Q689Z5 1390 aa20.48■□□□□ 0.87
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cul9Q80TT8 1865 aa20.48■□□□□ 0.87
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ifit1bl1D3Z6F0 470 aa20.47■□□□□ 0.87
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cdk5rap2Q8K389 1822 aa20.47■□□□□ 0.87
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Arid3cA6PWV5 409 aa20.47■□□□□ 0.87
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Sipa1l1Q8C0T5 1782 aa20.47■□□□□ 0.87
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Efcab6Q6P1E8 1516 aa20.46■□□□□ 0.87
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Kif3bQ61771 747 aa20.46■□□□□ 0.87
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa20.46■□□□□ 0.87
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gli2Q0VGT2 1544 aa20.46■□□□□ 0.87
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Dip2cE9PWR4 1557 aa20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 13.2 ms