RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000062829.8

Hoxa6-201, Transcript of Homeobox protein Hox-A6, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxa6, Length 874 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Knl1Q66JQ7 1612 aa25.87■■□□□ 1.73
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Topbp1Q6ZQF0 1515 aa25.87■■□□□ 1.73
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 3425401B19RikD3Z1D3 1412 aa25.87■■□□□ 1.73
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 RictorQ6QI06 1708 aa25.86■■□□□ 1.73
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Naip5Q9R016 1403 aa25.86■■□□□ 1.73
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Dip2aQ8BWT5 1523 aa25.83■■□□□ 1.72
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Med14A2ABV5 1459 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Abca17E9PX95 1733 aa25.82■■□□□ 1.72
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Topaz1E5FYH1 1653 aa25.81■■□□□ 1.72
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 GphnQ8BUV3 769 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Gm13697A2AK42 830 aa25.79■■□□□ 1.72
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Fbxo41Q6NS60 873 aa25.78■■□□□ 1.72
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Chic2Q9D9G3 165 aa25.78■■□□□ 1.72
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Arhgap23Q69ZH9 1483 aa25.75■■□□□ 1.71
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ssh2Q5SW75 1423 aa25.73■■□□□ 1.71
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Adgrb2Q8CGM1 1561 aa25.73■■□□□ 1.71
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Vps8Q0P5W1 1427 aa25.72■■□□□ 1.71
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Kdm3bQ6ZPY7 1562 aa25.72■■□□□ 1.71
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Usp54Q8BL06 1588 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 NclP09405 707 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Scn4aQ9ER60 1841 aa25.71■■□□□ 1.71
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa25.69■■□□□ 1.7
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Pip4k2bQ80XI4 416 aa25.68■■□□□ 1.7
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Hfm1D3Z4R1 1434 aa25.68■■□□□ 1.7
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Pde4cQ3UEI1 686 aa25.66■■□□□ 1.7
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Hnrnpul2Q00PI9 745 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Abcc6Q9R1S7 1498 aa25.65■■□□□ 1.7
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ncoa1P70365 1447 aa25.63■■□□□ 1.69
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 UacaQ8CGB3 1411 aa25.63■■□□□ 1.69
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Clstn2Q9ER65 966 aa25.62■■□□□ 1.69
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Adamts7Q68SA9 1657 aa25.61■■□□□ 1.69
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 ShprhQ7TPQ3 1674 aa25.61■■□□□ 1.69
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Myo5cE9Q1F5 1742 aa25.61■■□□□ 1.69
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Kif1bQ60575 1816 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Rimbp3Q3V0F0 1606 aa25.55■■□□□ 1.68
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ltbp4Q8K4G1 1666 aa25.55■■□□□ 1.68
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Rfx7F8VPJ6 1459 aa25.54■■□□□ 1.68
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Prex1Q69ZK0 1650 aa25.53■■□□□ 1.68
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Scaf11E9PZM7 1456 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Fhad1A6PWD2 1420 aa25.49■■□□□ 1.67
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 UbtfP25976 765 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Phlpp1Q8CHE4 1687 aa25.48■■□□□ 1.67
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Robo2Q7TPD3 1470 aa25.48■■□□□ 1.67
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ttc21bQ0HA38 1315 aa25.48■■□□□ 1.67
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Map4P27546 1125 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Rapgef3Q8VCC8 918 aa25.47■■□□□ 1.67
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Nup155Q99P88 1391 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.67
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 DroshaQ5HZJ0 1373 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Chd2E9PZM4 1827 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ylpm1Q9R0I7 1386 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Kdm5aQ3UXZ9 1690 aa25.43■■□□□ 1.66
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Akap12Q9WTQ5 1684 aa25.4■■□□□ 1.66
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Rims2Q9EQZ7 1530 aa25.4■■□□□ 1.66
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Arid4bA2CG63 1314 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Adgrb3Q80ZF8 1522 aa25.39■■□□□ 1.66
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 AlkP97793 1621 aa25.38■■□□□ 1.65
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Mia2Q91ZV0 1396 aa25.36■■□□□ 1.65
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Myom3A2ABU4 1439 aa25.36■■□□□ 1.65
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Nsd2Q8BVE8 1365 aa25.35■■□□□ 1.65
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 AnkarA2RT91 1465 aa25.34■■□□□ 1.65
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Skint5A7XUY5 1461 aa25.34■■□□□ 1.65
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 PzpQ61838 1495 aa25.34■■□□□ 1.65
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Tmem131lQ3U3D7 1597 aa25.33■■□□□ 1.65
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Zfp644E9QA22 1323 aa25.32■■□□□ 1.64
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Iqsec2Q5DU25 1478 aa25.31■■□□□ 1.64
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Asxl1P59598 1514 aa25.29■■□□□ 1.64
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Txndc2Q6P902 515 aa25.29■■□□□ 1.64
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Gli3Q61602 1583 aa25.29■■□□□ 1.64
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ube2uB1AUC4 352 aa25.28■■□□□ 1.64
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Lamc1P02468 1607 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Gemin5Q8BX17 1502 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ttll5Q8CHB8 1328 aa25.25■■□□□ 1.63
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Nrxn3Q6P9K9 1571 aa25.25■■□□□ 1.63
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Cd109Q8R422 1442 aa25.23■■□□□ 1.63
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Iqgap1Q9JKF1 1657 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Hspa1lP16627 641 aa25.22■■□□□ 1.63
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Efcab6Q6P1E8 1516 aa25.22■■□□□ 1.63
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Tecpr2Q3UH45 1423 aa25.21■■□□□ 1.63
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ino80Q6ZPV2 1559 aa25.21■■□□□ 1.63
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 PtprgQ05909 1442 aa25.2■■□□□ 1.63
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Itsn1Q9Z0R4 1714 aa25.2■■□□□ 1.63
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Kif13aQ9EQW7 1749 aa25.2■■□□□ 1.62
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Lmtk3Q5XJV6 1424 aa25.2■■□□□ 1.62
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Tarbp1E9Q368 1579 aa25.19■■□□□ 1.62
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Naip7Q9JIB3 1402 aa25.19■■□□□ 1.62
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Psme1P97371 249 aa25.17■■□□□ 1.62
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Ecm2Q5FW85 670 aa25.17■■□□□ 1.62
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Trak1Q6PD31 939 aa25.16■■□□□ 1.62
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Erich6D3Z6S9 713 aa25.15■■□□□ 1.62
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Uggt1Q6P5E4 1551 aa25.14■■□□□ 1.62
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Zc3h13E9Q784 1729 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Gm13695A2AK44 830 aa25.12■■□□□ 1.61
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 P3h3Q8CG70 732 aa25.11■■□□□ 1.61
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Stk24Q99KH8 431 aa25.11■■□□□ 1.61
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa25.11■■□□□ 1.61
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Med1Q925J9 1575 aa25.1■■□□□ 1.61
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Iqgap3F8VQ29 1632 aa25.1■■□□□ 1.61
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 Tubgcp6G5E8P0 1769 aa25.1■■□□□ 1.61
Hoxa6-201ENSMUST00000062829 PalldQ9ET54 1408 aa25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 19.3 ms