RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000054930.6

Ptx4-201, Transcript of Pentraxin-4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptx4, Length 1,582 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Supt6hQ62383 1726 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Gli2Q0VGT2 1544 aa20.36■□□□□ 0.85
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Kif14L0N7N1 1674 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Kif3bQ61771 747 aa20.35■□□□□ 0.85
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Adamtsl3G3UXC7 1706 aa20.35■□□□□ 0.85
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Mphosph9A6H5Y1 991 aa20.34■□□□□ 0.85
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Plch2A2AP18 1501 aa20.34■□□□□ 0.85
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Pde4cQ3UEI1 686 aa20.34■□□□□ 0.85
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Myo5cE9Q1F5 1742 aa20.33■□□□□ 0.85
Ptx4-201ENSMUST00000054930 NpatQ8BMA5 1420 aa20.33■□□□□ 0.85
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Map4P27546 1125 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Kif21bQ9QXL1 1668 aa20.32■□□□□ 0.84
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Kif1bQ60575 1816 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Cfap65Q3V0B4 1847 aa20.31■□□□□ 0.84
Ptx4-201ENSMUST00000054930 PtprgQ05909 1442 aa20.3■□□□□ 0.84
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ube2uB1AUC4 352 aa20.28■□□□□ 0.84
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa20.27■□□□□ 0.84
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Tmem131lQ3U3D7 1597 aa20.26■□□□□ 0.83
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Clstn2Q9ER65 966 aa20.26■□□□□ 0.83
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ankrd36D3Z4K0 1415 aa20.26■□□□□ 0.83
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Naip5Q9R016 1403 aa20.24■□□□□ 0.83
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Eid3Q3V124 375 aa20.24■□□□□ 0.83
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Abca6Q8K441 1624 aa20.24■□□□□ 0.83
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Prex1Q69ZK0 1650 aa20.23■□□□□ 0.83
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Alpk3Q924C5 1678 aa20.23■□□□□ 0.83
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Trak1Q6PD31 939 aa20.22■□□□□ 0.83
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Camsap2Q8C1B1 1461 aa20.21■□□□□ 0.83
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Plppr3Q7TPB0 716 aa20.2■□□□□ 0.82
Ptx4-201ENSMUST00000054930 AnkarA2RT91 1465 aa20.19■□□□□ 0.82
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Cd109Q8R422 1442 aa20.19■□□□□ 0.82
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Dhx9O70133 1380 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Pkd2O35245 966 aa20.18■□□□□ 0.82
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Myom3A2ABU4 1439 aa20.18■□□□□ 0.82
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Afap1Q80YS6 731 aa20.17■□□□□ 0.82
Ptx4-201ENSMUST00000054930 NefmP08553 848 aa20.16■□□□□ 0.82
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Hnrnpul2Q00PI9 745 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ylpm1Q9R0I7 1386 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Atp7aQ64430 1491 aa20.15■□□□□ 0.82
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ttc21bQ0HA38 1315 aa20.14■□□□□ 0.82
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Arhgap23Q69ZH9 1483 aa20.14■□□□□ 0.81
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Adamts7Q68SA9 1657 aa20.13■□□□□ 0.81
Ptx4-201ENSMUST00000054930 RictorQ6QI06 1708 aa20.12■□□□□ 0.81
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Nsd2Q8BVE8 1365 aa20.11■□□□□ 0.81
Ptx4-201ENSMUST00000054930 CltcQ68FD5 1675 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Hspa5P20029 655 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Edc4Q3UJB9 1406 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Pik3c2gO70167 1506 aa20.08■□□□□ 0.81
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Myom2Q14BI5 1463 aa20.08■□□□□ 0.8
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Tarbp1E9Q368 1579 aa20.07■□□□□ 0.8
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Rprd2Q6NXI6 1469 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Dot1lQ6XZL8 1540 aa20.06■□□□□ 0.8
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Knl1Q66JQ7 1612 aa20.06■□□□□ 0.8
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Akap12Q9WTQ5 1684 aa20.05■□□□□ 0.8
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Tecpr2Q3UH45 1423 aa20.04■□□□□ 0.8
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Talpid3E9PV87 1520 aa20.04■□□□□ 0.8
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Rsph4aQ8BYM7 716 aa20.03■□□□□ 0.8
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Iqgap3F8VQ29 1632 aa20.03■□□□□ 0.8
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ino80Q6ZPV2 1559 aa20.02■□□□□ 0.8
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Med14A2ABV5 1459 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Hfm1D3Z4R1 1434 aa20.01■□□□□ 0.79
Ptx4-201ENSMUST00000054930 DroshaQ5HZJ0 1373 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Prdm2A2A7B5 1709 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Usp47Q8BY87 1376 aa20■□□□□ 0.79
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ppip5k1A2ARP1 1436 aa19.98■□□□□ 0.79
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Abca8aQ8K442 1620 aa19.96■□□□□ 0.79
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Dip2bQ3UH60 1574 aa19.95■□□□□ 0.78
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Rock1P70335 1354 aa19.95■□□□□ 0.78
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Sall3Q62255 1320 aa19.93■□□□□ 0.78
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Washc2Q6PGL7 1334 aa19.93■□□□□ 0.78
Ptx4-201ENSMUST00000054930 TonslQ6NZL6 1363 aa19.91■□□□□ 0.78
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ahdc1Q6PAL7 1594 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Skint5A7XUY5 1461 aa19.91■□□□□ 0.78
Ptx4-201ENSMUST00000054930 AatkQ80YE4 1365 aa19.91■□□□□ 0.78
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Safb2Q80YR5 991 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Adgrb3Q80ZF8 1522 aa19.91■□□□□ 0.78
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ercc6l2Q9JIM3 1537 aa19.91■□□□□ 0.78
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa19.9■□□□□ 0.78
Ptx4-201ENSMUST00000054930 MlecQ6ZQI3 291 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Adamts13Q769J6 1426 aa19.89■□□□□ 0.77
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Ehbp1l1Q99MS7 1716 aa19.89■□□□□ 0.77
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Efcab6Q6P1E8 1516 aa19.88■□□□□ 0.77
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Itsn1Q9Z0R4 1714 aa19.88■□□□□ 0.77
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Uggt1Q6P5E4 1551 aa19.88■□□□□ 0.77
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Abcc6Q9R1S7 1498 aa19.87■□□□□ 0.77
Ptx4-201ENSMUST00000054930 ErbinQ80TH2 1402 aa19.86■□□□□ 0.77
Ptx4-201ENSMUST00000054930 4930407I10RikD3Z5T8 1512 aa19.86■□□□□ 0.77
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Erich6D3Z6S9 713 aa19.86■□□□□ 0.77
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Mroh1E0CZ22 1640 aa19.85■□□□□ 0.77
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Kif13aQ9EQW7 1749 aa19.85■□□□□ 0.77
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Bcl9Q9D219 1425 aa19.85■□□□□ 0.77
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Stk24Q99KH8 431 aa19.84■□□□□ 0.77
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Chd2E9PZM4 1827 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
Ptx4-201ENSMUST00000054930 PtprmP28828 1452 aa19.84■□□□□ 0.77
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Rgl3Q3UYI5 709 aa19.83■□□□□ 0.76
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Tulp4Q9JIL5 1547 aa19.81■□□□□ 0.76
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Iqgap1Q9JKF1 1657 aaKnown RBP19.8■□□□□ 0.76
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Mbd5B1AYB6 1498 aa19.8■□□□□ 0.76
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa19.8■□□□□ 0.76
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Kdm5aQ3UXZ9 1690 aa19.79■□□□□ 0.76
Ptx4-201ENSMUST00000054930 Naip7Q9JIB3 1402 aa19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 15.1 ms