RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000054099.15

Lhx3-202, Transcript of LIM/homeobox protein Lhx3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Lhx3, Length 2,184 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Neurl4Q5NCX5 1563 aa22.42■■□□□ 1.18
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Atp10aO54827 1508 aa22.42■■□□□ 1.18
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Adgrl2Q8JZZ7 1487 aa22.41■■□□□ 1.18
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Ssh2Q5SW75 1423 aa22.37■■□□□ 1.17
Lhx3-202ENSMUST00000054099 NclP09405 707 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Abca17E9PX95 1733 aa22.37■■□□□ 1.17
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Nos1Q9Z0J4 1429 aa22.36■■□□□ 1.17
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Zfp644E9QA22 1323 aa22.35■■□□□ 1.17
Lhx3-202ENSMUST00000054099 AlkP97793 1621 aa22.35■■□□□ 1.17
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Cfap65Q3V0B4 1847 aa22.35■■□□□ 1.17
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa22.35■■□□□ 1.17
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Ccdc9Q8VC31 543 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
Lhx3-202ENSMUST00000054099 ClspnQ80YR7 1315 aa22.34■■□□□ 1.17
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Ube2uB1AUC4 352 aa22.33■■□□□ 1.17
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Anp32aO35381 247 aa22.33■■□□□ 1.17
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Prdm16A2A935 1275 aa22.32■■□□□ 1.16
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Fhod3Q76LL6 1578 aa22.32■■□□□ 1.16
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Kif14L0N7N1 1674 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Cdc42bpgQ80UW5 1551 aa22.31■■□□□ 1.16
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Usp54Q8BL06 1588 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Spag9Q58A65 1321 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Gli2Q0VGT2 1544 aa22.27■■□□□ 1.16
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Znf518aB2RRF6 1478 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Gtf3c3Q3TMP1 882 aa22.27■■□□□ 1.16
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Trpm1Q2TV84 1622 aa22.26■■□□□ 1.15
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Supt6hQ62383 1726 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
Lhx3-202ENSMUST00000054099 ShprhQ7TPQ3 1674 aa22.24■■□□□ 1.15
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Kif3bQ61771 747 aa22.23■■□□□ 1.15
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Myo5cE9Q1F5 1742 aa22.22■■□□□ 1.15
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Zmym4A2A791 1549 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Trpm2Q91YD4 1506 aa22.22■■□□□ 1.15
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Kif1bQ60575 1816 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
Lhx3-202ENSMUST00000054099 NpatQ8BMA5 1420 aa22.21■■□□□ 1.15
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Naip6Q9JIB6 1403 aa22.21■■□□□ 1.15
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Asxl1P59598 1514 aa22.21■■□□□ 1.15
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Nup155Q99P88 1391 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Topbp1Q6ZQF0 1515 aa22.19■■□□□ 1.14
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Adamtsl3G3UXC7 1706 aa22.18■■□□□ 1.14
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Plch2A2AP18 1501 aa22.16■■□□□ 1.14
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa22.16■■□□□ 1.14
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Map4P27546 1125 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Hnrnpul2Q00PI9 745 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Alpk3Q924C5 1678 aa22.14■■□□□ 1.13
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Ttll5Q8CHB8 1328 aa22.13■■□□□ 1.13
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Uggt2E9Q4X2 1504 aa22.13■■□□□ 1.13
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Kif21bQ9QXL1 1668 aa22.13■■□□□ 1.13
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Eid3Q3V124 375 aa22.12■■□□□ 1.13
Lhx3-202ENSMUST00000054099 BccipQ9CWI3 316 aa22.12■■□□□ 1.13
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Abca6Q8K441 1624 aa22.12■■□□□ 1.13
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Lamc1P02468 1607 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Pde4cQ3UEI1 686 aa22.1■■□□□ 1.13
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Prex1Q69ZK0 1650 aa22.1■■□□□ 1.13
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Mphosph9A6H5Y1 991 aa22.09■■□□□ 1.13
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Gtf3c5Q8R2T8 520 aa22.08■■□□□ 1.12
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Upf2A2AT37 1269 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Wdr66E9Q743 1299 aa22.06■■□□□ 1.12
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Robo2Q7TPD3 1470 aa22.05■■□□□ 1.12
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Ccer2J3QPU5 274 aa22.05■■□□□ 1.12
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Irx3P81067 507 aa22.05■■□□□ 1.12
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Trak1Q6PD31 939 aa22.05■■□□□ 1.12
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Camsap2Q8C1B1 1461 aa22.04■■□□□ 1.12
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Afap1Q80YS6 731 aa22.04■■□□□ 1.12
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Clstn2Q9ER65 966 aa22.04■■□□□ 1.12
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Naip5Q9R016 1403 aa22.03■■□□□ 1.12
Lhx3-202ENSMUST00000054099 CltcQ68FD5 1675 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Plcd4Q8K3R3 807 aa22.02■■□□□ 1.12
Lhx3-202ENSMUST00000054099 SafbD3YXK2 937 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Ipo4Q8VI75 1082 aa22.01■■□□□ 1.11
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Cd109Q8R422 1442 aa22■■□□□ 1.11
Lhx3-202ENSMUST00000054099 PtprgQ05909 1442 aa21.99■■□□□ 1.11
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Tmem131lQ3U3D7 1597 aa21.98■■□□□ 1.11
Lhx3-202ENSMUST00000054099 MlecQ6ZQI3 291 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Dhx9O70133 1380 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
Lhx3-202ENSMUST00000054099 RictorQ6QI06 1708 aa21.96■■□□□ 1.11
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Ankrd36D3Z4K0 1415 aa21.96■■□□□ 1.11
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Myom3A2ABU4 1439 aa21.95■■□□□ 1.1
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Pkd2O35245 966 aa21.95■■□□□ 1.1
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Safb2Q80YR5 991 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Atp7aQ64430 1491 aa21.92■■□□□ 1.1
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Prdm2A2A7B5 1709 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
Lhx3-202ENSMUST00000054099 AnkarA2RT91 1465 aa21.92■■□□□ 1.1
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Ylpm1Q9R0I7 1386 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Nsd2Q8BVE8 1365 aa21.9■■□□□ 1.1
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Ttc21bQ0HA38 1315 aa21.89■■□□□ 1.09
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Adamts7Q68SA9 1657 aa21.88■■□□□ 1.09
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Myom2Q14BI5 1463 aa21.88■■□□□ 1.09
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Akap12Q9WTQ5 1684 aa21.87■■□□□ 1.09
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Arhgap23Q69ZH9 1483 aa21.87■■□□□ 1.09
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Hspa5P20029 655 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Erich6D3Z6S9 713 aa21.85■■□□□ 1.09
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Iqgap3F8VQ29 1632 aa21.85■■□□□ 1.09
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Ccdc27Q3V036 639 aa21.84■■□□□ 1.09
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Knl1Q66JQ7 1612 aa21.83■■□□□ 1.09
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Talpid3E9PV87 1520 aa21.83■■□□□ 1.09
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Dot1lQ6XZL8 1540 aa21.83■■□□□ 1.09
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Tarbp1E9Q368 1579 aa21.83■■□□□ 1.09
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Hfm1D3Z4R1 1434 aa21.81■■□□□ 1.08
Lhx3-202ENSMUST00000054099 Ino80Q6ZPV2 1559 aa21.8■■□□□ 1.08
Lhx3-202ENSMUST00000054099 MyclP10166 368 aa21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 61.8 ms