RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000049241.8

Hoxb4-201, Transcript of Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxb4, Length 2,566 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 PtprgQ05909 1442 aa23.55■■□□□ 1.36
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa23.54■■□□□ 1.36
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Supt16hQ920B9 1047 aa23.53■■□□□ 1.36
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 AknaQ80VW7 1404 aa23.52■■□□□ 1.36
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Polr3aB2RXC6 1390 aa23.52■■□□□ 1.36
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Ofd1Q80Z25 1017 aa23.5■■□□□ 1.35
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Rrp7aQ9D1C9 280 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Gm32742A0A1B0GT42 1604 aa23.5■■□□□ 1.35
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Trappc8E9PWG2 1437 aa23.49■■□□□ 1.35
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Arhgap5P97393 1501 aa23.48■■□□□ 1.35
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Rock1P70335 1354 aa23.48■■□□□ 1.35
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Rock2P70336 1388 aa23.48■■□□□ 1.35
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Cd109Q8R422 1442 aa23.43■■□□□ 1.34
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Rnf17Q99MV7 1640 aa23.43■■□□□ 1.34
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Atp7aQ64430 1491 aa23.42■■□□□ 1.34
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Mast1Q9R1L5 1570 aa23.42■■□□□ 1.34
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Clstn2Q9ER65 966 aa23.42■■□□□ 1.34
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Sart1Q9Z315 806 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 L3mbtl2P59178 703 aa23.41■■□□□ 1.34
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Fgd6Q69ZL1 1399 aa23.4■■□□□ 1.34
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Pdcd11Q6NS46 1862 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Tarbp1E9Q368 1579 aa23.38■■□□□ 1.33
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Zbtb4Q5F293 982 aa23.38■■□□□ 1.33
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Tubgcp6G5E8P0 1769 aa23.37■■□□□ 1.33
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa23.37■■□□□ 1.33
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Kdm5cP41230 1554 aa23.36■■□□□ 1.33
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Setd1aE9PYH6 1716 aa23.35■■□□□ 1.33
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Rpgrip1lQ8CG73 1264 aa23.35■■□□□ 1.33
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Neurl4Q5NCX5 1563 aa23.34■■□□□ 1.33
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Gm14025A2AP89 1413 aa23.33■■□□□ 1.33
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Cfap74Q3UY96 1578 aa23.33■■□□□ 1.33
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Liat1Q810M6 228 aa23.32■■□□□ 1.32
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Cdc42bpbQ7TT50 1713 aa23.31■■□□□ 1.32
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Ifit1bl1D3Z6F0 470 aa23.29■■□□□ 1.32
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Hecw1Q8K4P8 1604 aa23.29■■□□□ 1.32
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Kcnh8P59111 1102 aa23.28■■□□□ 1.32
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Rtl5Q5DTT4 599 aa23.28■■□□□ 1.32
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Ppip5k1A2ARP1 1436 aa23.28■■□□□ 1.32
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 NhsB1AV60 1647 aa23.28■■□□□ 1.32
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Adamts13Q769J6 1426 aa23.27■■□□□ 1.32
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Pak3Q61036 559 aa23.27■■□□□ 1.32
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Slc4a3P16283 1227 aa23.27■■□□□ 1.32
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Spag9Q58A65 1321 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.31
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Abcc3B2RX12 1523 aa23.26■■□□□ 1.31
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Q7TT23 1179 aa23.25■■□□□ 1.31
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Erbb3Q61526 1339 aa23.25■■□□□ 1.31
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Zscan21Q07231 555 aa23.24■■□□□ 1.31
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa23.24■■□□□ 1.31
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 AI481877A2ALV5 1481 aa23.24■■□□□ 1.31
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Robo2Q7TPD3 1470 aa23.24■■□□□ 1.31
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Kiaa1210E9Q0C6 1637 aa23.23■■□□□ 1.31
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Cep170Q6A065 1588 aa23.22■■□□□ 1.31
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Kank1E9Q238 1360 aa23.21■■□□□ 1.31
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 PrxO55103 1391 aa23.21■■□□□ 1.31
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Pde4cQ3UEI1 686 aa23.21■■□□□ 1.31
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Zfp444Q3TDV8 331 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Pank3Q8R2W9 370 aa23.21■■□□□ 1.31
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Edc4Q3UJB9 1406 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Map3k5O35099 1380 aa23.2■■□□□ 1.31
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Chd1P40201 1711 aa23.18■■□□□ 1.3
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Prdm16A2A935 1275 aa23.18■■□□□ 1.3
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Abca8bQ8K440 1620 aa23.18■■□□□ 1.3
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Mak16Q8BGS0 296 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Inpp5dQ9ES52 1191 aa23.18■■□□□ 1.3
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Mroh3A0A1D5RM54 893 aa23.16■■□□□ 1.3
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Abcc1O35379 1528 aa23.16■■□□□ 1.3
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Egfem1Q8C088 590 aa23.16■■□□□ 1.3
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Tulp4Q9JIL5 1547 aa23.16■■□□□ 1.3
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Atp10dQ8K2X1 1416 aa23.16■■□□□ 1.3
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Usp54Q8BL06 1588 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Plch2A2AP18 1501 aa23.15■■□□□ 1.3
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 ShprhQ7TPQ3 1674 aa23.15■■□□□ 1.3
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Kif1bQ60575 1816 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Kidins220E9Q9B7 1793 aa23.13■■□□□ 1.29
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Zmym4A2A791 1549 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Zscan10Q3URR7 782 aa23.11■■□□□ 1.29
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Abca17E9PX95 1733 aa23.1■■□□□ 1.29
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Znf608Q56A10 1511 aa23.1■■□□□ 1.29
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Tcerg1Q8CGF7 1100 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Erich6D3Z6S9 713 aa23.08■■□□□ 1.29
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Nsd2Q8BVE8 1365 aa23.08■■□□□ 1.28
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Xrn1P97789 1719 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Tex14Q7M6U3 1450 aa23.07■■□□□ 1.28
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Tmf1B9EKI3 1091 aa23.06■■□□□ 1.28
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Sbno1Q689Z5 1390 aa23.05■■□□□ 1.28
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Sall3Q62255 1320 aa23.05■■□□□ 1.28
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Abcc6Q9R1S7 1498 aa23.04■■□□□ 1.28
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Mink1Q9JM52 1308 aa23.04■■□□□ 1.28
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Upf2A2AT37 1269 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Kdm2aP59997 1161 aa23.03■■□□□ 1.28
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Srcin1Q9QWI6 1250 aa23.03■■□□□ 1.28
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Slc4a1apE9PX68 744 aa23.03■■□□□ 1.28
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa23.02■■□□□ 1.28
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Gm16486A0A1D5RMD1 1434 aa23.01■■□□□ 1.27
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Esx1O88933 382 aa23■■□□□ 1.27
Hoxb4-201ENSMUST00000049241 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 86.3 ms